31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2903 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2903  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  692    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2025  putative carboxypeptidase  45.37 
 
 
373 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3538  hypothetical protein  45.27 
 
 
355 aa  306  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4525  zinc carboxypeptidase-related protein  44.31 
 
 
344 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.988976  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  43.45 
 
 
365 aa  303  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0051  putative carboxypeptidase  44.64 
 
 
365 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.203157 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4190  putative metalloproteinase (zinc carboxypeptidase-related protein)  44.88 
 
 
343 aa  301  7.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0840  zinc carboxypeptidase-related protein  44.28 
 
 
344 aa  299  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.387339  normal  0.0855585 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0368  zinc-binding domain-containing protein  45.1 
 
 
363 aa  297  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.499164  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4289  hypothetical protein  45.51 
 
 
340 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4624  peptidase M14 carboxypeptidase A  44.58 
 
 
344 aa  295  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.144195 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0774  zinc carboxypeptidase-related protein  47.87 
 
 
340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3437  hypothetical protein  43.81 
 
 
365 aa  280  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1285  hypothetical protein  41.95 
 
 
356 aa  272  6e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709142  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1742  zinc carboxypeptidase-related protein  43.53 
 
 
342 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.212306  hitchhiker  0.00119795 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2472  oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring)  43.28 
 
 
341 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.319923  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3019  zinc carboxypeptidase-related protein  47.37 
 
 
340 aa  264  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.266904  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2643  zinc carboxypeptidase-related protein  43.4 
 
 
342 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2718  zinc carboxypeptidase-related protein  43.4 
 
 
342 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.792819  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2282  zinc carboxypeptidase-related protein  43.32 
 
 
346 aa  262  6e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.548754  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2354  zinc carboxypeptidase-related protein  43.32 
 
 
341 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2604  zinc carboxypeptidase-related protein  43.24 
 
 
342 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1975  Zinc carboxypeptidase-related protein  43.75 
 
 
342 aa  259  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1892  hypothetical protein  21.12 
 
 
364 aa  56.2  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1751  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.81 
 
 
304 aa  46.2  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.33 
 
 
606 aa  45.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.33 
 
 
606 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2765  Zn-dependent enzyme, member of deacylase/carboxypeptidase family protein  31 
 
 
309 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2263  hypothetical protein  30.93 
 
 
306 aa  43.9  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.05 
 
 
506 aa  43.1  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.05 
 
 
618 aa  43.1  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.158 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>