67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3660 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3660  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  193  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.299487  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3008  hypothetical protein  50.62 
 
 
102 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643825  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3089  hypothetical protein  50.62 
 
 
102 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000454592  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3186  hypothetical protein  50.62 
 
 
102 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000975411  normal  0.940677 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3596  hypothetical protein  49.38 
 
 
102 aa  85.9  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1028  hypothetical protein  48.15 
 
 
103 aa  84.7  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000119763  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3289  protein of unknown function DUF1289  45.16 
 
 
101 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000325627  normal  0.144194 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1102  hypothetical protein  45.16 
 
 
101 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0979  Fe-S protein-like protein  41.75 
 
 
121 aa  84.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.104856  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1069  hypothetical protein  45.16 
 
 
101 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000277131  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1000  hypothetical protein  45.16 
 
 
101 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1008  hypothetical protein  45.16 
 
 
102 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000657187  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0876  hypothetical protein  45.45 
 
 
103 aa  82  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000283508  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0894  hypothetical protein  57.14 
 
 
90 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000427519  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1799  hypothetical protein  50 
 
 
81 aa  78.2  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000202172  normal  0.0255641 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0935  hypothetical protein  45.68 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1992  protein of unknown function DUF1289  51.61 
 
 
79 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.11931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1981  hypothetical protein  51.61 
 
 
79 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000345163  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01608  hypothetical protein  51.61 
 
 
79 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01618  hypothetical protein  51.61 
 
 
79 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000568284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1550  hypothetical protein  50 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02667  hypothetical protein  45.45 
 
 
82 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2207  hypothetical protein  52.31 
 
 
79 aa  77.4  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000511306  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1874  hypothetical protein  47.69 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000160461  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1765  hypothetical protein  47.69 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.55498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1267  hypothetical protein  50.63 
 
 
88 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000298758  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2257  hypothetical protein  47.56 
 
 
91 aa  72.8  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.640377  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2667  protein of unknown function DUF1289  43.66 
 
 
79 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000668221  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2383  hypothetical protein  43.66 
 
 
79 aa  72  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003791  predicted Fe-S protein  40.26 
 
 
82 aa  72  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3354  hypothetical protein  45.76 
 
 
106 aa  71.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000804162  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2880  hypothetical protein  49.15 
 
 
106 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244519  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03215  Fe-S protein-like proteinEB3  40.85 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000030181  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2096  hypothetical protein  40 
 
 
86 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00698872  normal  0.744231 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2802  hypothetical protein  45.65 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2416  hypothetical protein  47.06 
 
 
86 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4140  hypothetical protein  43.14 
 
 
106 aa  61.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276441  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  40.68 
 
 
84 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  37.84 
 
 
76 aa  46.2  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.85 
 
 
250 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  42.86 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4760  hypothetical protein  40 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3407  hypothetical protein  40 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5278  hypothetical protein  36.07 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  38.18 
 
 
81 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  41.3 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3202  hypothetical protein  34.48 
 
 
61 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  36.36 
 
 
57 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  35.48 
 
 
79 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0842  protein of unknown function DUF1289  37.31 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.660965  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  39.66 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  36.21 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  32.35 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4380  hypothetical protein  34.78 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109676  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  44.44 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4109  hypothetical protein  38.18 
 
 
61 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.711121 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  37.5 
 
 
72 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  32.56 
 
 
285 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  37.5 
 
 
71 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  41.18 
 
 
110 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  41.18 
 
 
110 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  41.18 
 
 
52 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5057  hypothetical protein  34.78 
 
 
112 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226542  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  37.74 
 
 
267 aa  40.8  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  38.46 
 
 
303 aa  40.4  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  36.96 
 
 
61 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  35.42 
 
 
72 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>