More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3228 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3228  putative CheW protein  100 
 
 		 169 aa  339  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000337303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  63.27 
 
 		 159 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  63.7 
 
 		 159 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  62.59 
 
 		 159 aa  194  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  61.64 
 
 		 159 aa  191  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  61.64 
 
 		 159 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  62.33 
 
 		 159 aa  190  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  62.33 
 
 		 159 aa  190  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  62.33 
 
 		 159 aa  190  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  62.33 
 
 		 159 aa  190  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  64.23 
 
 		 163 aa  189  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  62.42 
 
 		 161 aa  190  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  64.71 
 
 		 161 aa  189  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  57.14 
 
 		 162 aa  187  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  57.72 
 
 		 164 aa  187  8e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  58.11 
 
 		 164 aa  186  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  60.56 
 
 		 164 aa  185  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  60.56 
 
 		 164 aa  185  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  58.11 
 
 		 164 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  58.11 
 
 		 164 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  60.27 
 
 		 174 aa  186  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  58.11 
 
 		 164 aa  186  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  62.04 
 
 		 164 aa  184  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  61.43 
 
 		 164 aa  184  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  58.11 
 
 		 163 aa  184  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  58.11 
 
 		 164 aa  184  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  59.6 
 
 		 163 aa  184  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  58.11 
 
 		 164 aa  184  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  58.11 
 
 		 164 aa  184  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  58.11 
 
 		 164 aa  184  6e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  58.11 
 
 		 164 aa  183  8e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  57.24 
 
 		 164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  56 
 
 		 164 aa  182  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  56.76 
 
 		 161 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  56 
 
 		 163 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  55.86 
 
 		 164 aa  180  9.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  58.87 
 
 		 164 aa  179  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  55.63 
 
 		 159 aa  167  9e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  51.8 
 
 		 162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  49.64 
 
 		 161 aa  148  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  46.1 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  38.1 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  37.5 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.84 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0724  CheW protein  42.65 
 
 		 171 aa  115  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.5 
 
 		 164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.44 
 
 		 164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  36.6 
 
 		 178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.59 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  40.54 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.18 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  39.73 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  36.08 
 
 		 163 aa  111  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  36.55 
 
 		 167 aa  111  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  37.93 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  38.81 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  40.58 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  37.82 
 
 		 187 aa  108  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  39.86 
 
 		 159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  38.06 
 
 		 163 aa  108  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  37.14 
 
 		 168 aa  107  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  36.84 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  36.84 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  37.75 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  38.62 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  37.75 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  38.36 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  33.81 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  38.3 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  36.24 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  36.84 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  38.06 
 
 		 163 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  37.93 
 
 		 185 aa  104  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  39.01 
 
 		 164 aa  104  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  37.04 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  37.76 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  36.05 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  40.3 
 
 		 136 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  35.77 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  36.31 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  32.43 
 
 		 159 aa  101  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  33.81 
 
 		 187 aa  99.8  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  32.86 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  35.81 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  35.33 
 
 		 163 aa  99.4  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0751  CheW protein  38.57 
 
 		 169 aa  99  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  36.69 
 
 		 161 aa  99.8  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  32.62 
 
 		 185 aa  99.4  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  35.12 
 
 		 194 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  29.03 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  36.99 
 
 		 158 aa  99  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  38.06 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  32.88 
 
 		 169 aa  99  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  35.12 
 
 		 194 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  36.88 
 
 		 169 aa  98.6  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  36.49 
 
 		 181 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  38.41 
 
 		 179 aa  98.2  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  37.33 
 
 		 192 aa  98.2  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  37.33 
 
 		 194 aa  98.2  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0165  CheW protein  33.33 
 
 		 183 aa  98.2  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>