More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4135 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  65.41 
 
 		 504 aa  644    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  64.02 
 
 		 511 aa  661    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3806  threonine dehydratase, biosynthetic  65.79 
 
 		 507 aa  638    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.276753  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5288  threonine dehydratase, biosynthetic  65.29 
 
 		 514 aa  641    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  65.81 
 
 		 504 aa  681    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  100 
 
 		 501 aa  1027    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5056  threonine dehydratase  65.21 
 
 		 504 aa  644    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.381788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4846  threonine dehydratase  64.21 
 
 		 504 aa  634    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  65.81 
 
 		 504 aa  644    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  63.38 
 
 		 515 aa  645    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  64.61 
 
 		 504 aa  645    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4221  threonine dehydratase  65.21 
 
 		 504 aa  651    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5202  threonine dehydratase  65.21 
 
 		 504 aa  643    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0316  threonine dehydratase  64.81 
 
 		 504 aa  642    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.167113 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  65.81 
 
 		 504 aa  679    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  62.98 
 
 		 515 aa  642    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1672  threonine dehydratase  63.83 
 
 		 511 aa  634  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3386  L-threonine ammonia-lyase  62.23 
 
 		 503 aa  632  1e-180  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  60.84 
 
 		 520 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  58.45 
 
 		 509 aa  609  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0020  L-threonine ammonia-lyase  61.63 
 
 		 504 aa  610  1e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381683  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  58.22 
 
 		 507 aa  599  1e-170  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  59.72 
 
 		 504 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  57.46 
 
 		 503 aa  597  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2490  threonine dehydratase  60.24 
 
 		 519 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138025  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3446  threonine dehydratase  60.24 
 
 		 530 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  58.45 
 
 		 506 aa  591  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2318  threonine dehydratase  60.64 
 
 		 519 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  58.37 
 
 		 505 aa  592  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0354  threonine dehydratase  59.16 
 
 		 509 aa  585  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  56.83 
 
 		 503 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  56.51 
 
 		 514 aa  578  1e-164  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0676  threonine dehydratase  57.86 
 
 		 503 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1177  threonine dehydratase  57.43 
 
 		 523 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5252  threonine dehydratase, biosynthetic  58.93 
 
 		 515 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.871195  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3288  threonine dehydratase, biosynthetic  58.25 
 
 		 514 aa  565  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172901  normal  0.134421 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0087  threonine dehydratase  58.45 
 
 		 504 aa  568  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3223  threonine dehydratase, biosynthetic  57.03 
 
 		 512 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3256  threonine dehydratase, biosynthetic  57.23 
 
 		 510 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3269  threonine dehydratase  56.52 
 
 		 502 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579031  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  55.88 
 
 		 531 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  55.6 
 
 		 506 aa  559  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3032  threonine dehydratase, biosynthetic  57.23 
 
 		 550 aa  561  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.08767 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  55.6 
 
 		 506 aa  559  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0627  threonine dehydratase, biosynthetic  58.23 
 
 		 509 aa  560  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.554958 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  55.49 
 
 		 507 aa  556  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3338  threonine dehydratase, biosynthetic  57.68 
 
 		 511 aa  553  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4161  threonine dehydratase  57.03 
 
 		 516 aa  552  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  53.27 
 
 		 501 aa  553  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4847  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  56.95 
 
 		 522 aa  548  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0309858  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  53.95 
 
 		 511 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  53.15 
 
 		 514 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  53.36 
 
 		 511 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4344  threonine dehydratase  55.58 
 
 		 545 aa  546  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  53.74 
 
 		 515 aa  546  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0696  threonine dehydratase, biosynthetic  59.72 
 
 		 507 aa  542  1e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  53.37 
 
 		 507 aa  543  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1820  threonine dehydratase, biosynthetic  55.91 
 
 		 505 aa  543  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  52.8 
 
 		 526 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4125  threonine dehydratase  55.42 
 
 		 531 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  53.36 
 
 		 509 aa  538  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3931  threonine dehydratase  55.42 
 
 		 531 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  52.38 
 
 		 507 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0365  threonine dehydratase  55.82 
 
 		 557 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3661  threonine dehydratase  55.82 
 
 		 557 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0425  threonine dehydratase  55.23 
 
 		 523 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  52.58 
 
 		 507 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0359  threonine dehydratase  55.82 
 
 		 547 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  52.78 
 
 		 507 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4006  threonine dehydratase  55.42 
 
 		 531 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4123  threonine dehydratase  56.04 
 
 		 510 aa  536  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4756  threonine dehydratase  54.82 
 
 		 514 aa  535  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.547271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1605  threonine dehydratase, biosynthetic  53.91 
 
 		 506 aa  535  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.677814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002037  threonine dehydratase biosynthetic  56.02 
 
 		 515 aa  538  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4028  threonine dehydratase  55.42 
 
 		 531 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640825  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2492  threonine dehydratase  55.82 
 
 		 510 aa  535  1e-151  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0349  threonine dehydratase  55.95 
 
 		 516 aa  537  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3647  threonine dehydratase  54.56 
 
 		 516 aa  537  1e-151  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0446  threonine dehydratase  56.24 
 
 		 516 aa  532  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0293  threonine dehydratase  55.95 
 
 		 516 aa  533  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3611  threonine dehydratase  55.03 
 
 		 536 aa  535  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3772  threonine dehydratase  54.22 
 
 		 514 aa  532  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.450956  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00414  threonine dehydratase  56 
 
 		 515 aa  532  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  52.57 
 
 		 513 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1311  threonine dehydratase, biosynthetic  55.91 
 
 		 503 aa  528  1e-149  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.484078  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  52.29 
 
 		 507 aa  531  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5206  threonine dehydratase  54.93 
 
 		 514 aa  529  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0142  threonine dehydratase  54.42 
 
 		 514 aa  530  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4139  threonine dehydratase  54.93 
 
 		 515 aa  529  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0936158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  51.95 
 
 		 549 aa  530  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15381  threonine dehydratase  54.35 
 
 		 514 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.313826 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1280  threonine dehydratase  53.31 
 
 		 505 aa  529  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4284  threonine dehydratase  54.93 
 
 		 514 aa  529  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.976418  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4147  threonine dehydratase  54.93 
 
 		 514 aa  528  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1900  threonine dehydratase, biosynthetic  53.52 
 
 		 506 aa  529  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1083  threonine dehydratase  52.02 
 
 		 529 aa  530  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715043  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03650  threonine dehydratase  54.93 
 
 		 514 aa  527  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4204  threonine dehydratase, biosynthetic  54.93 
 
 		 514 aa  526  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806906  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4230  threonine dehydratase  54.93 
 
 		 515 aa  527  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03599  hypothetical protein  54.93 
 
 		 514 aa  527  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00379045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>