42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2995 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2995  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  478  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.961096  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00327  hypothetical protein  36.29 
 
 
232 aa  116  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1829  hypothetical protein  31.78 
 
 
244 aa  100  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.390473 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1762  hypothetical protein  30.42 
 
 
243 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.175449 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2615  hypothetical protein  35.17 
 
 
322 aa  92.4  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1837  hypothetical protein  31.28 
 
 
258 aa  90.5  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2952  hypothetical protein  29.44 
 
 
264 aa  87.8  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2413  hypothetical protein  29.31 
 
 
258 aa  85.5  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.248574  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1178  hypothetical protein  34.39 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0102548  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4134  hypothetical protein  29.96 
 
 
244 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1672  hypothetical protein  28.05 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2013  hypothetical protein  32.77 
 
 
326 aa  83.2  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777902  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2032  protein of unknown function DUF1624  28.57 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  30.13 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1035  hypothetical protein  31.69 
 
 
365 aa  76.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138536  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1871  hypothetical protein  29.71 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1864  protein of unknown function DUF1624  32.26 
 
 
329 aa  75.1  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161953  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  28.69 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1137  hypothetical protein  34.53 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0118905  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1261  hypothetical protein  33.47 
 
 
335 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  30.04 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  30 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1883  protein of unknown function DUF1624  29.88 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1820  protein of unknown function DUF1624  30.4 
 
 
261 aa  67  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0080  protein of unknown function DUF1624  28.33 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000683778  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0143  hypothetical protein  27.35 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0429  hypothetical protein  33.77 
 
 
229 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000311918  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2067  protein of unknown function DUF1624  29.88 
 
 
329 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0098  hypothetical protein  34.45 
 
 
244 aa  65.1  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1385  hypothetical protein  30.57 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1793  hypothetical protein  27.6 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2070  protein of unknown function DUF1624  29.68 
 
 
235 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250094  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0665  hypothetical protein  29.61 
 
 
245 aa  59.3  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.646627  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2737  hypothetical protein  27.11 
 
 
339 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0043  hypothetical protein  27.56 
 
 
263 aa  55.8  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1291  hypothetical protein  27.75 
 
 
245 aa  52.8  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.687522 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  29.06 
 
 
254 aa  52.4  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3006  hypothetical protein  32.92 
 
 
328 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166518  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3231  protein of unknown function DUF1624  32.91 
 
 
328 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.356551 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1589  hypothetical protein  25.96 
 
 
264 aa  50.1  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000654588  hitchhiker  0.00067208 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3195  protein of unknown function DUF1624  30.88 
 
 
328 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.856715 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0004  hypothetical protein  24.65 
 
 
351 aa  42.7  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>