More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0063 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0063  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
379 aa  746    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3465  iron-containing alcohol dehydrogenase  84.88 
 
 
377 aa  599  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.117346  normal  0.139258 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.76 
 
 
377 aa  454  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6426  Iron-containing alcohol dehydrogenase  57.61 
 
 
376 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2655  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  56.4 
 
 
382 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1435  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  55.87 
 
 
382 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0905  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  55.87 
 
 
382 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631296  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1646  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  56.14 
 
 
382 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627044  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1823  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  55.87 
 
 
382 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0445  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  55.87 
 
 
382 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1668  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  55.87 
 
 
382 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0717  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  55.87 
 
 
382 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1316  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  54.57 
 
 
382 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1435  Alcohol dehydrogenase  54.31 
 
 
382 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0578775 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1418  Iron-containing alcohol dehydrogenase  53.79 
 
 
382 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.909336  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6101  dehydrogenase  52.82 
 
 
370 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1476  Alcohol dehydrogenase  53.26 
 
 
382 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3155  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.97 
 
 
380 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1609  alcohol dehydrogenase  52.51 
 
 
382 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3418  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.66 
 
 
378 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2157  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.44 
 
 
380 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2864  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.88 
 
 
378 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.44 
 
 
380 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691454  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3383  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.84 
 
 
378 aa  363  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469103  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1798  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  53.93 
 
 
378 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2526  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.84 
 
 
378 aa  361  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00912528 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0986  putative NAD-dependent 4-hyddoxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  52.74 
 
 
382 aa  359  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1771  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  53 
 
 
382 aa  352  5e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.13 
 
 
378 aa  352  5.9999999999999994e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612033  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1993  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.63 
 
 
378 aa  346  4e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1711  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.11 
 
 
378 aa  344  1e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226626  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4502  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.62 
 
 
378 aa  323  4e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.49519  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0681  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.44 
 
 
381 aa  255  8e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0991  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.37 
 
 
381 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260601  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.16 
 
 
383 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4700  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.58 
 
 
377 aa  248  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2781  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.74 
 
 
398 aa  246  4e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2317  Iron-containing alcohol dehydrogenase  41.58 
 
 
381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735115  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2945  dehydrogenase  42.22 
 
 
381 aa  243  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2470  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.49 
 
 
392 aa  242  9e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.5015 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2128  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.11 
 
 
381 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.705476  normal  0.429829 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.44 
 
 
381 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.50517  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2204  hypothetical protein  38.79 
 
 
386 aa  238  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2176  hypothetical protein  38.79 
 
 
386 aa  237  3e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0109  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.48 
 
 
378 aa  235  9e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4549  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.21 
 
 
381 aa  234  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  38.26 
 
 
389 aa  229  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2891  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.69 
 
 
383 aa  230  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339449  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  36 
 
 
387 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.26 
 
 
393 aa  224  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.14 
 
 
389 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  37.89 
 
 
383 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  38.61 
 
 
388 aa  218  8.999999999999998e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  41.28 
 
 
383 aa  218  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0678  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.53 
 
 
389 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2957  methanol dehydrogenase, NAD-dependent  38.23 
 
 
384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0476972  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  38.12 
 
 
381 aa  216  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1612  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.31 
 
 
381 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3658  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.28 
 
 
383 aa  215  8e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.06 
 
 
393 aa  215  9e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2792  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.17 
 
 
392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413135  normal  0.203588 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.77 
 
 
394 aa  211  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000188362  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.8 
 
 
385 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2394  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.59 
 
 
389 aa  212  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.45 
 
 
382 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  36.36 
 
 
385 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.92 
 
 
387 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  36.36 
 
 
385 aa  210  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2742  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.51 
 
 
384 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0794554  normal  0.0588178 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  40.53 
 
 
383 aa  210  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49580  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.83 
 
 
393 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164623  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.29 
 
 
393 aa  209  8e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.6 
 
 
382 aa  209  8e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.18 
 
 
388 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2530  alcohol dehydrogenase  35.9 
 
 
388 aa  207  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.840072  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.37 
 
 
393 aa  206  4e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.78 
 
 
382 aa  206  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  35.83 
 
 
382 aa  206  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.77 
 
 
382 aa  206  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
388 aa  206  7e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  36.07 
 
 
382 aa  205  9e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2103  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.8 
 
 
388 aa  205  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158602  normal  0.562089 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2961  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.88 
 
 
388 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.813406  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1636  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.9 
 
 
387 aa  204  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000919335 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.58 
 
 
384 aa  204  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1053  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.88 
 
 
382 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000489581 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0687  alcohol dehydrogenase, iron-containing  40 
 
 
389 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.377875  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
387 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.06 
 
 
391 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.79 
 
 
382 aa  204  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  38.77 
 
 
382 aa  203  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0466  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.93 
 
 
384 aa  203  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.62 
 
 
382 aa  203  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.41 
 
 
382 aa  203  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2234  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.36 
 
 
382 aa  203  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10038 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.66 
 
 
387 aa  203  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.74 
 
 
402 aa  202  8e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0734  alcohol dehydrogenase, iron-containing  39.74 
 
 
389 aa  202  9e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.434692  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.73 
 
 
387 aa  202  9e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  36.16 
 
 
382 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>