More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2930 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2930  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 		 303 aa  625  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3865  homocysteine S-methyltransferase  66.67 
 
 		 300 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1497  homocysteine S-methyltransferase  62.71 
 
 		 310 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.191799  normal  0.658864 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1277  homocysteine S-methyltransferase  65.64 
 
 		 300 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0441893 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3243  homocysteine S-methyltransferase  64.73 
 
 		 300 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.562987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3100  homocysteine S-methyltransferase  65.75 
 
 		 300 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3090  homocysteine S-methyltransferase  65.75 
 
 		 300 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0658  homocysteine S-methyltransferase family protein  60.34 
 
 		 311 aa  377  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0692  homocysteine S-methyltransferase  59.66 
 
 		 311 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0245772 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5121  homocysteine S-methyltransferase  59.66 
 
 		 299 aa  362  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0135376  normal  0.478948 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2776  homocysteine S-methyltransferase family protein  56.11 
 
 		 307 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1135  homocysteine S-methyltransferase family protein  59.8 
 
 		 298 aa  344  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.300332  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0975  homocysteine S-methyltransferase  60.96 
 
 		 310 aa  344  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000866621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4282  homocysteine S-methyltransferase  54 
 
 		 309 aa  338  8e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4837  homocysteine S-methyltransferase  54.52 
 
 		 309 aa  332  6e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.345042 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6804  homocysteine S-methyltransferase  52.32 
 
 		 313 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2779  homocysteine S-methyltransferase  53.08 
 
 		 308 aa  308  8e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00664  homocysteine S-methyltransferase family protein  50.17 
 
 		 305 aa  299  5e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6392  homocysteine S-methyltransferase  49.67 
 
 		 302 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.612657 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4534  homocysteine S-methyltransferase  49.5 
 
 		 302 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0770365 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3747  homocysteine S-methyltransferase  51 
 
 		 302 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5017  S-methyltransferase  49.17 
 
 		 301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05821  homocysteine S-methyltransferase  45.1 
 
 		 301 aa  268  5.9999999999999995e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2160  homocysteine S-methyltransferase  46.13 
 
 		 310 aa  266  4e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48307  predicted protein  38.05 
 
 		 346 aa  210  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.532238  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2815  homocysteine S-methyltransferase  37.33 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0392  homocysteine S-methyltransferase  37.21 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108543  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1598  homocysteine S-methyltransferase  34.23 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3928  homocysteine S-methyltransferase  31.25 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.45742 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1042  homocysteine methyltransferase  30 
 
 		 310 aa  102  8e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000341653  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1230  homocysteine S-methyltransferase  30.99 
 
 		 311 aa  99.4  7e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.829907  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2200  homocysteine S-methyltransferase  31.35 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558388  normal  0.514236 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0828  homocysteine methyltransferase  29.25 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0866  homocysteine methyltransferase  28.66 
 
 		 316 aa  94.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.142005  normal  0.135969 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3632  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  30.39 
 
 		 617 aa  93.2  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  29.55 
 
 		 1223 aa  90.5  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1187  homocysteine S-methyltransferase  28.62 
 
 		 629 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1535  homocysteine methyltransferase  27.6 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2926  homocysteine methyltransferase  29.32 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12483  homocysteine methyltransferase  27.76 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01795  homocysteine methyltransferase  28.8 
 
 		 325 aa  86.3  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.443349  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  29.32 
 
 		 816 aa  85.9  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0238  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  28.19 
 
 		 609 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  29.41 
 
 		 804 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  28.71 
 
 		 800 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0325  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  25.66 
 
 		 605 aa  84  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3344  homocysteine S-methyltransferase  27.56 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37350  homocysteine methyltransferase  26.32 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2740  homocysteine methyltransferase  27.59 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1508  homocysteine S-methyltransferase  27.19 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  26.79 
 
 		 1215 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1315  homocysteine S-methyltransferase  27.74 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0420975  normal  0.31637 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3471  homocysteine methyltransferase  28.57 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0073  homocysteine S-methyltransferase  24.68 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  26.77 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4088  B12-dependent methionine synthase  26.36 
 
 		 1251 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25.49 
 
 		 1132 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5466  homocysteine methyltransferase  27.04 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0696243  hitchhiker  0.00895387 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  27.81 
 
 		 780 aa  76.6  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  26.65 
 
 		 1208 aa  77  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0283  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  29.15 
 
 		 615 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  27.01 
 
 		 1133 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  26.76 
 
 		 1158 aa  76.3  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25.16 
 
 		 1132 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  28.62 
 
 		 803 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  26.21 
 
 		 1132 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  26.21 
 
 		 1133 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  27.69 
 
 		 1208 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0839  homocysteine S-methyltransferase  26.4 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  25.61 
 
 		 807 aa  75.1  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25.49 
 
 		 1132 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25.49 
 
 		 1132 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  25.87 
 
 		 1191 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  28.72 
 
 		 818 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  26.52 
 
 		 1168 aa  74.7  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3384  B12-dependent methionine synthase  25.48 
 
 		 1210 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.73359  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0118  methionine synthase (B12-dependent)  26.75 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0708  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  26.82 
 
 		 616 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0266464  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  26.5 
 
 		 813 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0872  B12-dependent methionine synthase  25.68 
 
 		 1238 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3739  B12-dependent methionine synthase  25.83 
 
 		 1252 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0167  homocysteine S-methyltransferase  26.69 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25.16 
 
 		 1163 aa  73.2  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1115  B12-dependent methionine synthase  23.94 
 
 		 1241 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0710  B12-dependent methionine synthase  25.91 
 
 		 1240 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  28.95 
 
 		 806 aa  72.8  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0149  homocysteine S-methyltransferase  25.66 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.637039 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  26.05 
 
 		 1132 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  26.05 
 
 		 1132 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  27.67 
 
 		 1171 aa  72.4  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  27.92 
 
 		 1214 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1305  homocysteine methyltransferase  25.54 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.343801  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4240  methionine synthase (B12-dependent)  25.37 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.826519  normal  0.408833 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1007  B12-dependent methionine synthase  25.67 
 
 		 1244 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1524  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  27.89 
 
 		 615 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0156  homocysteine S-methyltransferase  25.82 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  25.16 
 
 		 804 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3368  B12-dependent methionine synthase  25.67 
 
 		 1233 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  24.22 
 
 		 1176 aa  70.9  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0973  B12-dependent methionine synthase  25.67 
 
 		 1244 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>