More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0050 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
335 aa  675    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  79.04 
 
 
335 aa  535  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  77.84 
 
 
335 aa  526  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  77.84 
 
 
335 aa  526  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  65.67 
 
 
336 aa  450  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  63.03 
 
 
337 aa  437  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  62.93 
 
 
336 aa  432  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  58.51 
 
 
333 aa  396  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  59.38 
 
 
332 aa  392  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  60 
 
 
332 aa  387  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  54.66 
 
 
339 aa  371  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  54.52 
 
 
326 aa  345  8e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  54.77 
 
 
324 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  53.94 
 
 
325 aa  334  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  51.57 
 
 
342 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  53.85 
 
 
353 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  53.94 
 
 
335 aa  333  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  53.53 
 
 
324 aa  331  9e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  54.35 
 
 
325 aa  330  3e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  55.62 
 
 
324 aa  325  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  52.88 
 
 
324 aa  322  5e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  51.08 
 
 
325 aa  319  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  52.23 
 
 
326 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  50.47 
 
 
346 aa  315  5e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  50.78 
 
 
325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  48.75 
 
 
323 aa  291  1e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  46.42 
 
 
326 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  46.11 
 
 
326 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  46.11 
 
 
326 aa  265  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  52.08 
 
 
447 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  44.06 
 
 
331 aa  255  8e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  43.48 
 
 
327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  43.3 
 
 
331 aa  251  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  44.48 
 
 
336 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  42.99 
 
 
329 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  42.59 
 
 
324 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  42.68 
 
 
329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  42.68 
 
 
329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  42.68 
 
 
329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  43.03 
 
 
327 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  42.72 
 
 
327 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2115  2-dehydropantoate 2-reductase  42.99 
 
 
329 aa  242  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0197  2-dehydropantoate 2-reductase  45.54 
 
 
324 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431306  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  44.1 
 
 
325 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  43.48 
 
 
325 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0135  2-dehydropantoate 2-reductase  43.89 
 
 
324 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878184  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2371  2-dehydropantoate 2-reductase  42.27 
 
 
333 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2330  2-dehydropantoate 2-reductase  41.74 
 
 
337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.787912  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  42.37 
 
 
325 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  43.84 
 
 
341 aa  228  9e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1345  2-dehydropantoate 2-reductase  42.14 
 
 
332 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162184  normal  0.0787128 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1845  2-dehydropantoate 2-reductase  42.36 
 
 
332 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.995272  normal  0.0110748 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1471  2-dehydropantoate 2-reductase  41.97 
 
 
334 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1915  2-dehydropantoate 2-reductase  42.36 
 
 
332 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6152  2-dehydropantoate 2-reductase  41.4 
 
 
332 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  41.4 
 
 
332 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193569  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1950  2-dehydropantoate 2-reductase  41.4 
 
 
332 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0818482  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5228  2-dehydropantoate 2-reductase  40.76 
 
 
332 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0234  2-dehydropantoate 2-reductase  43 
 
 
325 aa  215  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0153  2-dehydropantoate 2-reductase  41.1 
 
 
351 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45590  hypothetical protein  37.62 
 
 
359 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  33.77 
 
 
327 aa  186  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3657  ketopantoate reductase ApbA/PanE  43.72 
 
 
223 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7671 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  32.92 
 
 
324 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2699  2-dehydropantoate 2-reductase  34.32 
 
 
322 aa  142  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122985  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
312 aa  142  9e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  32.43 
 
 
302 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  30.94 
 
 
309 aa  129  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03720  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 
314 aa  126  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  30.3 
 
 
314 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  33.88 
 
 
315 aa  123  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  30.25 
 
 
312 aa  123  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  31.58 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  28.92 
 
 
316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  28.92 
 
 
316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  31.45 
 
 
314 aa  116  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  29.43 
 
 
323 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  31.13 
 
 
311 aa  116  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  29.39 
 
 
301 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  28.01 
 
 
316 aa  113  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  29.72 
 
 
305 aa  113  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  29.18 
 
 
301 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  29.73 
 
 
302 aa  112  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  31.94 
 
 
307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  28.14 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6687  2-dehydropantoate 2-reductase  29.64 
 
 
312 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  28.92 
 
 
335 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  30.9 
 
 
315 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  27.39 
 
 
306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  29.85 
 
 
312 aa  109  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  28.48 
 
 
299 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  30.23 
 
 
312 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  31.23 
 
 
315 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  26.57 
 
 
316 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  28.74 
 
 
341 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  28.66 
 
 
315 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  26.57 
 
 
316 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  30.9 
 
 
315 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  29.24 
 
 
311 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  31.15 
 
 
318 aa  105  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>