78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4064 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4064  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  635    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0525  hypothetical protein  51.95 
 
 		 329 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3427  hypothetical protein  51.62 
 
 		 329 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3601  hypothetical protein  51.62 
 
 		 329 aa  309  4e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4040  integral membrane domain-containing protein  52.13 
 
 		 349 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0579  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.65 
 
 		 324 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0549  hypothetical protein  50.82 
 
 		 324 aa  298  9e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0573  hypothetical protein  50.32 
 
 		 324 aa  298  9e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3761  hypothetical protein  50.32 
 
 		 324 aa  298  9e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0634  hypothetical protein  50.32 
 
 		 339 aa  296  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3715  hypothetical protein  49.83 
 
 		 322 aa  280  3e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0631  hypothetical protein  48.28 
 
 		 320 aa  276  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.789426 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0565  hypothetical protein  50.32 
 
 		 325 aa  275  6e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0498  integral membrane domain-containing protein  46.45 
 
 		 316 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1686  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.658717 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3663  hypothetical protein  33.97 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4094  hypothetical protein  32.09 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1729  hypothetical protein  33.23 
 
 		 320 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35536  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3352  membrane protein  36.52 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4978  hypothetical protein  35.55 
 
 		 305 aa  149  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3975  hypothetical protein  33.11 
 
 		 312 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1345  hypothetical protein  31.89 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0815858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3610  integral membrane protein  31.91 
 
 		 328 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000195591  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3976  hypothetical protein  31.91 
 
 		 312 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000242668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3755  hypothetical protein  31.91 
 
 		 328 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000395481  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3961  hypothetical protein  32.58 
 
 		 324 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.761458  normal  0.0378456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1753  hypothetical protein  32.48 
 
 		 324 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1361  hypothetical protein  32.04 
 
 		 320 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00507818  normal  0.397175 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0795  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.94 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0475  hypothetical protein  30.9 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000164528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0560  hypothetical protein  31.27 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00477006  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3620  hypothetical protein  30.87 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000693359  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3494  putative transporter  30.87 
 
 		 321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00919199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3492  putative transporter  30.87 
 
 		 321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543428  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3599  putative transporter  30.87 
 
 		 321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0879234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3563  putative transporter  30.87 
 
 		 321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0151883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0516  hypothetical protein  30.2 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000278585  hitchhiker  0.00919443 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03000  hypothetical protein  30.2 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00567967  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3480  putative transporter  30.2 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000496501  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.2 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000715039  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3669  putative transporter  30.2 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000521429  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3377  putative transporter  30.2 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.82024e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03049  conserved inner membrane protein  30.2 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00601022  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3586  putative transporter  30.2 
 
 		 321 aa  123  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000241  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 314 aa  116  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000192809  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4506  putative transporter  30.2 
 
 		 321 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000436684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.1 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00208172  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0247  hypothetical protein  28.34 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00278162  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2232  hypothetical protein  32.38 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  25.79 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  27.87 
 
 		 291 aa  50.1  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  34.62 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  35.58 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.79 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  25.96 
 
 		 305 aa  46.2  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  25 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  26.36 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  32.69 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  23.81 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  26.58 
 
 		 316 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  27.31 
 
 		 289 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  26.64 
 
 		 296 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  26.64 
 
 		 296 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  26.64 
 
 		 296 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.48 
 
 		 310 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15760  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  23.92 
 
 		 327 aa  43.1  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.941518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.14 
 
 		 296 aa  43.1  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  29.5 
 
 		 313 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  29.5 
 
 		 313 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.4 
 
 		 308 aa  42.7  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  29.5 
 
 		 313 aa  42.7  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  29.5 
 
 		 313 aa  42.7  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  29.5 
 
 		 313 aa  42.7  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  23.14 
 
 		 308 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  29.5 
 
 		 313 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  29.5 
 
 		 313 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  26.58 
 
 		 395 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  25.37 
 
 		 287 aa  42.4  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>