More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4047 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 
316 aa  643    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  45.03 
 
 
318 aa  276  5e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0804  thiamine-monophosphate kinase  46.75 
 
 
319 aa  270  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.914964  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  44.44 
 
 
323 aa  261  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  44.44 
 
 
336 aa  259  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  43.85 
 
 
319 aa  259  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  44.62 
 
 
325 aa  256  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  44.44 
 
 
319 aa  256  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  45.03 
 
 
323 aa  255  7e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  44.62 
 
 
325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  44.62 
 
 
325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  44.62 
 
 
325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  44.62 
 
 
325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  44.62 
 
 
325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  43.21 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  43.52 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  44.62 
 
 
325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  48.25 
 
 
315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  43.31 
 
 
334 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  43.52 
 
 
323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  43.52 
 
 
323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  44.62 
 
 
325 aa  253  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  44.31 
 
 
325 aa  253  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  41.99 
 
 
321 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  41.93 
 
 
319 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  44.48 
 
 
318 aa  251  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  43.48 
 
 
325 aa  248  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  42.55 
 
 
318 aa  248  7e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  42.55 
 
 
318 aa  248  8e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  44.51 
 
 
326 aa  248  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  44.51 
 
 
326 aa  248  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  44.51 
 
 
326 aa  248  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  42.55 
 
 
318 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  42.55 
 
 
324 aa  248  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  43.17 
 
 
327 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  44.21 
 
 
326 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  46.67 
 
 
325 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  44.1 
 
 
324 aa  246  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  45.12 
 
 
323 aa  246  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  45.2 
 
 
326 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  41.93 
 
 
318 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0927  thiamine-monophosphate kinase  41.14 
 
 
330 aa  245  6.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.93501  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  44.72 
 
 
326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  43.33 
 
 
329 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  40.56 
 
 
320 aa  243  3.9999999999999997e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  41.59 
 
 
333 aa  242  6e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  43.03 
 
 
329 aa  242  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  43.33 
 
 
329 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  49.08 
 
 
317 aa  239  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  44.11 
 
 
331 aa  238  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0604  thiamine monophosphate kinase  39.13 
 
 
325 aa  238  1e-61  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0648083  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0565  thiamine monophosphate kinase  43.34 
 
 
322 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0519  thiamine monophosphate kinase  43.87 
 
 
322 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  41.72 
 
 
332 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0554  thiamine monophosphate kinase  43.96 
 
 
322 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  40.68 
 
 
339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  41.12 
 
 
334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2848  thiamine monophosphate kinase  46.67 
 
 
326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  42.51 
 
 
320 aa  233  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3712  thiamine monophosphate kinase  43.96 
 
 
332 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.0722604 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004260  thiamine-monophosphate kinase  41.43 
 
 
321 aa  232  8.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0240227  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01171  thiamine monophosphate kinase  41.12 
 
 
321 aa  231  9e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  43.96 
 
 
321 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0572  thiamine monophosphate kinase  47.33 
 
 
319 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  42.86 
 
 
323 aa  230  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  41.81 
 
 
332 aa  229  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4457  thiamine monophosphate kinase  46.38 
 
 
321 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1843  thiamine monophosphate kinase  43.26 
 
 
324 aa  228  1e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.523623  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0147  thiamine monophosphate kinase  43.29 
 
 
332 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0630  thiamine monophosphate kinase  43.29 
 
 
332 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0598  thiamine monophosphate kinase  43.62 
 
 
332 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.343428 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1903  thiamine monophosphate kinase  43.26 
 
 
324 aa  227  2e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  40.68 
 
 
318 aa  227  3e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0555  thiamine monophosphate kinase  46.3 
 
 
344 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0531  thiamine monophosphate kinase  45.96 
 
 
332 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  40.99 
 
 
318 aa  226  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  37.46 
 
 
320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  37.46 
 
 
320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  41.84 
 
 
332 aa  225  7e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  43.21 
 
 
315 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2241  thiamine-monophosphate kinase  39.76 
 
 
335 aa  222  4.9999999999999996e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06770  thiamine monophosphate kinase  49.45 
 
 
321 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3453  thiamine-phosphate kinase  40.95 
 
 
334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  43.03 
 
 
322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11460  thiamine monophosphate kinase  42.41 
 
 
322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0770171  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2755  thiamine monophosphate kinase  45.59 
 
 
332 aa  220  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.281901  normal  0.6872 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  41.27 
 
 
326 aa  219  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0695  thiamine monophosphate kinase  43.34 
 
 
321 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  40.81 
 
 
317 aa  218  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1188  thiamine monophosphate kinase  41.22 
 
 
333 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0380  thiamine-monophosphate kinase  42.02 
 
 
321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.450658  normal  0.175688 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1653  thiamine-monophosphate kinase  41.88 
 
 
325 aa  216  4e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0108412  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0529  thiamine-monophosphate kinase  41.69 
 
 
335 aa  216  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0957799  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  41.88 
 
 
332 aa  215  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  40.88 
 
 
333 aa  215  9e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  40.88 
 
 
333 aa  215  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  40.88 
 
 
333 aa  215  9e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  40.88 
 
 
333 aa  215  9e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  40.88 
 
 
333 aa  215  9e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  40.88 
 
 
333 aa  215  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>