More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3707 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
319 aa  654    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  54.02 
 
 
320 aa  332  6e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  53.87 
 
 
312 aa  331  9e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  54.4 
 
 
327 aa  330  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  52.7 
 
 
327 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  54.46 
 
 
319 aa  328  7e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  52.06 
 
 
329 aa  325  6e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  51.91 
 
 
329 aa  325  7e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  52.23 
 
 
330 aa  322  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  52.6 
 
 
330 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  51.91 
 
 
330 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  51.91 
 
 
330 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  51.91 
 
 
330 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  52.6 
 
 
329 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  52.6 
 
 
329 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  52.6 
 
 
329 aa  318  6e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  51.91 
 
 
330 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  52.46 
 
 
328 aa  317  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  51.8 
 
 
314 aa  315  5e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  51.95 
 
 
329 aa  315  6e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  51.16 
 
 
317 aa  314  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  51.14 
 
 
316 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  50.32 
 
 
316 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  51.95 
 
 
329 aa  310  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  52.96 
 
 
314 aa  309  5e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  50 
 
 
316 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  50.5 
 
 
306 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  49.35 
 
 
316 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  49.67 
 
 
345 aa  300  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  48.22 
 
 
316 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  50.5 
 
 
315 aa  298  7e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  49.03 
 
 
324 aa  298  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  47.19 
 
 
340 aa  291  9e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  49.84 
 
 
316 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  45.63 
 
 
320 aa  258  9e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  38.83 
 
 
313 aa  248  1e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  43.79 
 
 
320 aa  246  4e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  47.04 
 
 
270 aa  244  9.999999999999999e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  36.77 
 
 
317 aa  188  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  37.22 
 
 
320 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  34.74 
 
 
329 aa  172  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  36.66 
 
 
323 aa  169  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  34.23 
 
 
301 aa  159  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  34.56 
 
 
301 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  34.67 
 
 
344 aa  153  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  33.97 
 
 
329 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  33.98 
 
 
314 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  34.27 
 
 
314 aa  148  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  32.48 
 
 
313 aa  143  4e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  34.73 
 
 
321 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  30.86 
 
 
323 aa  142  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  30.65 
 
 
339 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  29.75 
 
 
326 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  33.23 
 
 
315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  30.06 
 
 
341 aa  136  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  31.82 
 
 
332 aa  136  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  31.96 
 
 
332 aa  136  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  31.62 
 
 
332 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  30.98 
 
 
332 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  31.62 
 
 
332 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  32.96 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.21 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  32.96 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  29.28 
 
 
320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  30.29 
 
 
322 aa  132  5e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  33.7 
 
 
308 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  33.7 
 
 
308 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  30.87 
 
 
311 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  33.8 
 
 
308 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  33.8 
 
 
308 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  29.78 
 
 
628 aa  132  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  33.7 
 
 
308 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  33.33 
 
 
319 aa  132  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  31.58 
 
 
327 aa  132  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  29.15 
 
 
628 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  33.55 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  31.51 
 
 
326 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  31.23 
 
 
309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  29.62 
 
 
320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  29.06 
 
 
322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  35.05 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  32.26 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  31.44 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  34.64 
 
 
298 aa  127  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  30.07 
 
 
338 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
308 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  34.26 
 
 
311 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  28.66 
 
 
317 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1358  2-keto-3-deoxygluconate kinase  31.94 
 
 
291 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  32.96 
 
 
308 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  29.26 
 
 
314 aa  122  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.85 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  31.31 
 
 
312 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  28.03 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  29.12 
 
 
644 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  31.89 
 
 
342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0388  PfkB domain protein  29.55 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  32.28 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  28 
 
 
315 aa  116  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  31.25 
 
 
363 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>