More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3185 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3185  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 170 aa  348  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  34.59 
 
 		 161 aa  80.5  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3274  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533854 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3081  UspA domain-containing protein  30.36 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110686  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  28.03 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  38.14 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  31.74 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.85 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2278  universal stress protein family  26.79 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000472572  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  26.97 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  28.3 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  27.81 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  29.87 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  29.87 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  26.19 
 
 		 515 aa  58.2  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1831  putative universal stress protein  27.49 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1927  UspA domain-containing protein  27.06 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000483446  hitchhiker  0.0000000000012349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2326  universal stress protein  27.06 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341198  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3444  UspA domain-containing protein  27.06 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0150899  hitchhiker  0.00194101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1767  UspA domain-containing protein  26.19 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000240026 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1302  hypothetical protein  29.22 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  35.05 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  32.67 
 
 		 303 aa  57  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3344  UspA domain protein  27.27 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  29.22 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  26.42 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  27.92 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  25.66 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  26.97 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  26.97 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  27.67 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  44.83 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  26.14 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  24.68 
 
 		 274 aa  54.3  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  24.68 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  28.29 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4004  hypothetical protein  26.25 
 
 		 167 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209434  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  25.49 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  25.33 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3706  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0037155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  26.54 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  26.97 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  26.97 
 
 		 138 aa  53.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  41.38 
 
 		 128 aa  53.1  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  26.57 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  26.57 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  26 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  24.84 
 
 		 276 aa  52.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  25 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  28.1 
 
 		 139 aa  52.4  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  31.68 
 
 		 168 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  25.32 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  27.45 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  24.67 
 
 		 146 aa  52  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  25.97 
 
 		 142 aa  51.6  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4155  UspA domain-containing protein  40.68 
 
 		 176 aa  51.6  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  41.82 
 
 		 152 aa  51.6  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  27.45 
 
 		 137 aa  51.6  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  24.67 
 
 		 152 aa  51.2  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  29.37 
 
 		 143 aa  51.2  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  25.32 
 
 		 157 aa  51.2  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  34.62 
 
 		 296 aa  51.2  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  28 
 
 		 142 aa  51.2  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  28.76 
 
 		 137 aa  51.2  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  25.17 
 
 		 288 aa  51.2  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0065  UspA domain protein  33.33 
 
 		 143 aa  51.2  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  45.28 
 
 		 142 aa  51.2  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  26.49 
 
 		 295 aa  50.8  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  26.97 
 
 		 297 aa  50.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  27.39 
 
 		 153 aa  50.8  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0850  universal stress protein UspA  33.33 
 
 		 146 aa  50.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.789221  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  41.94 
 
 		 130 aa  50.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  35.71 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  27.1 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1012  UspA domain-containing protein  34 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  26.92 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2707  UspA domain-containing protein  41.54 
 
 		 279 aa  50.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0095  UspA domain-containing protein  32.2 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  25.49 
 
 		 137 aa  50.4  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  26.8 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  24.84 
 
 		 148 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  28.66 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  23.12 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  22.5 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  40.38 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0609  UspA domain protein  23.13 
 
 		 283 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  26.32 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1488  UspA domain protein  27.27 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03760  universal stress protein UspA-like protein  30.77 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00361063  normal  0.318246 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0161  UspA domain-containing protein  28.1 
 
 		 276 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  24.18 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  25.97 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  27.85 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  41.67 
 
 		 307 aa  48.9  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  24.05 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  27.98 
 
 		 317 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  28.95 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2436  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 140 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236391 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  38.18 
 
 		 143 aa  48.5  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>