More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3818 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  100 
 
 		 405 aa  832    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  57.22 
 
 		 383 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  56.54 
 
 		 383 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  47.81 
 
 		 394 aa  331  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  46.34 
 
 		 409 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  46.04 
 
 		 383 aa  309  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  37.43 
 
 		 385 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  34.57 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  34.84 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  33.94 
 
 		 408 aa  196  6e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  35.52 
 
 		 388 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  35.52 
 
 		 388 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  34.83 
 
 		 376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  35.73 
 
 		 382 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  35.36 
 
 		 382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  35.09 
 
 		 382 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  30.95 
 
 		 391 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  32.97 
 
 		 376 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  33.16 
 
 		 378 aa  169  7e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  33.24 
 
 		 377 aa  167  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  34.57 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  34.3 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  33.86 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.08 
 
 		 363 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  32.24 
 
 		 376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  34.38 
 
 		 385 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  31.83 
 
 		 376 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  32.72 
 
 		 376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  30.13 
 
 		 388 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  31.77 
 
 		 376 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  30.26 
 
 		 413 aa  145  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  30.16 
 
 		 413 aa  143  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.19 
 
 		 358 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.19 
 
 		 358 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  31.56 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  29.52 
 
 		 409 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  28.27 
 
 		 394 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  31.37 
 
 		 372 aa  139  8.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  31.25 
 
 		 376 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  31.85 
 
 		 375 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  33.05 
 
 		 420 aa  136  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  35.97 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  29.37 
 
 		 372 aa  133  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  28.08 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  32.7 
 
 		 407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  31.34 
 
 		 407 aa  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  31.68 
 
 		 388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6820  peptidase M20  33.05 
 
 		 412 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  decreased coverage  0.0081642 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  30.97 
 
 		 432 aa  126  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  28.98 
 
 		 376 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  28.94 
 
 		 410 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5703  peptidase M20  30.61 
 
 		 405 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0934  Glutamate carboxypeptidase  31.59 
 
 		 391 aa  123  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3983  peptidase dimerization domain protein  31.62 
 
 		 381 aa  122  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  29.62 
 
 		 409 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  29.21 
 
 		 415 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  29.85 
 
 		 429 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1858  hypothetical protein  27.86 
 
 		 423 aa  117  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0460852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12450  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  34.31 
 
 		 376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  28.53 
 
 		 376 aa  116  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  28.13 
 
 		 436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  29.64 
 
 		 418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  28.57 
 
 		 412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  26.6 
 
 		 436 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  26.85 
 
 		 436 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  26.72 
 
 		 416 aa  110  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  27.16 
 
 		 438 aa  110  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1688  hypothetical protein  31.46 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  25.94 
 
 		 428 aa  107  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3250  peptidase M20  27.93 
 
 		 424 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  26.72 
 
 		 424 aa  93.6  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  27.63 
 
 		 402 aa  90.9  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0524  peptidase, M20/M25/M40 family  26.24 
 
 		 432 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1297  peptidase M20  27.07 
 
 		 434 aa  87.8  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0144616  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  24.68 
 
 		 417 aa  87.4  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  27.81 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4723  peptidase M20  26.28 
 
 		 441 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  29.93 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0884  hypothetical protein  28.44 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5606  peptidase M20  28.31 
 
 		 422 aa  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  24.93 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1901  peptidase M20  28.32 
 
 		 403 aa  76.3  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296335  normal  0.958689 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  29.9 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  24.81 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0238  peptidase M20  25.96 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489939  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  23.86 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  24.94 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3442  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.32 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2393  peptidase dimerisation domain protein  26.67 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000137501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  26.79 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0323  peptidase T-like protein  25.33 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0775  hypothetical protein  24.65 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0167319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1422  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.15 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3277  peptidase M20:peptidase dimerisation  26.91 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1109  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.29 
 
 		 409 aa  67  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.47 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  25.62 
 
 		 368 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0720  peptidase M20  26.96 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.611917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0276  peptidase M20  31.43 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.66 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>