More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4042 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  100 
 
 		 526 aa  1054    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  56.26 
 
 		 538 aa  600  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  54.72 
 
 		 530 aa  578  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3436  choline/carnitine/betaine transporter  53.85 
 
 		 526 aa  546  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.97143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1384  choline/carnitine/betaine transporter  54.76 
 
 		 524 aa  540  9.999999999999999e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.095402  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5374  choline/carnitine/betaine transporter family protein  45.71 
 
 		 567 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.985383  normal  0.22306 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001291  choline/carnitine/betaine transporter family protein  45.02 
 
 		 578 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.335478  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0309  choline/carnitine/betaine transporter  45.47 
 
 		 552 aa  468  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.670789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  48.48 
 
 		 659 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  48.28 
 
 		 659 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  45.55 
 
 		 657 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  46.67 
 
 		 661 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  45.55 
 
 		 551 aa  448  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0174  choline/carnitine/betaine transporter  49.21 
 
 		 541 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.525828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  46.87 
 
 		 661 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1851  choline/carnitine/betaine transporter  44.6 
 
 		 543 aa  450  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.993809  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  45.38 
 
 		 545 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2029  choline/carnitine/betaine transporter  42.22 
 
 		 558 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  45.51 
 
 		 542 aa  433  1e-120  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  46.06 
 
 		 550 aa  434  1e-120  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2119  betaine/carnitine/choline transporter family protein  43.57 
 
 		 524 aa  434  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  44.31 
 
 		 637 aa  432  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0421  choline/carnitine/betaine transporter  46.5 
 
 		 661 aa  433  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.45567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  43.89 
 
 		 538 aa  431  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  42.47 
 
 		 606 aa  426  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  44.22 
 
 		 494 aa  425  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  45.71 
 
 		 660 aa  423  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  44.14 
 
 		 656 aa  423  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  42.8 
 
 		 506 aa  419  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04148  secondary glycine betaine transporter BetU  44.75 
 
 		 667 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04111  hypothetical protein  44.75 
 
 		 667 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  44.29 
 
 		 523 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  45.89 
 
 		 503 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3164  choline/carnitine/betaine transporter  45.38 
 
 		 660 aa  415  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  42.94 
 
 		 505 aa  412  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  42.94 
 
 		 505 aa  412  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4850  BCCT family transporter  44.55 
 
 		 667 aa  414  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0764  transporter, BCCT family  45.1 
 
 		 667 aa  415  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.846408  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1805  choline/carnitine/betaine transporter  44.68 
 
 		 664 aa  414  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.376035  hitchhiker  0.00814736 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  42.94 
 
 		 505 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  41.95 
 
 		 505 aa  412  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  42.94 
 
 		 505 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  42.89 
 
 		 505 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  42.86 
 
 		 505 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  42.95 
 
 		 504 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1301  BCCT family betaine/choline/carnitine/glycine transporter  43.69 
 
 		 682 aa  411  1e-113  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  42.86 
 
 		 505 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  41.97 
 
 		 667 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  40.33 
 
 		 573 aa  411  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1610  hypothetical protein  43.02 
 
 		 646 aa  409  1e-113  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00096761  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  42.95 
 
 		 504 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1362  choline/carnitine/betaine transport  45.89 
 
 		 673 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000623924  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2741  choline/carnitine/betaine transporter  45.27 
 
 		 661 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  44.37 
 
 		 504 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1505  choline/carnitine/betaine transporter  45.81 
 
 		 668 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  42.48 
 
 		 498 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0154  choline/carnitine/betaine transporter  44.84 
 
 		 682 aa  402  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1441  choline/carnitine/betaine transporter  45.16 
 
 		 658 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2804  choline/carnitine/betaine transporter  45.49 
 
 		 658 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1003  choline/carnitine/betaine transporter  41.97 
 
 		 553 aa  402  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1576  choline/carnitine/betaine transporter  45.49 
 
 		 658 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1542  choline/carnitine/betaine transporter  45.49 
 
 		 658 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.869304  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0600  choline/carnitine/betaine transporter  40.99 
 
 		 584 aa  398  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000857259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3532  choline/carnitine/betaine transporter  43.03 
 
 		 556 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1546  choline/carnitine/betaine transporter  45.29 
 
 		 658 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  43.95 
 
 		 516 aa  393  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13950  choline/carnitine/betaine transport  40.22 
 
 		 568 aa  394  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3298  BCCT transporter  50.76 
 
 		 491 aa  392  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0066  choline/carnitine/betaine transporter  43 
 
 		 583 aa  392  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.432279  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  43.21 
 
 		 516 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  43 
 
 		 516 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  43 
 
 		 516 aa  389  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  39.29 
 
 		 567 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  43 
 
 		 516 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1337  choline/carnitine/betaine transport  45.32 
 
 		 687 aa  389  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  43.21 
 
 		 516 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  43.21 
 
 		 516 aa  392  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1077  choline/carnitine/betaine transport  44.4 
 
 		 682 aa  390  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.892042  normal  0.109945 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1175  choline/carnitine/betaine transport  44.11 
 
 		 658 aa  391  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0833615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  43.56 
 
 		 497 aa  389  1e-107  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  42.6 
 
 		 685 aa  390  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  43 
 
 		 516 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2552  choline/carnitine/betaine transporter  43.89 
 
 		 658 aa  389  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  43.21 
 
 		 516 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2719  choline/carnitine/betaine transporter  43.69 
 
 		 658 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  42.39 
 
 		 516 aa  383  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1055  choline/carnitine/betaine transporter  42.26 
 
 		 520 aa  385  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.144567  normal  0.0392371 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2619  choline/carnitine/betaine transporter  43.49 
 
 		 658 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000908403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1512  choline transport protein BetT  40.62 
 
 		 679 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0971262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0240  choline/carnitine/betaine transporter  43.74 
 
 		 662 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0077  choline/carnitine/betaine transporter  44.63 
 
 		 546 aa  384  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  41.48 
 
 		 606 aa  381  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  42.54 
 
 		 532 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0224  high-affinity choline transport protein  40.61 
 
 		 644 aa  379  1e-104  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  39.76 
 
 		 534 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01511  putative high-affinity choline transport protein  43.94 
 
 		 676 aa  376  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2557  choline transport protein BetT  41.35 
 
 		 677 aa  376  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5310  choline/carnitine/betaine transporter  41.68 
 
 		 698 aa  375  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.910175  normal  0.618905 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  40.52 
 
 		 490 aa  378  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  39.39 
 
 		 508 aa  378  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>