200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2832 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2832  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
213 aa  441  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84064  normal  0.0678708 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  36.23 
 
 
221 aa  159  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  37.32 
 
 
233 aa  157  9e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  38.76 
 
 
216 aa  151  7e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  35.12 
 
 
210 aa  151  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  36.23 
 
 
216 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
221 aa  149  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  34.31 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  34.43 
 
 
223 aa  144  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  35.71 
 
 
224 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  33.8 
 
 
223 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  35.71 
 
 
224 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
223 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  36.84 
 
 
214 aa  140  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  34.29 
 
 
224 aa  140  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  34.11 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  35.35 
 
 
211 aa  139  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  34.13 
 
 
222 aa  138  6e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0970  DSBA oxidoreductase  35.38 
 
 
216 aa  138  7e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227612 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  33.96 
 
 
214 aa  138  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  33.97 
 
 
222 aa  137  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  35.41 
 
 
215 aa  136  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  33.65 
 
 
217 aa  135  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3751  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1441  DSBA oxidoreductase  34.93 
 
 
214 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0402577 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  37.8 
 
 
215 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  30.48 
 
 
227 aa  132  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  37.32 
 
 
215 aa  131  9e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.31 
 
 
219 aa  131  9e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_003296  RS01681  hypothetical protein  33.99 
 
 
222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2852  polyketide biosynthesis associated protein  34.93 
 
 
214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0261  DSBA oxidoreductase  35.38 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0132035 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2709  DSBA oxidoreductase  34.29 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111017  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3987  DSBA oxidoreductase  36.15 
 
 
228 aa  129  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
231 aa  128  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5788  DSBA oxidoreductase  35.24 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487063 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1917  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
217 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0210  DSBA oxidoreductase  32.54 
 
 
213 aa  125  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  31.16 
 
 
230 aa  125  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  29.56 
 
 
218 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
220 aa  123  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  31.88 
 
 
221 aa  121  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  31.43 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  32.87 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  30.81 
 
 
231 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  31.16 
 
 
221 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  35.38 
 
 
221 aa  118  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  30 
 
 
225 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  33.01 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2391  putative DSBA oxidoreductase  29.63 
 
 
217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  32.83 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0115  DSBA oxidoreductase  32.73 
 
 
232 aa  116  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0952  DSBA oxidoreductase  30.1 
 
 
219 aa  116  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440606  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  32.56 
 
 
212 aa  116  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  30.43 
 
 
242 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  32.72 
 
 
248 aa  115  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  30.92 
 
 
221 aa  115  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
217 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  35.02 
 
 
221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0967  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 
220 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431519  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3598  DSBA oxidoreductase  30.66 
 
 
220 aa  112  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1034  DSBA oxidoreductase  30.65 
 
 
215 aa  112  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2296  DSBA oxidoreductase  32.87 
 
 
221 aa  112  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00720993  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  31.07 
 
 
214 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1948  DSBA oxidoreductase  34.13 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1642  DSBA oxidoreductase  31.92 
 
 
218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.420211  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  30.58 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3318  DSBA oxidoreductase  31.9 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5500  DSBA oxidoreductase  32.06 
 
 
217 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.790496  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0963  DSBA oxidoreductase  26.24 
 
 
230 aa  109  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0391729  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0020  DSBA oxidoreductase  32.38 
 
 
211 aa  108  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 
209 aa  108  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4948  DSBA oxidoreductase  31.75 
 
 
221 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.576797 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5763  DSBA oxidoreductase  32.7 
 
 
218 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0796  DSBA oxidoreductase  31.22 
 
 
221 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  28.5 
 
 
218 aa  105  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  30.24 
 
 
237 aa  103  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3825  DSBA oxidoreductase  30.14 
 
 
217 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0328358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  29.13 
 
 
234 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  33.95 
 
 
239 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01724  polyketide synthase  30.88 
 
 
213 aa  101  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  29.47 
 
 
235 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1542  DSBA oxidoreductase  31.16 
 
 
224 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.208286 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10641  DSBA-like thioredoxin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G06250)  29.11 
 
 
202 aa  99  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2136  DSBA oxidoreductase  30.33 
 
 
213 aa  98.6  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  31.46 
 
 
237 aa  98.2  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  29.81 
 
 
235 aa  98.2  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  29.03 
 
 
230 aa  98.2  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  27.8 
 
 
229 aa  98.2  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  29.72 
 
 
256 aa  97.4  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1148  DSBA oxidoreductase  31.96 
 
 
237 aa  97.8  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 
220 aa  96.7  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2195  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 
215 aa  95.5  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  27.91 
 
 
243 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  27.91 
 
 
243 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 
235 aa  92.8  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  28.44 
 
 
235 aa  92.8  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>