More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0048 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0048  MATE efflux family protein  83.48 
 
 		 460 aa  635    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0386984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0048  MATE efflux family protein  100 
 
 		 460 aa  842    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782578  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5998  MATE efflux family protein  65.13 
 
 		 486 aa  510  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.926416 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3542  MATE efflux family protein  59.78 
 
 		 467 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4118  MATE efflux family protein  63.56 
 
 		 468 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3795  MATE efflux family protein  64.27 
 
 		 468 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3694  MATE efflux family protein  60.13 
 
 		 472 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3317  MATE efflux family protein  46.98 
 
 		 469 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2205  hypothetical protein  45.95 
 
 		 480 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1345  multi anti extrusion protein MatE  44.75 
 
 		 459 aa  300  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1675  MATE efflux family protein  44.5 
 
 		 457 aa  289  7e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3623  MATE efflux family protein  45.66 
 
 		 457 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0796  multi anti extrusion protein MatE  42.82 
 
 		 484 aa  279  8e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5248  multi antimicrobial extrusion protein MatE  39.96 
 
 		 478 aa  267  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1888  MATE efflux family protein  43.08 
 
 		 457 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0908  multi anti extrusion protein MatE  37.92 
 
 		 483 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0522974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0771  putative cation-driven multidrug efflux pump  40.04 
 
 		 485 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00132131 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3218  multi anti extrusion protein MatE  40.23 
 
 		 455 aa  227  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3060  multi anti extrusion protein MatE  40.56 
 
 		 456 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147245  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  30.59 
 
 		 460 aa  194  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  27.75 
 
 		 464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  27.75 
 
 		 464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  28.08 
 
 		 452 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  32.79 
 
 		 484 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  29.32 
 
 		 455 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  30.41 
 
 		 455 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  29.71 
 
 		 455 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  28.71 
 
 		 455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  28.71 
 
 		 455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  29.06 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  28.93 
 
 		 458 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  31.43 
 
 		 486 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 454 aa  124  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  29.52 
 
 		 470 aa  123  8e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  30.45 
 
 		 457 aa  121  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  27.82 
 
 		 458 aa  121  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  32.24 
 
 		 463 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  27.48 
 
 		 463 aa  120  6e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  28.01 
 
 		 445 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  23.92 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  25.94 
 
 		 476 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  25.54 
 
 		 475 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.58 
 
 		 468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  30.41 
 
 		 500 aa  117  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  30.09 
 
 		 460 aa  117  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  25.77 
 
 		 454 aa  117  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 452 aa  117  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  29.6 
 
 		 485 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 452 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  29.69 
 
 		 459 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  29.84 
 
 		 470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.51 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  28.16 
 
 		 456 aa  113  9e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  28.44 
 
 		 453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  28.89 
 
 		 453 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  26.43 
 
 		 462 aa  110  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  28.2 
 
 		 518 aa  109  9.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  27.95 
 
 		 478 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 455 aa  109  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  27.34 
 
 		 477 aa  109  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  27.44 
 
 		 454 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  27.39 
 
 		 499 aa  107  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  26.33 
 
 		 460 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 500 aa  104  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  29.1 
 
 		 485 aa  103  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  23.06 
 
 		 468 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  28.66 
 
 		 498 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  29.83 
 
 		 525 aa  102  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  30.79 
 
 		 481 aa  100  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  26.48 
 
 		 456 aa  100  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  25.5 
 
 		 451 aa  100  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  25.35 
 
 		 470 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  28.24 
 
 		 467 aa  100  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  26.36 
 
 		 461 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  26.19 
 
 		 554 aa  98.6  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 459 aa  98.2  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  26.09 
 
 		 460 aa  97.8  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  27.08 
 
 		 460 aa  97.8  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  29.67 
 
 		 473 aa  97.4  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 464 aa  97.4  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 457 aa  97.1  6e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  23.66 
 
 		 448 aa  97.1  6e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  28.29 
 
 		 461 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  29.74 
 
 		 454 aa  95.1  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 454 aa  95.1  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  24.74 
 
 		 461 aa  94.4  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  30.08 
 
 		 478 aa  93.6  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  27.45 
 
 		 538 aa  92.8  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  27.71 
 
 		 490 aa  92.4  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  25.74 
 
 		 454 aa  92  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1858  MATE efflux family protein  29.84 
 
 		 467 aa  90.9  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0434953  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  25.32 
 
 		 455 aa  90.9  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  28.84 
 
 		 460 aa  90.9  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  28.33 
 
 		 467 aa  90.1  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 467 aa  89.7  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  22.74 
 
 		 468 aa  89.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  21.58 
 
 		 462 aa  89.4  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  24.35 
 
 		 475 aa  89.7  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>