154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4179 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  304  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  39.23 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  35.82 
 
 
130 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  36.09 
 
 
130 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  35.82 
 
 
130 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  35.94 
 
 
129 aa  87  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  33.08 
 
 
139 aa  87  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  34.55 
 
 
143 aa  86.7  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  38.18 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  31.25 
 
 
138 aa  84.3  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  35.45 
 
 
138 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  31.67 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  35.38 
 
 
136 aa  83.2  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  34.65 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  32.56 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  35.45 
 
 
138 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  35.45 
 
 
138 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  29.1 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  36.94 
 
 
138 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  34.55 
 
 
143 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  33.05 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  32.84 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  33.61 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  32.5 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  31.01 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  30.88 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  31.4 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  31.09 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  30.51 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  30.95 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  29.01 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  29.01 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  29.01 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  29.01 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  29.01 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  29.01 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  30.51 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  29.01 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  29.01 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  29.66 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  29.23 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  33.64 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  33.04 
 
 
145 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  33.04 
 
 
145 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  33.04 
 
 
145 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  32.71 
 
 
127 aa  67  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  67  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  34.82 
 
 
136 aa  67  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  29.9 
 
 
152 aa  66.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  26.98 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  30 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  30.16 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  34.15 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  28.78 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  34.82 
 
 
550 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  37.21 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  34.82 
 
 
550 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  35.71 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  30.53 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  29.29 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  30.36 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  29.91 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3973  hypothetical protein  33.72 
 
 
125 aa  63.5  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.370228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  31.58 
 
 
548 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2366  hypothetical protein  31.67 
 
 
152 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206302  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  28.46 
 
 
132 aa  63.5  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  30.7 
 
 
548 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  31.9 
 
 
135 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  30.84 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  33.93 
 
 
550 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  30.28 
 
 
144 aa  61.2  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  34.38 
 
 
417 aa  61.6  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  27.82 
 
 
137 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  32.29 
 
 
417 aa  60.5  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  30.43 
 
 
140 aa  60.5  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  29.52 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  26.04 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  28.18 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  30.93 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1972  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon-like protein  28.7 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  30.43 
 
 
176 aa  58.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  26.96 
 
 
132 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  28.91 
 
 
143 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  29.69 
 
 
321 aa  57  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  33.33 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  30.3 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3541  hypothetical protein  27.03 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0915855 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1625  hypothetical protein  30.93 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  30.36 
 
 
129 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3255  putative short chain dehydrogenase  27.45 
 
 
413 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  35.29 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  30.71 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  27.87 
 
 
128 aa  53.9  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  31.25 
 
 
132 aa  53.5  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3885  hypothetical protein  31.03 
 
 
117 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  31.87 
 
 
146 aa  52.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  25.83 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  30 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  25.83 
 
 
319 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>