More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4406 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
308 aa  622  1e-177  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1948  oligopeptide transport system permease protein C  67.21 
 
 
300 aa  426  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02947  hypothetical protein  67.21 
 
 
302 aa  425  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002961  oligopeptide transport system permease protein OppC  66.88 
 
 
300 aa  422  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0611  oligopeptide ABC transporter, permease protein  66.56 
 
 
300 aa  419  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.53 
 
 
302 aa  414  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00582583  hitchhiker  0.00187492 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1401  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  65.91 
 
 
302 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1583  oligopeptide ABC transporter permease OppC  65.91 
 
 
302 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1935  oligopeptide ABC transporter permease OppC  65.91 
 
 
302 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0740124 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1872  oligopeptide ABC transporter permease protein OppC  65.91 
 
 
302 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1878  oligopeptide ABC transporter permease OppC  65.91 
 
 
302 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.991183  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1895  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  67.54 
 
 
301 aa  391  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.213821  normal  0.110744 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01219  oligopeptide transporter subunit  66.88 
 
 
302 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.88 
 
 
302 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0051729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1354  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  66.88 
 
 
302 aa  390  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000186421  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01229  hypothetical protein  66.88 
 
 
302 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.239558  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1393  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  66.88 
 
 
302 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.380796  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.88 
 
 
302 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0767914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1731  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  67.21 
 
 
301 aa  388  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.1425  normal  0.136954 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2383  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.88 
 
 
302 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000135484 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1414  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  66.56 
 
 
302 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.585769  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2068  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.23 
 
 
301 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.303365  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1958  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  66.23 
 
 
301 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.268975  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0023  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.33 
 
 
301 aa  386  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2161  oligopeptide transport system permease  66.23 
 
 
301 aa  386  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00516752  normal  0.0301341 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2300  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.58 
 
 
302 aa  385  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.23 
 
 
302 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003659  oligopeptide transport system permease protein OppC  59.35 
 
 
310 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7028  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  59.15 
 
 
308 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.22 
 
 
307 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.22 
 
 
307 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.385135  normal  0.0216142 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.64 
 
 
302 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2288  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.64 
 
 
302 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0706527  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0590  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  60.7 
 
 
302 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.62 
 
 
317 aa  353  2e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.367551 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.74 
 
 
299 aa  349  3e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499686  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.14 
 
 
301 aa  337  1.9999999999999998e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.69178  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.65 
 
 
305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238767  normal  0.85069 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.79 
 
 
305 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.824973 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0755  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, inner membrane subunit  50.65 
 
 
304 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.65 
 
 
304 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.673312 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.96 
 
 
300 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.96 
 
 
300 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.99 
 
 
300 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.96 
 
 
300 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.84 
 
 
300 aa  293  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.96 
 
 
300 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.1 
 
 
301 aa  288  9e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2030  oligopeptide ABC transporter permease protein  49.65 
 
 
293 aa  288  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0128641  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.04 
 
 
296 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.284812 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0117  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  52.61 
 
 
300 aa  280  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.697818  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2217  oligopeptide ABC transporter, permease protein  52.26 
 
 
300 aa  276  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1251  putative oligopeptide transport system permease protein  52.69 
 
 
300 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3017  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  52.69 
 
 
300 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2901  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  52.69 
 
 
300 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00914111  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1536  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  52.69 
 
 
300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.99 
 
 
379 aa  273  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.750131  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0353  oligopeptide ABC transporter, permease protein  52.33 
 
 
300 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1726  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  52.33 
 
 
300 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0387  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  52.33 
 
 
300 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.510408  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.33 
 
 
377 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0465  oligopeptide ABC transporter, permease protein  61.23 
 
 
386 aa  270  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.23 
 
 
379 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0535  oligopeptide ABC transporter, permease protein  61.06 
 
 
386 aa  267  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1479  ABC oligopeptide transporter, inner membrane subunit OppC  59.91 
 
 
379 aa  267  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.230564  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.91 
 
 
379 aa  267  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4687  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.31 
 
 
376 aa  259  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.161422  normal  0.279284 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1403  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  62.1 
 
 
373 aa  252  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0967501  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.8 
 
 
369 aa  249  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517681  normal  0.475934 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.53 
 
 
363 aa  246  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.53 
 
 
363 aa  246  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.874263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.17 
 
 
260 aa  245  8e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.578435 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.41 
 
 
310 aa  242  5e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.9 
 
 
310 aa  242  5e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.9 
 
 
310 aa  242  5e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0465132  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.68 
 
 
327 aa  241  1e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000093135  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.73 
 
 
373 aa  239  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.946772 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.56 
 
 
366 aa  230  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  0.0491821 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.34 
 
 
353 aa  230  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.28935  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6091  cyclic nucleotide-binding protein  55.46 
 
 
366 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0638  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  41.55 
 
 
320 aa  225  6e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.3 
 
 
369 aa  222  8e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.659828 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0337  oligopeptide transport system permease protein OppC  35.47 
 
 
349 aa  219  6e-56  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0317514  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.32 
 
 
325 aa  219  6e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00471699  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.15 
 
 
356 aa  217  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.15 
 
 
356 aa  217  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
338 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0104198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.3 
 
 
342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  41.09 
 
 
282 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0571  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.83 
 
 
313 aa  212  7.999999999999999e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
313 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0874  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
310 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 
338 aa  209  6e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.51 
 
 
280 aa  208  9e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
321 aa  207  2e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1085  oligopeptide ABC transporter, permease  34.29 
 
 
338 aa  206  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.51 
 
 
485 aa  206  4e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.431647  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1263  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.29 
 
 
338 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.81 
 
 
280 aa  206  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1236  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.92 
 
 
338 aa  205  7e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>