More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4095 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4095  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137114 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  38.81 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 223 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  33.85 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  34.83 
 
 		 225 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 223 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 233 aa  108  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  35.58 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  37.81 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 206 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  36.02 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  32.16 
 
 		 222 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  31.66 
 
 		 222 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 223 aa  98.2  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1970  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 225 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 240 aa  94.4  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3521  GntR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1651  transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 		 242 aa  92.4  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  32.77 
 
 		 226 aa  91.7  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 268 aa  89  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5066  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 232 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 267 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  27.84 
 
 		 218 aa  85.9  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 257 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 217 aa  85.5  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 260 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0182  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 229 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0163  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 229 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281276 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 257 aa  84.7  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0181  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454577  normal  0.894817 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3609  transcriptional regulator, GntR family  35.03 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2063  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00486577  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2320  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5454  transcriptional regulator, GntR family  32.68 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  27.85 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  27.85 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11670  transcriptional regulator  30.85 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  29.77 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5008  transcriptional regulator GntR  32.68 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0628  GntR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  29.03 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1245  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  28.92 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  26.83 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  28.08 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2775  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2466  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  28.79 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2122  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 241 aa  68.2  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7518  transcriptional regulator  32.37 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  28.27 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>