More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2944 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
203 aa  394  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.08 
 
 
201 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.2 
 
 
207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  39 
 
 
211 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  35.27 
 
 
211 aa  132  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4452  lysine exporter protein LysE/YggA  36.1 
 
 
205 aa  128  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  38.5 
 
 
206 aa  122  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  37.19 
 
 
203 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  36.1 
 
 
213 aa  121  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.95 
 
 
206 aa  122  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  38.39 
 
 
213 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  33.5 
 
 
205 aa  118  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  36.59 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  36.59 
 
 
203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  34.67 
 
 
205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  33.82 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  34.67 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  34.31 
 
 
208 aa  116  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  32.67 
 
 
212 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  35.68 
 
 
203 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  35.03 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 
212 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
211 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.67 
 
 
205 aa  112  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  34.31 
 
 
208 aa  112  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.51 
 
 
206 aa  112  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
211 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.84 
 
 
212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.02 
 
 
206 aa  112  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.29 
 
 
206 aa  111  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.67 
 
 
205 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.36 
 
 
206 aa  111  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  31.31 
 
 
218 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  32.02 
 
 
206 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  32.02 
 
 
206 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.02 
 
 
206 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.02 
 
 
206 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  32.54 
 
 
213 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.02 
 
 
206 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.02 
 
 
206 aa  111  8.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  32.02 
 
 
206 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  32.12 
 
 
212 aa  111  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  37.1 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.43 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  38.79 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.9 
 
 
208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  38.79 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.66 
 
 
208 aa  109  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  32.66 
 
 
203 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.65 
 
 
206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  31.63 
 
 
208 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.71 
 
 
207 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  31.86 
 
 
208 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  32.85 
 
 
211 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  32.85 
 
 
211 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.97 
 
 
211 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  32.37 
 
 
211 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  31.86 
 
 
208 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.22 
 
 
206 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0557  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.22 
 
 
206 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4287  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.95 
 
 
206 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.414866 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3996  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.22 
 
 
206 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.02 
 
 
213 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3962  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.36 
 
 
206 aa  106  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.149154  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  34.91 
 
 
207 aa  105  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.66 
 
 
208 aa  105  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4347  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.41 
 
 
206 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499409  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29500  putative threonine efflux protein  33.66 
 
 
207 aa  105  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.585854  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  31.34 
 
 
208 aa  105  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4189  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.95 
 
 
206 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4168  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.95 
 
 
206 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4240  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.41 
 
 
206 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119305  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.39 
 
 
216 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.33 
 
 
206 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476612  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  31.66 
 
 
204 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 
212 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  34.8 
 
 
203 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  31.82 
 
 
207 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1744  lysine exporter protein LysE/YggA  34.31 
 
 
208 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257251  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  30.88 
 
 
218 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.02 
 
 
213 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  31.82 
 
 
207 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  31.82 
 
 
207 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  32.63 
 
 
209 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  34.81 
 
 
210 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  32.63 
 
 
209 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7453  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.5 
 
 
207 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353642  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.42 
 
 
204 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  31.12 
 
 
206 aa  101  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 
208 aa  101  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  29.9 
 
 
210 aa  101  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  29.9 
 
 
210 aa  101  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  29.9 
 
 
210 aa  101  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  32.51 
 
 
206 aa  101  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  29.9 
 
 
210 aa  101  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  34.32 
 
 
207 aa  101  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  29.9 
 
 
210 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  30.73 
 
 
222 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>