More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3760 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1477  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.97 
 
 
569 aa  654    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221142  normal  0.152861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4244  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.89 
 
 
569 aa  652    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3760  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 
610 aa  1251    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.671236 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0952  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.2 
 
 
574 aa  635    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0772  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.47 
 
 
574 aa  656    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167693  hitchhiker  0.00446395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1298  RecJ exonuclease  55.32 
 
 
571 aa  643    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882929  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0895  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.69 
 
 
574 aa  637    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647081 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1082  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.79 
 
 
569 aa  650    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0807  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.82 
 
 
574 aa  660    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3641  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.47 
 
 
577 aa  635    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1395  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.12 
 
 
571 aa  657    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0897  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.09 
 
 
574 aa  671    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.72 
 
 
574 aa  639    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3226  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.9 
 
 
574 aa  641    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.62 
 
 
569 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.810057 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16220  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.12 
 
 
571 aa  662    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3329  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.9 
 
 
574 aa  642    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1488  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.5 
 
 
569 aa  633  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0845  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.29 
 
 
577 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0564  ssDNA exonuclease RecJ  54.67 
 
 
579 aa  633  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.755584  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3447  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.47 
 
 
574 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3522  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.29 
 
 
577 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.91 
 
 
572 aa  632  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1035  exonuclease RecJ  54.45 
 
 
569 aa  630  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0892  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.29 
 
 
584 aa  631  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.488933  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1567  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.51 
 
 
579 aa  625  1e-178  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39440  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.52 
 
 
569 aa  626  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.31407  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3376  exonuclease RecJ  56.37 
 
 
569 aa  625  1e-178  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.593595 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1417  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.69 
 
 
579 aa  625  1e-177  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3276  ssDNA exonuclease RecJ  53.32 
 
 
577 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3210  ssDNA exonuclease RecJ  53.32 
 
 
577 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.398907 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0749  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.74 
 
 
574 aa  622  1e-177  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0015193  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3198  ssDNA exonuclease RecJ  53.5 
 
 
577 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0817  ssDNA exonuclease RecJ  53.33 
 
 
577 aa  618  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1993  ssDNA exonuclease RecJ  53.63 
 
 
584 aa  619  1e-176  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3378  ssDNA exonuclease RecJ  53.32 
 
 
577 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2272  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.3 
 
 
577 aa  619  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0665  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.42 
 
 
574 aa  620  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0729862  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3273  ssDNA exonuclease RecJ  53.32 
 
 
577 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02724  ssDNA exonuclease, 5' -> 3'-specific  53.33 
 
 
577 aa  616  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0329903  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0800  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.33 
 
 
577 aa  617  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133644  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3890  ssDNA exonuclease RecJ  54.91 
 
 
577 aa  618  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3312  ssDNA exonuclease RecJ  53.33 
 
 
577 aa  615  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3218  ssDNA exonuclease RecJ  53.33 
 
 
577 aa  618  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02687  hypothetical protein  53.33 
 
 
577 aa  616  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0479122  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3025  ssDNA exonuclease RecJ  53.51 
 
 
577 aa  617  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00958  ssDNA exonuclease RecJ  52.94 
 
 
579 aa  615  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2737  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.82 
 
 
574 aa  616  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4183  ssDNA exonuclease RecJ  53.51 
 
 
577 aa  618  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4094  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.41 
 
 
584 aa  612  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3051  ssDNA exonuclease RecJ  53.16 
 
 
577 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.05 
 
 
576 aa  612  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.297966  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004439  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.6 
 
 
579 aa  611  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1213  exonuclease RecJ  54.36 
 
 
581 aa  608  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3310  ssDNA exonuclease RecJ  52.98 
 
 
577 aa  605  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.24828  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3849  ssDNA exonuclease RecJ  53.33 
 
 
577 aa  596  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.333614 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0881  ssDNA exonuclease RecJ  53.33 
 
 
577 aa  596  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.796775  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0922  ssDNA exonuclease RecJ  53.33 
 
 
577 aa  598  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1474  single-strand DNA-specific exonuclease  54.45 
 
 
573 aa  597  1e-169  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1569  single-stranded-DNA-specific exonuclease  51.58 
 
 
574 aa  592  1e-168  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160712  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0618  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.58 
 
 
574 aa  592  1e-168  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3302  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.78 
 
 
572 aa  589  1e-167  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0912686  normal  0.117483 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3298  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.39 
 
 
580 aa  585  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.746333  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0863  ssDNA exonuclease RecJ  52.59 
 
 
584 aa  587  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03407  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.81 
 
 
573 aa  583  1.0000000000000001e-165  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0647  ssDNA exonuclease RecJ  52.24 
 
 
584 aa  579  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.252802  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1819  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.48 
 
 
577 aa  578  1e-164  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1460  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.8 
 
 
574 aa  569  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2838  RecJ exonuclease  52.9 
 
 
566 aa  557  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.934115  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1189  RecJ exonuclease  52.37 
 
 
574 aa  549  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1771  exonuclease RecJ  52.18 
 
 
565 aa  540  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.495895  normal  0.722264 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1969  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.18 
 
 
563 aa  535  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00305659  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0628  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.93 
 
 
599 aa  528  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0640  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.41 
 
 
613 aa  528  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1038  exonuclease RecJ  50.54 
 
 
566 aa  524  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.329478 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2758  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.36 
 
 
574 aa  523  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1074  exonuclease RecJ  49.13 
 
 
565 aa  521  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0444947  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2065  exonuclease RecJ  51.36 
 
 
564 aa  521  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.54 
 
 
574 aa  511  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5406  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.13 
 
 
572 aa  502  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1817  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.69 
 
 
585 aa  501  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0771206 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0122  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.71 
 
 
578 aa  496  1e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3258  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.32 
 
 
580 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00083  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.38 
 
 
558 aa  491  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.491155  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.52 
 
 
564 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497812  normal  0.288787 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0790  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.37 
 
 
611 aa  487  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease protein  49.55 
 
 
565 aa  487  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00151931  normal  0.274168 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1470  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.21 
 
 
586 aa  487  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0958  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.35 
 
 
564 aa  485  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.388256  normal  0.0147257 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.58 
 
 
573 aa  483  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0487  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.86 
 
 
601 aa  480  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.624528  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1448  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.2 
 
 
577 aa  481  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1154  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.17 
 
 
565 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2205  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.81 
 
 
564 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1698  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.81 
 
 
564 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2642  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.81 
 
 
564 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3234  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.76 
 
 
576 aa  477  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.224513  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1478  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.81 
 
 
564 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2153  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.83 
 
 
565 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000147893  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3113  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.81 
 
 
564 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>