97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3143 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3143  BNR domain-containing protein  100 
 
 
361 aa  734    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.980109 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3201  BNR domain-containing protein  41.27 
 
 
353 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.305002  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0132  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.42 
 
 
359 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0966  hypothetical protein  35.06 
 
 
363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254365  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2065  uncharacterized protein related to photosystem II stability/assembly factor  37.42 
 
 
382 aa  196  7e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6866  glycosyl hydrolase  37.5 
 
 
354 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0347916  normal  0.0962421 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4061  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  39.08 
 
 
356 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369281  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2810  glycosyl hydrolase  38.06 
 
 
331 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119183  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2245  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.41 
 
 
352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000222416  hitchhiker  0.00000000000000277962 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3921  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  39.01 
 
 
356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2667  hypothetical protein  37.17 
 
 
331 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.166994  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2164  glycosyl hydrolase  36.08 
 
 
368 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4028  glycosyl hydrolase, BNR repeat  38.2 
 
 
355 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0574682  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3430  BNR repeat-containing protein  30.4 
 
 
397 aa  157  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0324966  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  32.34 
 
 
361 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  32.93 
 
 
365 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  33.57 
 
 
342 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  33.57 
 
 
319 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  33.69 
 
 
346 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  32.1 
 
 
343 aa  142  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2223  BNR repeat-containing protein  27.78 
 
 
336 aa  140  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110156  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  30.94 
 
 
340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  35.06 
 
 
363 aa  139  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  32.85 
 
 
341 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0646  hypothetical protein  30.57 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0104627  normal  0.241315 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  30.52 
 
 
329 aa  137  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.12 
 
 
342 aa  135  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.85 
 
 
369 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  29.55 
 
 
359 aa  135  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1807  BNR repeat-containing protein  27.81 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.120061  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.33 
 
 
299 aa  132  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  32.68 
 
 
324 aa  132  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2000  BNR repeat-containing protein  26.81 
 
 
332 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1678  BNR repeat-containing protein  28.22 
 
 
336 aa  126  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1783  BNR repeat-containing protein  27.84 
 
 
336 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329524  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1909  BNR repeat protein  29.06 
 
 
338 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00042683  normal  0.120925 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2442  BNR repeat-containing protein  29.06 
 
 
338 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  27.66 
 
 
344 aa  123  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2595  BNR repeat-containing protein  28.53 
 
 
336 aa  122  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.44 
 
 
324 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2555  BNR repeat-containing protein  28.75 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0401334  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1753  BNR repeat-containing protein  27.91 
 
 
336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0888292  normal  0.639516 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2435  BNR repeat-containing protein  28.44 
 
 
338 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.724955  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2197  BNR repeat-containing protein  26.67 
 
 
337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6391  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.35 
 
 
323 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1727  BNR repeat-containing protein  28.07 
 
 
335 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1590  BNR repeat-containing protein  26.67 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  30.8 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2138  BNR repeat-containing protein  26.38 
 
 
342 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.68 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2748  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.15 
 
 
314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000496778  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  27.68 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1940  BNR repeat-containing protein  27.62 
 
 
338 aa  110  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.242255  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2813  BNR domain-containing protein  28.73 
 
 
320 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0172684  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6841  hypothetical protein  27.84 
 
 
321 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109659  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4345  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.27 
 
 
325 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60812  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5038  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.63 
 
 
322 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5822  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.63 
 
 
322 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4357  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.23 
 
 
322 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2128  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.74 
 
 
334 aa  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.437316  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  25.38 
 
 
336 aa  75.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  26.91 
 
 
897 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.33 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  24.6 
 
 
661 aa  69.7  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2478  BNR repeat-containing protein  23.86 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183941  normal  0.0107385 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1349  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.98 
 
 
366 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.86783e-22  decreased coverage  0.0000013848 
 
 
 
NC_008826  Mpe_B0584  hypothetical protein  25.67 
 
 
315 aa  62  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0424726  hitchhiker  0.000233592 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0399  photosystem II stability/assembly factor-like protein  24.9 
 
 
335 aa  59.7  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  23.48 
 
 
329 aa  57.4  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.93 
 
 
371 aa  57.4  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0887  hypothetical protein  25 
 
 
350 aa  57  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0720354  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1157  hypothetical protein  25.1 
 
 
314 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  24.91 
 
 
2082 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  26.63 
 
 
742 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2271  hypothetical protein  36.9 
 
 
313 aa  49.3  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.160712  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3319  Uncharacterized photosystem II stability/assembly factor-like protein  28 
 
 
1120 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  23.35 
 
 
597 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  30.3 
 
 
698 aa  47  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06820  hypothetical protein  25.81 
 
 
421 aa  46.2  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4586  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.81 
 
 
310 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2688  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.74 
 
 
396 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2689  hypothetical protein  33.33 
 
 
455 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2030  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  38.89 
 
 
388 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0965849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2641  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  38.89 
 
 
388 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2562  hypothetical protein  33.33 
 
 
425 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2561  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.74 
 
 
383 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2670  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  38.89 
 
 
388 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4148  Ycf48-like protein  25 
 
 
336 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0623  hypothetical protein  24.16 
 
 
614 aa  44.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000504443  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4188  Ycf48-like protein  25 
 
 
336 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4488  hypothetical protein  24.8 
 
 
303 aa  43.9  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03221  Ycf48-like protein  21.55 
 
 
339 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2337  hypothetical protein  41.67 
 
 
298 aa  43.5  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00785704  normal  0.0148689 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2642  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.59 
 
 
449 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.235103  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2031  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.59 
 
 
449 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0188279  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2671  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.59 
 
 
449 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2227  Ycf48-like protein  30.22 
 
 
333 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537914  normal  0.190318 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>