76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0010 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0010  protein of unknown function DUF29  100 
 
 
171 aa  342  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1125  hypothetical protein  51.3 
 
 
164 aa  143  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3208  hypothetical protein  37.01 
 
 
163 aa  94  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0013  protein of unknown function DUF29  31.03 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2565  protein of unknown function DUF29  30.5 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0144  protein of unknown function DUF29  30 
 
 
148 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.42277  hitchhiker  0.0000174807 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0148  protein of unknown function DUF29  30 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3972  protein of unknown function DUF29  32.19 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108049 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1533  protein of unknown function DUF29  32.86 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1506  protein of unknown function DUF29  32.86 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1378  protein of unknown function DUF29  32.41 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2146  protein of unknown function DUF29  31.43 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1918  protein of unknown function DUF29  32.14 
 
 
131 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1988  protein of unknown function DUF29  27.74 
 
 
152 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2015  protein of unknown function DUF29  27.74 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.298519 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1562  protein of unknown function DUF29  30.43 
 
 
133 aa  60.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.357579 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3745  protein of unknown function DUF29  27.14 
 
 
137 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670946  normal  0.292589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3729  protein of unknown function DUF29  26.06 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3691  protein of unknown function DUF29  27.14 
 
 
137 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1412  protein of unknown function DUF29  35.58 
 
 
122 aa  57.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.516954  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1408  protein of unknown function DUF29  26.53 
 
 
135 aa  57.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.835091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0890  protein of unknown function DUF29  24.14 
 
 
135 aa  57.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0014  protein of unknown function DUF29  27.03 
 
 
135 aa  57.4  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0704  protein of unknown function DUF29  28.67 
 
 
153 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal  0.581581 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0602  protein of unknown function DUF29  29.8 
 
 
152 aa  54.7  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2482  protein of unknown function DUF29  28.28 
 
 
161 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0170652 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2442  protein of unknown function DUF29  34.38 
 
 
155 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.257531  normal  0.205428 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0539  hypothetical protein  38.46 
 
 
166 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1277  protein of unknown function DUF29  27.89 
 
 
158 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4999  hypothetical protein  32.45 
 
 
145 aa  51.6  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2944  protein of unknown function DUF29  26.62 
 
 
147 aa  50.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3152  protein of unknown function DUF29  26.62 
 
 
147 aa  50.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.039053  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0698  protein of unknown function DUF29  29.46 
 
 
150 aa  50.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213059  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4036  hypothetical protein  42.67 
 
 
144 aa  50.8  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0191008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1246  protein of unknown function DUF29  27.21 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3658  protein of unknown function DUF29  28.16 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0651  protein of unknown function DUF29  25.17 
 
 
152 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0154198  normal  0.0872929 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3205  protein of unknown function DUF29  35.9 
 
 
146 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009474  Acry_3636  hypothetical protein  30.52 
 
 
146 aa  48.9  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2917  protein of unknown function DUF29  35.9 
 
 
146 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0975429  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0533  protein of unknown function DUF29  26.6 
 
 
97 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1841  protein of unknown function DUF29  36.36 
 
 
152 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4411  protein of unknown function DUF29  29.66 
 
 
270 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3699  hypothetical protein  38.67 
 
 
164 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.374483 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3727  protein of unknown function DUF29  32.95 
 
 
155 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0622  protein of unknown function DUF29  27.52 
 
 
145 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3241  protein of unknown function DUF29  29.93 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.249361 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0542  hypothetical protein  30.77 
 
 
166 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1919  protein of unknown function DUF29  26.03 
 
 
151 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.891607 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0255  protein of unknown function DUF29  25.16 
 
 
157 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4365  protein of unknown function DUF29  25 
 
 
142 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0780275 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3729  protein of unknown function DUF29  28.1 
 
 
143 aa  44.7  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2766  hypothetical protein  26.57 
 
 
144 aa  44.3  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3625  hypothetical protein  33.72 
 
 
148 aa  44.3  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347461  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5306  protein of unknown function DUF29  25.18 
 
 
150 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1741  protein of unknown function DUF29  25.53 
 
 
174 aa  43.9  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000185982  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0838  protein of unknown function DUF29  24.06 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0809  protein of unknown function DUF29  24.06 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4304  protein of unknown function DUF29  26.43 
 
 
142 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0213  protein of unknown function DUF29  23.31 
 
 
143 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000762882  decreased coverage  0.000484269 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1459  protein of unknown function DUF29  26.32 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000787671  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0216  protein of unknown function DUF29  23.31 
 
 
143 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0944  protein of unknown function DUF29  26.67 
 
 
149 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1710  protein of unknown function DUF29  27.03 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000133374 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0971  protein of unknown function DUF29  26.67 
 
 
149 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000575835  normal  0.0486362 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4927  protein of unknown function DUF29  29.46 
 
 
125 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0612611 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3642  protein of unknown function DUF29  26.76 
 
 
153 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2239  protein of unknown function DUF29  25.34 
 
 
152 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707792 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2472  protein of unknown function DUF29  26.76 
 
 
153 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0330684  normal  0.567998 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3342  protein of unknown function DUF29  28.75 
 
 
150 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3967  protein of unknown function DUF29  25.85 
 
 
149 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104438 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4913  protein of unknown function DUF29  31.75 
 
 
158 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.576904 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4105  protein of unknown function DUF29  27.27 
 
 
148 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0580  hypothetical protein  34.15 
 
 
144 aa  41.6  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00000165262  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1808  hypothetical protein  27.71 
 
 
105 aa  41.2  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0100  protein of unknown function DUF29  25 
 
 
151 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0935689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>