More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3196 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  100 
 
 
414 aa  816    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  49.5 
 
 
409 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6406  major facilitator transporter  51.41 
 
 
409 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4891  major facilitator transporter  49.87 
 
 
409 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390253  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3273  major facilitator transporter  49.87 
 
 
409 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0542458 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6916  major facilitator transporter  49.87 
 
 
409 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  39.62 
 
 
396 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  33.84 
 
 
402 aa  201  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  32.49 
 
 
409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  32.4 
 
 
410 aa  196  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  34.67 
 
 
381 aa  186  5e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  32.95 
 
 
397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  35.06 
 
 
388 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  32.6 
 
 
403 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  32.11 
 
 
421 aa  152  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  31.73 
 
 
404 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  28.3 
 
 
423 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  28.3 
 
 
423 aa  140  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  28.03 
 
 
423 aa  139  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  29.82 
 
 
373 aa  125  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 
414 aa  116  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  28.53 
 
 
408 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 
394 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 
414 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 
404 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 
388 aa  99.4  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0679  major facilitator transporter  31.73 
 
 
357 aa  97.1  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3637  major facilitator transporter  26.32 
 
 
405 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476152  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  27.15 
 
 
386 aa  93.2  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3739  major facilitator transporter  27.33 
 
 
403 aa  84.3  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
383 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 
391 aa  79  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  23 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
400 aa  77  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  25.58 
 
 
384 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  26.76 
 
 
388 aa  73.2  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  23.25 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17300  Major facilitator superfamily transporter  25.5 
 
 
407 aa  71.2  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3646  major facilitator transporter  26.32 
 
 
410 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1197  putative sialic acid transporter  25.9 
 
 
426 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1227  putative sialic acid transporter  26.65 
 
 
426 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  23.6 
 
 
411 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1242  putative sialic acid transporter  26.65 
 
 
426 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.364649 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2090  major facilitator transporter  25.07 
 
 
410 aa  65.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106737  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  22.77 
 
 
403 aa  64.7  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5618  major facilitator transporter  29.21 
 
 
428 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.287687 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  29.69 
 
 
388 aa  63.2  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  29.69 
 
 
388 aa  63.2  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2079  major facilitator transporter  25.94 
 
 
423 aa  63.2  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.816032  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4063  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 
461 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1581  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 
378 aa  62.8  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 
439 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4092  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 
396 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 
390 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  24.43 
 
 
433 aa  60.8  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.84 
 
 
476 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 
399 aa  60.8  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  24.28 
 
 
383 aa  60.5  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  29.35 
 
 
421 aa  60.1  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4906  putative benzoate transport protein  24.28 
 
 
433 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1289  major facilitator superfamily permease  22.79 
 
 
398 aa  59.7  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000157601  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  31.17 
 
 
414 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5722  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 
433 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731406  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 
425 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1096  major facilitator transporter  27.64 
 
 
399 aa  59.7  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6076  major facilitator transporter  30.81 
 
 
416 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  22.84 
 
 
452 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 
520 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  24.81 
 
 
418 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  31.61 
 
 
387 aa  59.7  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0344  major facilitator transporter  24 
 
 
433 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  27.5 
 
 
432 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  22.16 
 
 
435 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  34.58 
 
 
414 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  25.92 
 
 
389 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1649  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 
413 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0527  MDR-like permease  25.71 
 
 
387 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  22.43 
 
 
406 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1697  major facilitator transporter  25.71 
 
 
462 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  27 
 
 
432 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
423 aa  57.4  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  30.54 
 
 
387 aa  57.4  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5470  major facilitator transporter  27.08 
 
 
426 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4878  major facilitator transporter  27.08 
 
 
426 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  27 
 
 
432 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5392  major facilitator transporter  27.08 
 
 
426 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0128328 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4700  major facilitator transporter  27.37 
 
 
426 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.164238  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  26.15 
 
 
434 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  26.67 
 
 
434 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0335  sugar transporter; benzoate transport protein  24.24 
 
 
436 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  24.24 
 
 
436 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1657  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 
413 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.992815  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4030  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 
463 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0364  benzoate transport protein  24.24 
 
 
433 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  28.21 
 
 
446 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1774  major facilitator superfamily permease  28.77 
 
 
404 aa  55.8  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179467 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0747  major facilitator superfamily transporter  29.59 
 
 
456 aa  55.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.726619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>