105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0061 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0061  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2473  hypothetical protein  83.46 
 
 		 289 aa  448  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.360526  normal  0.185436 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3109  hypothetical protein  72.69 
 
 		 285 aa  410  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2795  hypothetical protein  71.1 
 
 		 286 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0573  hypothetical protein  67.4 
 
 		 277 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.329017  normal  0.178207 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0802  hypothetical protein  67.29 
 
 		 288 aa  341  8e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4087  hypothetical protein  55.42 
 
 		 286 aa  248  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3985  hypothetical protein  55.32 
 
 		 286 aa  245  8e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2796  hypothetical protein  52.94 
 
 		 283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0112112  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4036  hypothetical protein  50.59 
 
 		 283 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278861  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4449  hypothetical protein  54.89 
 
 		 286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2524  hypothetical protein  52.52 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578809  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1314  hypothetical protein  53.25 
 
 		 302 aa  237  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  hitchhiker  0.0088422 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3315  hypothetical protein  51.78 
 
 		 278 aa  236  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40950  predicted protein  47.42 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2182  hypothetical protein  50.21 
 
 		 299 aa  219  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230731  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06335  conserved hypothetical protein  43.46 
 
 		 312 aa  202  7e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.246727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45364  predicted protein  50.68 
 
 		 300 aa  198  7e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0471946 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3045  hypothetical protein  32.87 
 
 		 195 aa  89.7  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  29.22 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3249  hypothetical protein  28.71 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.987033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1619  hypothetical protein  29.17 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  32.98 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4749  hypothetical protein  30.26 
 
 		 200 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269123  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2687  hypothetical protein  30.85 
 
 		 198 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500791  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  32.64 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  32.45 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2380  hypothetical protein  30.85 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.697373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  32.45 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2465  hypothetical protein  30.32 
 
 		 198 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  32.29 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2565  hypothetical protein  30.32 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  31.41 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2652  hypothetical protein  27 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  32.22 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  31.67 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  32.04 
 
 		 214 aa  65.1  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  31.44 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  31.28 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1185  hypothetical protein  31.63 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1202  hypothetical protein  31.63 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1212  hypothetical protein  31.63 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1324  hypothetical protein  25.73 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  28.27 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1829  hypothetical protein  31.22 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00879192 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  30.89 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  29.84 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  30.43 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  30.88 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  28.95 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1061  hypothetical protein  31.61 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  29.05 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6085  hypothetical protein  30.61 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.195869 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  29.08 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  32.18 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  32.02 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  30.39 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  28.8 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  31.18 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  28.8 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  29.59 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0329  hypothetical protein  28.65 
 
 		 233 aa  58.9  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  28.57 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  28.42 
 
 		 216 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  27.87 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  28.27 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  26.84 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  31.87 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2657  hypothetical protein  29.47 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  29.53 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  29.53 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  29.03 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  30.11 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.25 
 
 		 781 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  27.98 
 
 		 219 aa  52.8  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01230  hypothetical protein  25.34 
 
 		 197 aa  52.8  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  27.6 
 
 		 217 aa  52.8  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1329  hypothetical protein  29.53 
 
 		 205 aa  52.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  28.65 
 
 		 211 aa  52.4  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  28.33 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  29.32 
 
 		 202 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3316  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.5 
 
 		 789 aa  50.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  29.1 
 
 		 278 aa  49.3  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4885  hypothetical protein  29.15 
 
 		 268 aa  48.9  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131726  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  26.61 
 
 		 277 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  28.18 
 
 		 208 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  25.13 
 
 		 214 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  25.74 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1202  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.22 
 
 		 752 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5656  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.19 
 
 		 789 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.240642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  25 
 
 		 241 aa  47  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3746  hypothetical protein  29.84 
 
 		 204 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0155  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.22 
 
 		 790 aa  46.2  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  25.49 
 
 		 280 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  27.13 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2729  hypothetical protein  29.53 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3603  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.95 
 
 		 761 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6592  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.89 
 
 		 789 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642843 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  28.57 
 
 		 204 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  26.98 
 
 		 199 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>