More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3425 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
745 aa  1490    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  55.63 
 
 
747 aa  788    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  54.88 
 
 
744 aa  764    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  61.71 
 
 
747 aa  838    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  56.66 
 
 
741 aa  783    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3207  chemotaxis protein  58.7 
 
 
758 aa  637    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  63.14 
 
 
748 aa  842    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  58.13 
 
 
751 aa  808    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  62.12 
 
 
737 aa  839    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  57.11 
 
 
746 aa  780    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  63.45 
 
 
758 aa  839    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  62.14 
 
 
743 aa  859    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  62.19 
 
 
754 aa  835    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  57.26 
 
 
733 aa  788    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  53.5 
 
 
785 aa  752    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  56.88 
 
 
733 aa  793    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  55.81 
 
 
741 aa  783    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  62.88 
 
 
767 aa  895    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  49.34 
 
 
715 aa  661    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2287  chemotaxis protein CheA  55.84 
 
 
723 aa  787    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  57.48 
 
 
734 aa  769    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  62.47 
 
 
739 aa  849    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  54.29 
 
 
744 aa  738    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  56.73 
 
 
754 aa  778    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  57.02 
 
 
760 aa  801    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  50.66 
 
 
719 aa  671    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  57.05 
 
 
762 aa  788    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  57.83 
 
 
736 aa  801    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  62.09 
 
 
753 aa  842    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  61.96 
 
 
748 aa  832    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  56.87 
 
 
762 aa  782    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  57.44 
 
 
759 aa  783    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  60.68 
 
 
709 aa  838    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  61.58 
 
 
747 aa  838    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  60.11 
 
 
747 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  59.15 
 
 
746 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0474  CheA signal transduction histidine kinases  48.64 
 
 
739 aa  625  1e-178  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  60.18 
 
 
738 aa  623  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  59.57 
 
 
714 aa  618  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  56.04 
 
 
650 aa  513  1e-144  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1859  CheA signal transduction histidine kinase  52.83 
 
 
614 aa  463  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348305  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  58.13 
 
 
552 aa  436  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  58.13 
 
 
552 aa  436  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  46.15 
 
 
769 aa  391  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  46.28 
 
 
769 aa  390  1e-107  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  46.5 
 
 
769 aa  392  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 
695 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  44.88 
 
 
770 aa  383  1e-105  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  43.72 
 
 
774 aa  379  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  43.85 
 
 
783 aa  381  1e-104  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  45.28 
 
 
785 aa  381  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  47.98 
 
 
677 aa  380  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  43.74 
 
 
770 aa  378  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  43.19 
 
 
803 aa  374  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  45.43 
 
 
681 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 
598 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  49.61 
 
 
610 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  45.58 
 
 
603 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  47.03 
 
 
606 aa  369  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  47.47 
 
 
601 aa  368  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  44.97 
 
 
607 aa  365  1e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  45.35 
 
 
604 aa  365  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  45.98 
 
 
639 aa  364  4e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 
701 aa  363  6e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  42.27 
 
 
696 aa  360  4e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  45.52 
 
 
673 aa  360  4e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
724 aa  360  5e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  45.72 
 
 
770 aa  360  5e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  43.24 
 
 
691 aa  360  6e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  32.09 
 
 
927 aa  359  9.999999999999999e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  43.54 
 
 
673 aa  356  1e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 
687 aa  354  2.9999999999999997e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  45.12 
 
 
671 aa  352  2e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  42.95 
 
 
1031 aa  351  3e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  44.28 
 
 
801 aa  350  4e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  42.16 
 
 
660 aa  347  3e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 
671 aa  346  7e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  44 
 
 
674 aa  345  2e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  46.98 
 
 
679 aa  345  2e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  44.74 
 
 
666 aa  344  4e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3221  CheA signal transduction histidine kinase  45.72 
 
 
635 aa  343  5e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  33.69 
 
 
704 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 
713 aa  338  9.999999999999999e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
686 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 
919 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  45.34 
 
 
954 aa  337  5e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  41.19 
 
 
697 aa  337  7e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 
652 aa  336  9e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  44.14 
 
 
729 aa  335  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  43.54 
 
 
707 aa  336  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 
655 aa  334  3e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  45.36 
 
 
1089 aa  334  3e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 
919 aa  334  4e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  46.79 
 
 
685 aa  334  5e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 
920 aa  330  4e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  42.96 
 
 
698 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  41.42 
 
 
766 aa  330  7e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  41.54 
 
 
720 aa  329  1.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1594  CheA signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 
696 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  45.99 
 
 
1030 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>