More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4292 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4292  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  100 
 
 		 317 aa  646    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.422429  hitchhiker  0.0000115964 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4564  biotin--protein ligase  43.53 
 
 		 335 aa  255  7e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0610  birA bifunctional protein  43.53 
 
 		 319 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3926  biotin--protein ligase  41.01 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0467  biotin--protein ligase  42.01 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08620  biotin--protein ligase  41.32 
 
 		 312 aa  228  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664696 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4072  biotin--protein ligase  41.72 
 
 		 319 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0197  biotin--protein ligase  40.37 
 
 		 317 aa  226  6e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00143406  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0470  biotin--protein ligase  42.27 
 
 		 319 aa  225  8e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0969933  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0184  biotin--protein ligase  41.08 
 
 		 319 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.570128  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4174  biotin--protein ligase  41.08 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000228488  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0180  biotin--protein ligase  40.76 
 
 		 319 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0210584  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0437  biotin--protein ligase  41.96 
 
 		 319 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193351  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4766  biotin--protein ligase  42.32 
 
 		 321 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0199355  normal  0.789599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5096  biotin--protein ligase  43.12 
 
 		 317 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000301513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3775  biotin--protein ligase  39.62 
 
 		 319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00231404  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2876  biotin--protein ligase  37.9 
 
 		 319 aa  216  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0183  biotin--protein ligase  40.58 
 
 		 319 aa  216  5e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00618712  normal  0.258521 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0182  biotin--protein ligase  40.26 
 
 		 319 aa  215  9e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000279859  normal  0.096767 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06050  biotin--protein ligase  39.43 
 
 		 330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0406  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  41.43 
 
 		 326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.617579  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0214  biotin--protein ligase  40.32 
 
 		 319 aa  212  7e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0219  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.8 
 
 		 322 aa  210  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.440436  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2082  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.08 
 
 		 329 aa  208  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0142  biotin--protein ligase  37.85 
 
 		 319 aa  208  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.330287  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0154  biotin--protein ligase  35.71 
 
 		 323 aa  205  6e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00266236  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0915  biotin--(acetyl-CoA-carboxylase) ligase  39.44 
 
 		 332 aa  205  8e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.277179  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03573  putative BirA bifunctional protein  37.54 
 
 		 328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.184427  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0268  biotin--protein ligase  37.06 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0393829  hitchhiker  0.0050705 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3998  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.92 
 
 		 328 aa  196  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00153965  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0177  biotin--protein ligase  39.94 
 
 		 319 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131379  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0132  biotin--protein ligase  38.41 
 
 		 320 aa  196  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000234608  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3740  biotin--protein ligase  34.46 
 
 		 319 aa  192  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00032759  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3871  biotin--protein ligase  37.46 
 
 		 319 aa  192  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000364778  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0327  biotin--protein ligase  37.46 
 
 		 319 aa  192  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0364706  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0201  biotin--protein ligase  36.48 
 
 		 319 aa  192  7e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286867  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3396  biotin--protein ligase  37.46 
 
 		 319 aa  192  7e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3943  biotin--protein ligase  37.26 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.596693  decreased coverage  0.000472258 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03854  biotin-protein ligase  36.74 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0188201  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4047  biotin--protein ligase  36.74 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0641292  hitchhiker  0.00297103 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4512  biotin--protein ligase  36.74 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295045  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4207  biotin--protein ligase  36.74 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000658318  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03807  hypothetical protein  36.74 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4461  biotin--protein ligase  36.74 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000740491  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5438  biotin--protein ligase  36.74 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000183056  hitchhiker  0.00134266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4421  biotin--protein ligase  36.74 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000434302  hitchhiker  0.00072275 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4017  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.74 
 
 		 321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0118949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0702  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.3 
 
 		 319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0362526  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002163  biotin-protein ligase/biotin operon repressor  37.78 
 
 		 321 aa  189  5e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4706  biotin--protein ligase  33.85 
 
 		 320 aa  189  7e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.144079  hitchhiker  0.00201782 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3895  biotin--protein ligase  36.08 
 
 		 319 aa  188  9e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.282712  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2081  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.99 
 
 		 325 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0816  biotin--protein ligase  40.34 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0195  biotin--protein ligase  36.16 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4471  biotin--protein ligase  35.78 
 
 		 320 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000340796  hitchhiker  0.00000000000240151 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4546  biotin--protein ligase  35.78 
 
 		 320 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000449604  hitchhiker  0.00000000138084 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4468  biotin--protein ligase  35.78 
 
 		 320 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0221784  hitchhiker  0.00169649 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4381  biotin--protein ligase  35.78 
 
 		 320 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4349  biotin--protein ligase  35.78 
 
 		 320 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000983671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4334  biotin--protein ligase  34.91 
 
 		 320 aa  186  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.152634  hitchhiker  0.00000000217796 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00240  biotin--protein ligase  36.59 
 
 		 321 aa  185  8e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0168  biotin--protein ligase  34.26 
 
 		 320 aa  183  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00063361  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2717  biotin--protein ligase  36.05 
 
 		 320 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000120108  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1781  birA bifunctional protein  36.56 
 
 		 331 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4745  biotin--protein ligase  34.17 
 
 		 333 aa  176  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.167382  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0460  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.91 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1136  biotin--protein ligase  36.74 
 
 		 317 aa  168  9e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1229  biotin--protein ligase  36.74 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0937  bifunctional protein birA  32.78 
 
 		 323 aa  162  7e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1044  biotin operon repressor  32.78 
 
 		 323 aa  162  7e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0440  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.56 
 
 		 336 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.028543  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0233  biotin--protein ligase  37.86 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0822  biotin-[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  32 
 
 		 333 aa  159  8e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0847  biotin-[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  31.56 
 
 		 331 aa  155  8e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02842  biotin--protein ligase  36.96 
 
 		 338 aa  155  8e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0875  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.91 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107744  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0086  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.79 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1593  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  29.94 
 
 		 326 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2779  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.77 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0162859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1666  birA bifunctional protein  29.94 
 
 		 326 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1419  biotin operon repressor  29.62 
 
 		 326 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1447  birA bifunctional protein  29.3 
 
 		 326 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.867427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3752  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  29.3 
 
 		 326 aa  142  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1631  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  29.3 
 
 		 326 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.104533 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1560  bifunctional biotin operon repressor/biotin--[acetyl-CoA-carboxylase] synthetase  29.3 
 
 		 326 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1420  biotin operon repressor  29.3 
 
 		 326 aa  142  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1704  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  29.62 
 
 		 326 aa  142  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0104372  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1463  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.62 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1317  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.9 
 
 		 328 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.61009  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2817  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.66 
 
 		 336 aa  139  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000210207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0168  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153675  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2459  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.55 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.472126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2585  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.25 
 
 		 338 aa  135  8e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000643253  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0085  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.81 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00153974  normal  0.0550519 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0663  BirA bifunctional protein  29.79 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0814484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1261  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.43 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0134  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.37 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00373648  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0664  BirA bifunctional protein  28.96 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.06678  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0419  biotin--protein ligase  32.29 
 
 		 310 aa  132  5e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0500  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.87 
 
 		 329 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>