More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4108 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4108  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
399 aa  784    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000328051 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0840  inner-membrane translocator  81.25 
 
 
410 aa  634  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229373  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2747  inner-membrane translocator  66.67 
 
 
394 aa  533  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3072  monosaccharide-transporting ATPase  65.12 
 
 
396 aa  504  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372878  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3906  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  65.83 
 
 
399 aa  499  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0935  sugar ABC transporter, permease protein  64.56 
 
 
396 aa  496  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.968429  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1426  monosaccharide-transporting ATPase  65.54 
 
 
400 aa  495  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0877  sugar ABC transporter, permease protein  65.79 
 
 
383 aa  492  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3198  monosaccharide-transporting ATPase  66.84 
 
 
414 aa  491  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.126152 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3173  inner-membrane translocator  63.31 
 
 
403 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2139  putative L-arabinose transport system permease protein araH  63.82 
 
 
396 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4475  monosaccharide-transporting ATPase  62.84 
 
 
404 aa  475  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.826899  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2912  inner-membrane translocator  62.02 
 
 
403 aa  471  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116339  normal  0.80082 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2252  inner-membrane translocator  66.75 
 
 
410 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000044762 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0739  inner-membrane translocator  63.82 
 
 
402 aa  449  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1047  inner-membrane translocator  68.21 
 
 
404 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3661  monosaccharide-transporting ATPase  58.71 
 
 
405 aa  418  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0613  monosaccharide-transporting ATPase  57.43 
 
 
410 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2684  inner-membrane translocator  55.7 
 
 
403 aa  392  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0385  inner-membrane translocator  51.96 
 
 
429 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2891  inner-membrane translocator  51.23 
 
 
408 aa  354  2e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122245  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1985  inner-membrane translocator  52.7 
 
 
390 aa  350  3e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0406  inner-membrane translocator  48.45 
 
 
393 aa  343  2e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.335145  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27970  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  49.07 
 
 
393 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284991  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0758  inner-membrane translocator  55.61 
 
 
432 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0294361  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29460  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  50.26 
 
 
393 aa  311  1e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2996  Monosaccharide-transporting ATPase  48.41 
 
 
392 aa  310  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0240  inner-membrane translocator  47.92 
 
 
420 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0784827  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1587  monosaccharide-transporting ATPase  43.42 
 
 
392 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042672  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4717  inner-membrane translocator  46.9 
 
 
412 aa  304  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1861  xylose ABC transporter permease  42.49 
 
 
405 aa  299  6e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0485128  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2513  inner-membrane translocator  44.85 
 
 
392 aa  298  8e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2518  inner-membrane translocator  49.08 
 
 
410 aa  296  5e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1866  inner-membrane translocator  48.44 
 
 
405 aa  295  8e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0645389  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1180  Monosaccharide-transporting ATPase  46.58 
 
 
426 aa  295  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000448085 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0158  monosaccharide-transporting ATPase  43.92 
 
 
388 aa  293  4e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2944  Monosaccharide-transporting ATPase  45.61 
 
 
408 aa  292  7e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.293964  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0753  inner-membrane translocator  46.09 
 
 
390 aa  289  5.0000000000000004e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0682219  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1103  inner-membrane translocator  47.11 
 
 
423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.660627  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19480  Monosaccharide-transporting ATPase  40 
 
 
383 aa  283  5.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2578  inner-membrane translocator  44.53 
 
 
399 aa  282  7.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.270566 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0504  Monosaccharide-transporting ATPase  48.41 
 
 
392 aa  282  8.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2020  inner-membrane translocator  39.5 
 
 
397 aa  281  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.232129  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1867  monosaccharide-transporting ATPase  39.47 
 
 
376 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3403  inner-membrane translocator  42.82 
 
 
452 aa  279  7e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.22909 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0228  monosaccharide-transporting ATPase  42.31 
 
 
396 aa  277  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0258  Monosaccharide-transporting ATPase  39.39 
 
 
420 aa  272  7e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501075  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0774  Monosaccharide-transporting ATPase  43.06 
 
 
403 aa  269  5.9999999999999995e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0107  Monosaccharide-transporting ATPase  43.27 
 
 
373 aa  268  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4434  inner-membrane translocator  39.04 
 
