More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3918 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3918  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 235 aa  483  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.306871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7094  transcriptional regulator, GntR family  40.87 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4140  GntR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 219 aa  169  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00242001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5954  transcriptional regulator, GntR family  38.94 
 
 		 222 aa  165  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0377161 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5700  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 247 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5953  transcriptional regulator, GntR family  33.8 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal  0.0380656 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7093  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4153  GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.947697  normal  0.614884 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4309  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 243 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.405303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1198  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 245 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8640  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.395019  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3790  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000195314  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0156  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5583  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42685 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3365  GntR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 247 aa  115  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3459  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3108  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00120217  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3023  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 236 aa  111  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3083  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4680  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895143  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1743  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 219 aa  108  8.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.821551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0224  transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5719  transcriptional regulator, GntR family  30.24 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0204  GntR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 262 aa  99.4  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3152  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.26318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5085  transcriptional regulator GntR family  31.55 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2875  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  30.05 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2783  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  30.05 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.987951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3903  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4641  transcriptional regulator, GntR family  38.13 
 
 		 249 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.220796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0960  transcriptional regulator  31.1 
 
 		 226 aa  96.3  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3565  transcriptional regulator, GntR family  38.13 
 
 		 249 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181866  normal  0.165295 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3165  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 246 aa  95.1  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2908  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  29.11 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00158542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5982  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.28377 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3037  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2933  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 245 aa  93.6  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3933  transcriptional regulator, GntR family  28.23 
 
 		 236 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.787186  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5670  GntR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0876  GntR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 220 aa  92.8  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.398436  normal  0.0490604 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2939  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  31.9 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150864 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2991  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  31.9 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0247222 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3096  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  31.9 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2974  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  31.9 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554532  normal  0.0581705 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2907  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  31.9 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2798  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.197773  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1944  hypothetical protein  29.8 
 
 		 234 aa  90.1  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2973  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 251 aa  85.9  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1997  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  27.93 
 
 		 226 aa  85.9  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3217  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  29.22 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4402  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.225327  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2702  putative transcriptional regulator, GntR family  27.96 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02520  DNA-binding transcriptional dual regulator  29.22 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1019  transcriptional regulator, GntR family  29.22 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2944  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  29.22 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1042  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  29.22 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2799  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  29.22 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2784  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  29.22 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.220351 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02484  hypothetical protein  29.22 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3906  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  29.22 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.429563 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  28.38 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0705  transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00828  hypothetical protein  26.15 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4203  GntR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3891  transcriptional regulator, GntR family  30.74 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  28.17 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  27.86 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001646  transcriptional regulator LuxZ  25 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000706033  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  25.12 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  27.85 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  27.83 
 
 		 262 aa  72  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2145  transcriptional regulator, GntR family  27.8 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  27.83 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1925  GntR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 222 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.554329  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.1 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1235  GntR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2120  GntR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1522  transcriptional regulator, GntR family  25.25 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0576  GntR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.1 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5261  transcriptional regulator, GntR family  28.75 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3621  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  27.01 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  26.92 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>