198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0024 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0024  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  244  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0228023  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0021  hypothetical protein  90.43 
 
 
133 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0577391 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0406  hypothetical protein  78.69 
 
 
128 aa  156  9e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.442549 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0439  hypothetical protein  77.87 
 
 
128 aa  154  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111388  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2938  hypothetical protein  58.27 
 
 
129 aa  131  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0293  protein of unknown function UPF0102  56.9 
 
 
124 aa  125  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.210059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0474  hypothetical protein  71.43 
 
 
125 aa  122  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3496  hypothetical protein  56.03 
 
 
125 aa  116  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.215369 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  49.22 
 
 
128 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  48.74 
 
 
136 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0187  hypothetical protein  48.25 
 
 
125 aa  104  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  50.85 
 
 
135 aa  102  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  50.41 
 
 
135 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  50 
 
 
118 aa  101  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4010  hypothetical protein  50.44 
 
 
124 aa  100  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.571569  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0178  hypothetical protein  47.37 
 
 
126 aa  100  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.647134  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  49.18 
 
 
131 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  54.05 
 
 
133 aa  100  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  46.15 
 
 
130 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3545  hypothetical protein  48.6 
 
 
122 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0353  hypothetical protein  44.86 
 
 
128 aa  88.6  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1042  hypothetical protein  40.35 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0556279  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  46.96 
 
 
127 aa  79.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4331  hypothetical protein  42.5 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3692  hypothetical protein  42.2 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.598845  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  50 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4594  hypothetical protein  41.75 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.042758 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0175  hypothetical protein  45.61 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  34.85 
 
 
128 aa  61.6  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  37.1 
 
 
127 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  40.5 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0572  hypothetical protein  38.26 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421068  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  38.26 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0339  hypothetical protein  43.64 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0692015  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  38.05 
 
 
124 aa  57.8  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  38.78 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  37.93 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  35.29 
 
 
120 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  40 
 
 
122 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04380  hypothetical protein  40 
 
 
122 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0093  hypothetical protein  25.89 
 
 
122 aa  54.3  0.0000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.560974  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  37.07 
 
 
120 aa  53.9  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  38.3 
 
 
131 aa  53.9  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1748  hypothetical protein  38.38 
 
 
121 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0262  hypothetical protein  39.18 
 
 
116 aa  53.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.605183  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1674  hypothetical protein  38.38 
 
 
121 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  35.11 
 
 
122 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  28.07 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  36.56 
 
 
123 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  30.09 
 
 
125 aa  52  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1212  protein of unknown function UPF0102  33.02 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  32.06 
 
 
140 aa  51.6  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3585  hypothetical protein  40.58 
 
 
131 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  36 
 
 
128 aa  50.8  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  34.55 
 
 
123 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  38 
 
 
131 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  33.64 
 
 
121 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4467  hypothetical protein  38 
 
 
131 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  33.64 
 
 
121 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  36.19 
 
 
123 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03015  hypothetical protein  38 
 
 
131 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0557  protein of unknown function UPF0102  38 
 
 
131 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02966  hypothetical protein  38 
 
 
131 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0464  hypothetical protein  32.98 
 
 
116 aa  50.4  0.000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1413  hypothetical protein  24.74 
 
 
112 aa  50.1  0.000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0550  hypothetical protein  38 
 
 
131 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  35 
 
 
125 aa  50.4  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3630  hypothetical protein  38 
 
 
131 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3624  hypothetical protein  38.14 
 
 
131 aa  50.4  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0695  hypothetical protein  36.56 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000229548  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  36.56 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  31.18 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  33.33 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0671  hypothetical protein  36.56 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156143  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2830  hypothetical protein  34.18 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.31307  normal  0.486249 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  27.27 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2083  hypothetical protein  43 
 
 
104 aa  49.7  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  24.79 
 
 
127 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  31.58 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  37.38 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3783  hypothetical protein  37.65 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00882109  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  40.24 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  30.43 
 
 
172 aa  48.9  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1284  hypothetical protein  34.52 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  31.62 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  33.93 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  28.32 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  34.18 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  33.61 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  30.93 
 
 
164 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  36.05 
 
 
134 aa  47.8  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0630  hypothetical protein  36.84 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0702  hypothetical protein  27.08 
 
 
112 aa  47.8  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.254087  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  34.38 
 
 
125 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  31.25 
 
 
115 aa  47.8  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  28.7 
 
 
129 aa  47.4  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  33.71 
 
 
165 aa  47.4  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  38.55 
 
 
123 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  35.8 
 
 
114 aa  47  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  31.3 
 
 
115 aa  47  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>