More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0051 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0051  aminotransferase class IV  100 
 
 		 287 aa  552  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0051  aminotransferase class IV  71.84 
 
 		 279 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4377  aminotransferase class IV  61.87 
 
 		 285 aa  281  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.505275  normal  0.583274 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4274  aminotransferase class IV  60.36 
 
 		 285 aa  277  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3905  aminotransferase class IV  60 
 
 		 285 aa  276  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0129654  normal  0.244879 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1636  aminotransferase class IV  61 
 
 		 283 aa  262  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  0.382148 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  50.18 
 
 		 280 aa  243  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1139  aminotransferase class IV  51.95 
 
 		 288 aa  222  4.9999999999999996e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.092565  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  40.28 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  38.46 
 
 		 298 aa  152  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  36.44 
 
 		 287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  36.03 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  40.38 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3581  aminotransferase class IV  41.97 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000213768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  37.11 
 
 		 291 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  37.8 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0319918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  32.65 
 
 		 289 aa  125  6e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  39.45 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2898  aminotransferase, class IV  39.69 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.051905 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  32.73 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.89 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0069  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.73 
 
 		 290 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4200  aminotransferase class IV  43.08 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.108763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5238  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.15 
 
 		 290 aa  119  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127403 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  35 
 
 		 292 aa  119  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  32.94 
 
 		 288 aa  119  7.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  32.05 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.89 
 
 		 290 aa  115  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.34 
 
 		 290 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  30.1 
 
 		 297 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0078  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.34 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.199927  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1631  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.58 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  30.21 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.34 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  32.63 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  30.8 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.39 
 
 		 290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0079  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.39 
 
 		 290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128474 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.39 
 
 		 290 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.39 
 
 		 290 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  30.32 
 
 		 299 aa  112  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  30.88 
 
 		 299 aa  112  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  28.72 
 
 		 293 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1662  aminotransferase, class IV  31.62 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1131  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  37.89 
 
 		 288 aa  109  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  33.33 
 
 		 300 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  30.94 
 
 		 293 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  32.42 
 
 		 288 aa  108  9.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  30.74 
 
 		 286 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  32.31 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2240  aminotransferase class IV  33.88 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  30.82 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14950  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.47 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  32.44 
 
 		 297 aa  106  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  30.9 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25710  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.22 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0077515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  35.84 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  30.31 
 
 		 298 aa  106  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  30.21 
 
 		 287 aa  105  7e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  31.84 
 
 		 303 aa  105  7e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  32.07 
 
 		 347 aa  105  8e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  30.21 
 
 		 287 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  29.02 
 
 		 291 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0629  hypothetical protein  29.04 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29691  aminotransferases class-IV  32.68 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0645  hypothetical protein  29.04 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  32.57 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  30.89 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  29.03 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  31.69 
 
 		 297 aa  102  5e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  31.13 
 
 		 288 aa  102  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1831  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 270 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2197  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.59 
 
 		 271 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 		 299 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 		 299 aa  102  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 		 299 aa  102  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 		 299 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 		 299 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  29.02 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  32.53 
 
 		 292 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2604  aminotransferase class IV  36.41 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.946338  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  29.02 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  29.02 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  29.02 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  29.02 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  29.02 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.34 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15470  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.27 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0160772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  28.42 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  31.84 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  29.02 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  29.02 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  29.02 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  33.2 
 
 		 274 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2500  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.47 
 
 		 265 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00140105  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1909  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.97 
 
 		 265 aa  99.8  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  decreased coverage  0.000000690882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>