247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4128 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 
183 aa  368  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.85 
 
 
182 aa  273  7e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.58 
 
 
174 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.27 
 
 
182 aa  272  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.72 
 
 
174 aa  272  3e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.84 
 
 
172 aa  271  4.0000000000000004e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.42 
 
 
176 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.56 
 
 
176 aa  271  5.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.68 
 
 
179 aa  268  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03517  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.94 
 
 
174 aa  267  7e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839153  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.67 
 
 
174 aa  267  8e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.84 
 
 
185 aa  266  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.14 
 
 
175 aa  264  5e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5000  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.61 
 
 
176 aa  263  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4874  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.61 
 
 
176 aa  263  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441904  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5050  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.61 
 
 
176 aa  263  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.93 
 
 
172 aa  263  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4429  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.09 
 
 
174 aa  261  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3781  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.09 
 
 
174 aa  261  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171501  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0531  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.51 
 
 
174 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00786303  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.51 
 
 
174 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.59 
 
 
204 aa  260  6.999999999999999e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4792  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.32 
 
 
176 aa  260  8.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.18 
 
 
187 aa  259  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.19 
 
 
179 aa  259  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.76 
 
 
177 aa  259  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.59 
 
 
181 aa  259  2e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0464  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.44 
 
 
176 aa  258  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.958298  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0004  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.4 
 
 
184 aa  258  5.0000000000000005e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4162  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.84 
 
 
174 aa  255  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5140  heat shock protein HslV  76.61 
 
 
176 aa  255  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0473  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.84 
 
 
174 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3521  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.84 
 
 
174 aa  255  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0434  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.84 
 
 
174 aa  255  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3699  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.84 
 
 
174 aa  255  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.085186  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0463  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.84 
 
 
174 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3867  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.84 
 
 
174 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0395  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.61 
 
 
176 aa  255  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00724  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.23 
 
 
183 aa  254  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  66.48 
 
 
180 aa  255  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.5 
 
 
183 aa  254  4e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0114  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.77 
 
 
176 aa  254  5e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45380  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.43 
 
 
180 aa  254  7e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479981  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3361  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.09 
 
 
174 aa  253  9e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66770  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.68 
 
 
177 aa  253  9e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03817  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.61 
 
 
176 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4053  20S proteasome A and B subunits  67.61 
 
 
176 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4468  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.61 
 
 
176 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4164  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.61 
 
 
176 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.64 
 
 
178 aa  253  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0529  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.26 
 
 
174 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0447  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.26 
 
 
174 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5389  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.61 
 
 
176 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4374  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.61 
 
 
176 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.712688 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03766  hypothetical protein  67.61 
 
 
176 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4414  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.61 
 
 
176 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0890704  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4086  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.61 
 
 
176 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4492  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.18 
 
 
176 aa  252  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4422  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.18 
 
 
176 aa  252  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0166  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.35 
 
 
176 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4424  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.18 
 
 
176 aa  252  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.36 
 
 
174 aa  252  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5790  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.1 
 
 
182 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.36 
 
 
174 aa  252  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3797  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.19 
 
 
176 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4338  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.18 
 
 
176 aa  252  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4103  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.36 
 
 
174 aa  252  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4308  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.18 
 
 
176 aa  252  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0180  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.35 
 
 
176 aa  251  5.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.05 
 
 
176 aa  251  6e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.86 
 
 
178 aa  249  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0397  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.44 
 
 
192 aa  248  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.848683 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2545  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.05 
 
 
196 aa  249  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0839  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.05 
 
 
184 aa  248  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.34 
 
 
183 aa  248  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.08 
 
 
184 aa  248  4e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.43 
 
 
181 aa  247  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3982  ATP-dependent protease peptidase subunit  68 
 
 
175 aa  246  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.59 
 
 
186 aa  244  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.48 
 
 
184 aa  244  6.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.02 
 
 
190 aa  243  9e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.48 
 
 
184 aa  243  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.46 
 
 
188 aa  243  9.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 
184 aa  243  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 
178 aa  241  3.9999999999999997e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.25 
 
 
184 aa  240  9e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.14 
 
 
193 aa  238  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2991  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.14 
 
 
181 aa  237  5.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3264  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.91 
 
 
185 aa  236  9e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 
181 aa  237  9e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.29 
 
 
182 aa  235  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.07 
 
 
194 aa  235  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4309  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.8 
 
 
175 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.5 
 
 
176 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0165  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 
214 aa  232  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.183873  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3436  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.71 
 
 
182 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.834588  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0386  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 
178 aa  231  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0191  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 
178 aa  231  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.834819  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0201  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 
178 aa  231  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3432  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 
178 aa  231  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>