More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3230 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3230  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 335 aa  699    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000100619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2228  tryptophanyl-tRNA synthetase  70.22 
 
 		 334 aa  478  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325884 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2965  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.86 
 
 		 337 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1230  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.96 
 
 		 337 aa  462  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57670  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.47 
 
 		 448 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4429  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.71 
 
 		 449 aa  448  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4123  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.33 
 
 		 449 aa  448  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2771  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.36 
 
 		 434 aa  449  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1311  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.33 
 
 		 449 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.600947  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2526  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.36 
 
 		 338 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13010  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.94 
 
 		 453 aa  445  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5011  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.02 
 
 		 448 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4413  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.33 
 
 		 449 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.520891 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1001  tryptophanyl-tRNA synthetase  64 
 
 		 449 aa  444  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757013  hitchhiker  0.000328447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4538  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.02 
 
 		 449 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0918  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.71 
 
 		 449 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.435923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3711  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.69 
 
 		 435 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3278  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.02 
 
 		 439 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.304341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3438  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.06 
 
 		 434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4699  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.6 
 
 		 451 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00386571  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0620  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.07 
 
 		 435 aa  442  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1623  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.54 
 
 		 455 aa  441  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.94 
 
 		 448 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2640  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.85 
 
 		 436 aa  434  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02854  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.95 
 
 		 429 aa  436  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5415  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.8 
 
 		 430 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4025  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.09 
 
 		 443 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52951  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3240  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.4 
 
 		 432 aa  424  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222683  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1568  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.08 
 
 		 362 aa  419  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0656784  normal  0.380715 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1953  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.72 
 
 		 365 aa  420  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1750  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.65 
 
 		 361 aa  421  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.110682  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1743  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.06 
 
 		 435 aa  404  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1811  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.67 
 
 		 434 aa  404  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0242  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.76 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.607361  normal  0.982813 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.17 
 
 		 332 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00170598  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3353  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.57 
 
 		 332 aa  365  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3159  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 		 332 aa  363  2e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3408  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 		 332 aa  363  2e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.57 
 
 		 332 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3376  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.57 
 
 		 332 aa  362  6e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206334  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3081  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 		 332 aa  361  8e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00801596  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1873  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.57 
 
 		 332 aa  361  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3143  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.27 
 
 		 332 aa  359  3e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3053  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 332 aa  355  5e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2370  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 		 331 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32570  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.89 
 
 		 341 aa  346  4e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.13125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3963  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 		 341 aa  338  9e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2376  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.24 
 
 		 336 aa  334  1e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0768  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 353 aa  324  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0510321  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0378  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 335 aa  320  3e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0459498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0656  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 322 aa  289  6e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.368558  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03505  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 322 aa  280  2e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1570  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 319 aa  277  2e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0437  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 319 aa  276  3e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1002  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 322 aa  275  9e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.325516  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0990  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 324 aa  274  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0411  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 319 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2109  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 321 aa  268  7e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3078  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 324 aa  265  8.999999999999999e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2912  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 		 325 aa  263  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0986244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0070  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 321 aa  258  7e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.229775  normal  0.611279 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 321 aa  256  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130405  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0534  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 319 aa  253  3e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0423  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 325 aa  252  7e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1365  hypothetical protein  41.41 
 
 		 322 aa  249  4e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2089  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 325 aa  249  6e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1341  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 323 aa  245  9e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1044  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1755  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 321 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0771  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 321 aa  238  2e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0405  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 324 aa  231  1e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0050  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 325 aa  223  2e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 321 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0389  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 319 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 327 aa  209  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 330 aa  209  7e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0177  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.595175  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0343  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 		 392 aa  205  1e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289554  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4054  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158316  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0344  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 		 332 aa  202  6e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 329 aa  202  7e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 		 332 aa  202  7e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 		 332 aa  202  8e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 		 332 aa  202  9e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3797  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0456101 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3877  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3721  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0742985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.21 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.82 
 
 		 327 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 		 329 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0266  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.78 
 
 		 334 aa  199  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.456262  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0221  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 		 332 aa  199  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.023184 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3960  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 		 346 aa  199  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 		 332 aa  199  6e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 		 336 aa  199  7.999999999999999e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0128322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>