More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3534 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3534  ABC transporter related  100 
 
 
523 aa  1055  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.116696 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4909  ABC transporter related  52.74 
 
 
505 aa  525  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.368986  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1721  ABC transporter related  52.13 
 
 
507 aa  516  1e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0492105  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0148  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  52.03 
 
 
496 aa  515  1e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361964  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4067  ABC transporter related  51.83 
 
 
496 aa  514  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0476  putative sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  51.83 
 
 
496 aa  514  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.0934917 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0983  ABC transporter related  51.32 
 
 
501 aa  513  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2058  ABC transporter related  52.02 
 
 
499 aa  514  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  51.62 
 
 
499 aa  511  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1905  ABC transporter related  51.93 
 
 
507 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308353  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  51.62 
 
 
500 aa  511  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3782  ABC transporter related  51.9 
 
 
500 aa  510  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04061  hypothetical protein  52.2 
 
 
500 aa  511  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  51.42 
 
 
499 aa  509  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  3.1172e-06 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2148  ABC transporter related  51.82 
 
 
499 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.123365  normal  0.259949 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3765  ABC transporter related protein  51.9 
 
 
500 aa  511  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04097  predicted sugar transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  52.2 
 
 
500 aa  511  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0969  ABC transporter related  51.12 
 
 
500 aa  508  1e-142  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4706  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.5 
 
 
500 aa  506  1e-142  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.706122  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4482  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.7 
 
 
500 aa  508  1e-142  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4798  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.7 
 
 
500 aa  508  1e-142  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0413  ABC transporter related  51.12 
 
 
500 aa  505  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2128  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.01 
 
 
516 aa  502  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4228  ABC transporter related protein  51.83 
 
 
506 aa  503  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4038  ABC transporter related  51.83 
 
 
506 aa  503  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0767  putative sugar uptake ABC transporter ATP-binding protein  51.31 
 
 
501 aa  498  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.162932 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1224  ABC transporter related  48.02 
 
 
510 aa  490  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2119  ABC transporter related  49.5 
 
 
504 aa  479  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.307687  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5626  ABC transporter related  48.19 
 
 
504 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000841006  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5991  ABC transporter related  48.19 
 
 
504 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122815  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6482  ABC transporter related  48.19 
 
 
504 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611957  normal  0.251961 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  49.8 
 
 
506 aa  478  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0279  ABC transporter related  48.2 
 
 
526 aa  472  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.60123  normal  0.12609 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4767  ABC transporter-related protein  52.02 
 
 
503 aa  475  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.883977 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5962  ABC transporter related  48.48 
 
 
503 aa  473  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0248969 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1417  ABC transporter related  51.21 
 
 
515 aa  470  1e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.441776  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5049  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  48.39 
 
 
512 aa  468  1e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2251  ABC transporter-related protein  50.7 
 
 
511 aa  465  1e-130  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687423  hitchhiker  4.68234e-06 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2343  ATP binding protein of ABC transporter  48.99 
 
 
502 aa  467  1e-130  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6194  ABC transporter related  47.98 
 
 
504 aa  466  1e-130  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1854  ABC transporter related  47.57 
 
 
505 aa  463  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.99038  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0046  sugar ABC transporter ATPase  47.5 
 
 
513 aa  462  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0138528  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5925  ABC transporter related  47.98 
 
 
504 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737944  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0420  ABC transporter related protein  46.69 
 
 
507 aa  461  1e-128  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3040  ABC transporter related protein  46.39 
 
 
529 aa  454  1e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01030  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  46.79 
 
 
522 aa  454  1e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4208  ABC transporter related  47.01 
 
 
525 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.577364  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4096  ABC transporter related  47.01 
 
 
525 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5517  ABC transporter related  47.29 
 
 
516 aa  446  1e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422457  normal  0.0683787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6222  sugar ABC transporter ATP-binding protein  46.75 
 
 
503 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4809  ABC transporter related  46.77 
 
 
549 aa  441  1e-122  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0173038  hitchhiker  0.00297179 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0380  ABC transporter related  42.55 
 
 
544 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4341  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  42.16 
 
 
544 aa  417  1e-115  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  41.77 
 
 
499 aa  400  1e-110  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  42.68 
 
 
497 aa  399  1e-110  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2025  ABC transporter related  42.97 
 
 
519 aa  398  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  39.64 
 
 
496 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  40 
 
 
497 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.56 
 
 
517 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  39.23 
 
 
505 aa  376  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  39.31 
 
 
500 aa  379  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  39.32 
 
 
501 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  38.84 
 
 
510 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  40.56 
 
 
517 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  39.19 
 
 
517 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  40.56 
 
 
517 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  40.56 
 
 
517 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  40.7 
 
 
494 aa  375  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2215  ABC transporter related  42.32 
 
 
509 aa  372  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0215537  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2238  ABC transporter related  42.32 
 
 
504 aa  372  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  40.56 
 
 
517 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  40.16 
 
 
517 aa  372  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  39.56 
 
 
501 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2370  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.96 
 
 
518 aa  372  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  40.16 
 
 
517 aa  372  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.45 
 
 
506 aa  367  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  39.11 
 
 
537 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  40.12 
 
 
501 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  40.36 
 
 
517 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  40.36 
 
 
517 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  39.48 
 
 
507 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.36 
 
 
517 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  37.04 
 
 
510 aa  369  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.01 
 
 
519 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  38.66 
 
 
506 aa  365  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  40.04 
 
 
501 aa  365  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  39.79 
 
 
504 aa  364  2e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0277  ABC transporter related  40.64 
 
 
511 aa  364  2e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.277921  normal  0.268674 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 
517 aa  364  3e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0839  ABC transporter related  40.35 
 
 
515 aa  363  3e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0437  ABC transporter related  37.6 
 
 
501 aa  363  3e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  39.88 
 
 
497 aa  363  4e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  38.65 
 
 
506 aa  363  6e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  42.07 
 
 
528 aa  363  6e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.39 
 
 
515 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.39 
 
 
515 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.39 
 
 
515 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  38.21 
 
 
501 aa  362  1e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  40.36 
 
 
526 aa  361  1e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.552248  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  38.99 
 
 
522 aa  361  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>