More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3492 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
206 aa  404  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.39 
 
 
205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4606  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.91 
 
 
242 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.118982 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0365  RhtB family transporter  37.38 
 
 
205 aa  136  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3016  lysine exporter protein LysE/YggA  38.64 
 
 
205 aa  136  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0186  amino acid transporter LysE  36.65 
 
 
205 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3434  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2151  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.3 
 
 
230 aa  125  6e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4540  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.6 
 
 
205 aa  124  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529468  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3363  lysine exporter protein LysE/YggA  37.44 
 
 
203 aa  118  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0656798  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.86 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610199  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  33.01 
 
 
204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0945  lysine exporter protein LysE/YggA  30.48 
 
 
203 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  31.22 
 
 
207 aa  112  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3100  lysine exporter protein LysE/YggA  31.72 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2130  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
202 aa  109  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000391872  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4677  lysine exporter protein LysE/YggA  35.57 
 
 
203 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4152  lysine exporter protein LysE/YggA  35.05 
 
 
203 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
208 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4806  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 
203 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135415  normal  0.130992 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  30.39 
 
 
206 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.92 
 
 
211 aa  101  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.43 
 
 
211 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.71 
 
 
207 aa  98.6  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  31.36 
 
 
213 aa  98.2  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  31.43 
 
 
211 aa  98.2  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  30.85 
 
 
212 aa  98.2  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  32.73 
 
 
211 aa  98.2  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  32.57 
 
 
211 aa  97.8  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  31.82 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.86 
 
 
218 aa  96.3  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1173  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 
206 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.813849 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2754  lysine exporter protein LysE/YggA  32.98 
 
 
205 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  0.0643821 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
213 aa  95.5  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.85 
 
 
213 aa  95.5  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.99 
 
 
211 aa  95.1  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  31.25 
 
 
215 aa  95.1  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.24 
 
 
218 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  31.19 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  31.43 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1358  LysE family protein  36.59 
 
 
203 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.19 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2472  LysE family protein  36.59 
 
 
203 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.082911  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0949  LysE family protein  36.59 
 
 
203 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0342  LysE family protein  36.59 
 
 
203 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1281  LysE family translocator protein  36.59 
 
 
203 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18583  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.65 
 
 
208 aa  93.2  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  31.51 
 
 
212 aa  93.2  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0621  LysE family protein  36.59 
 
 
217 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1208  LysE family translocator protein  36.59 
 
 
233 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  27.8 
 
 
208 aa  92  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  30.69 
 
 
211 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  30.69 
 
 
211 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  27.59 
 
 
210 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  30.69 
 
 
211 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  30.69 
 
 
211 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  31.19 
 
 
211 aa  91.3  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  31.19 
 
 
211 aa  91.3  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  30.69 
 
 
211 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1303  amino acid transporter LysE  31.5 
 
 
201 aa  90.5  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.520276  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0004  lysine exporter protein LysE/YggA  30.48 
 
 
206 aa  90.5  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.309415  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  28.43 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.18 
 
 
207 aa  89.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  27.75 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  27.49 
 
 
205 aa  89.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  32.14 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  30.91 
 
 
218 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  31.03 
 
 
209 aa  89.4  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  30.48 
 
 
207 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0140  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.58 
 
 
210 aa  89  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  30.81 
 
 
212 aa  89  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  30.48 
 
 
207 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.48 
 
 
208 aa  88.6  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  27.23 
 
 
210 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  26.5 
 
 
205 aa  87.8  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.05 
 
 
205 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  29.52 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1248  amino acid transporter LysE  31 
 
 
255 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.483142 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  32.54 
 
 
208 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  30.84 
 
 
208 aa  87  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0050  lysine exporter protein LysE/YggA  28.5 
 
 
210 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0612  RhtB family transporter  31 
 
 
209 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  27.75 
 
 
209 aa  86.7  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  30.69 
 
 
211 aa  87  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.28 
 
 
207 aa  86.7  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.27 
 
 
209 aa  86.7  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  34.81 
 
 
214 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  30.5 
 
 
205 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  30.1 
 
 
206 aa  85.9  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 
213 aa  86.3  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0219  lysine exporter protein LysE/YggA  28.99 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581325  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.48 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1489  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.48 
 
 
230 aa  85.9  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  31.69 
 
 
210 aa  85.9  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  30.53 
 
 
222 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.51 
 
 
212 aa  85.5  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  30.53 
 
 
222 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>