 
393 aa  265  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4152  inner-membrane translocator  38.79 
 
 
393 aa  263  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1668  monosaccharide-transporting ATPase  41.21 
 
 
390 aa  261  1e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.120598  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4099  putative xylose transport system permease protein XylH  38.79 
 
 
394 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4156  sugar transport system permease  38.79 
 
 
394 aa  261  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0101  monosaccharide-transporting ATPase  39.9 
 
 
394 aa  260  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0059  monosaccharide-transporting ATPase  38.52 
 
 
394 aa  259  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3040  inner-membrane translocator  40.91 
 
 
381 aa  259  7e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0153  inner-membrane translocator  38.86 
 
 
393 aa  257  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03420  D-xylose transporter subunit  38.9 
 
 
393 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03371  hypothetical protein  38.9 
 
 
393 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0142  Monosaccharide-transporting ATPase  38.65 
 
 
393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3954  D-xylose ABC transporter, permease protein  38.65 
 
 
393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3771  D-xylose ABC transporter, permease protein  38.65 
 
 
393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0146  monosaccharide-transporting ATPase  38.65 
 
 
393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3891  D-xylose ABC transporter, permease protein  38.65 
 
 
393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4944  D-xylose ABC transporter, permease protein  38.65 
 
 
393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0184849 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4064  D-xylose ABC transporter, permease protein  38.4 
 
 
393 aa  251  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0063  inner-membrane translocator  38.13 
 
 
394 aa  250  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0081  inner-membrane translocator  40.43 
 
 
390 aa  248  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2339  monosaccharide-transporting ATPase  40.33 
 
 
398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138041  normal  0.022566 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6325  monosaccharide-transporting ATPase  39.08 
 
 
399 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38895 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0584  D-xylose ABC transporter, permease  40.87 
 
 
357 aa  243  5e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4076  Monosaccharide-transporting ATPase  38.81 
 
 
400 aa  242  7e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.784913  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4188  Monosaccharide-transporting ATPase  38.81 
 
 
400 aa  242  7e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2619  ABC D-xylose transporter, inner membrane subunit  38.39 
 
 
399 aa  242  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6502  inner-membrane translocator  39.08 
 
 
399 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6736  inner-membrane translocator  39.08 
 
 
399 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254772  normal  0.595345 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6630  Monosaccharide-transporting ATPase  37.41 
 
 
399 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3005  D-xylose ABC transporter, permease protein  38.12 
 
 
378 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121536  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0905  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.73 
 
 
400 aa  226  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6336  inner-membrane translocator  37.63 
 
 
399 aa  222  8e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3416  monosaccharide-transporting ATPase  37.18 
 
 
389 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00105488  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6036  monosaccharide-transporting ATPase  37.37 
 
 
399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.182695  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4211  monosaccharide-transporting ATPase  37 
 
 
405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6622  inner-membrane translocator  38.58 
 
 
369 aa  219  7e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000790892 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2886  inner-membrane translocator  38.38 
 
 
378 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.120464  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2341  sugar ABC transporter, permease protein  37.64 
 
 
399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.718143  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2300  inner-membrane translocator  36.66 
 
 
378 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1752  inner-membrane translocator  38.5 
 
 
406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.090223  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1057  D-xylose ABC transporter, permease protein  39.45 
 
 
427 aa  209  8e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483345  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1152  D-xylose ABC transporter, permease protein  39.39 
 
 
389 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2841  inner-membrane translocator  35.48 
 
 
432 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1179  ABC sugar (xylose) transporter, inner membrane subunit  35.48 
 
 
432 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3838  Monosaccharide-transporting ATPase  37.98 
 
 
402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.660821 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4915  Monosaccharide-transporting ATPase  37.98 
 
 
402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3175  inner-membrane translocator  32.56 
 
 
432 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235979  normal  0.918158 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2618  inner-membrane translocator  35.07 
 
 
432 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.40748  normal  0.342974 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1999  xylose transport system permease protein  32.71 
 
 
435 aa  193  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222102  normal  0.247707 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1211  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  37.71 
 
 
437 aa  190  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.462112  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4466  inner-membrane translocator  37.07 
 
 
444 aa  189  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>