More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3765 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 433 aa  867    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  70.67 
 
 		 434 aa  620  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  70.21 
 
 		 434 aa  616  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  69.28 
 
 		 434 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  69.05 
 
 		 434 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  69.52 
 
 		 434 aa  610  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  69.05 
 
 		 434 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  69.05 
 
 		 434 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  68.59 
 
 		 463 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  68.59 
 
 		 434 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  65.67 
 
 		 440 aa  590  1e-167  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39490  homoserine dehydrogenase  67.21 
 
 		 439 aa  581  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3394  homoserine dehydrogenase  68.59 
 
 		 434 aa  567  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  65.52 
 
 		 436 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  62.61 
 
 		 439 aa  555  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  62.53 
 
 		 435 aa  546  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  61.01 
 
 		 437 aa  544  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  61.01 
 
 		 437 aa  544  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  60.92 
 
 		 436 aa  543  1e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0597  homoserine dehydrogenase  63.45 
 
 		 436 aa  538  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  63.82 
 
 		 437 aa  533  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  60.46 
 
 		 436 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1209  homoserine dehydrogenase  62.67 
 
 		 450 aa  530  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0141244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  59.54 
 
 		 436 aa  531  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  61.61 
 
 		 437 aa  522  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  57.6 
 
 		 442 aa  511  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  57.69 
 
 		 443 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  57.6 
 
 		 442 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  57.6 
 
 		 442 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  57.37 
 
 		 442 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  58.81 
 
 		 436 aa  511  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  58.58 
 
 		 436 aa  510  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1281  Homoserine dehydrogenase  63.99 
 
 		 437 aa  511  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  57.24 
 
 		 443 aa  511  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  60.92 
 
 		 436 aa  509  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  58.6 
 
 		 448 aa  510  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  59.36 
 
 		 439 aa  508  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  57.47 
 
 		 443 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  59.36 
 
 		 439 aa  508  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  58.66 
 
 		 433 aa  509  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  57.14 
 
 		 442 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  57.24 
 
 		 447 aa  504  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  57.11 
 
 		 444 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  56.46 
 
 		 442 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1327  homoserine dehydrogenase  59.13 
 
 		 439 aa  500  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.818962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  55.76 
 
 		 440 aa  500  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2454  homoserine dehydrogenase  62.39 
 
 		 436 aa  499  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.38424  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  56.24 
 
 		 442 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  57.53 
 
 		 438 aa  501  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  55.78 
 
 		 449 aa  495  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1385  homoserine dehydrogenase  57.82 
 
 		 442 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2396  homoserine dehydrogenase  57.82 
 
 		 442 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2198  homoserine dehydrogenase  58.28 
 
 		 442 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000198219  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  59.37 
 
 		 449 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  55.53 
 
 		 452 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1875  homoserine dehydrogenase  57.82 
 
 		 442 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2270  homoserine dehydrogenase  57.82 
 
 		 442 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.606772  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1147  homoserine dehydrogenase  57.82 
 
 		 442 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0258107  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2232  homoserine dehydrogenase  57.82 
 
 		 442 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0022  homoserine dehydrogenase  57.82 
 
 		 442 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  57.44 
 
 		 438 aa  486  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  55.63 
 
 		 436 aa  472  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  55.4 
 
 		 440 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2559  homoserine dehydrogenase  55.51 
 
 		 453 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3206  homoserine dehydrogenase  55.29 
 
 		 453 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2663  homoserine dehydrogenase  55.3 
 
 		 444 aa  471  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1541  homoserine dehydrogenase  57.53 
 
 		 438 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2010  homoserine dehydrogenase  55.98 
 
 		 445 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000414031  normal  0.35034 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0253  homoserine dehydrogenase  56.38 
 
 		 448 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000322184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0279  homoserine dehydrogenase  55.93 
 
 		 448 aa  448  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00103779  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  46.79 
 
 		 440 aa  414  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  46.79 
 
 		 439 aa  399  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  46.33 
 
 		 436 aa  391  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  45.5 
 
 		 438 aa  386  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  46.56 
 
 		 436 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  46.99 
 
 		 428 aa  383  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  45.41 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  46.33 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  46.24 
 
 		 439 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  45.64 
 
 		 436 aa  381  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  47.25 
 
 		 437 aa  376  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  45.18 
 
 		 436 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2035  Homoserine dehydrogenase  47.82 
 
 		 452 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  44.75 
 
 		 438 aa  365  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  44.04 
 
 		 441 aa  359  6e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  43.65 
 
 		 437 aa  359  7e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1638  homoserine dehydrogenase  45.74 
 
 		 441 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  45.48 
 
 		 430 aa  353  4e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  45.87 
 
 		 430 aa  350  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  43.03 
 
 		 430 aa  350  3e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1298  homoserine dehydrogenase  47.33 
 
 		 429 aa  350  3e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220896  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  45.08 
 
 		 427 aa  347  2e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  45.21 
 
 		 438 aa  346  5e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  44.93 
 
 		 427 aa  346  5e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2222  Homoserine dehydrogenase  44.49 
 
 		 441 aa  345  6e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.212971  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2310  Homoserine dehydrogenase  44.49 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  46.39 
 
 		 423 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  42.36 
 
 		 432 aa  343  2.9999999999999997e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  45.54 
 
 		 432 aa  342  8e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0011  homoserine dehydrogenase  43.92 
 
 		 466 aa  340  2e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>