More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2769 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  100 
 
 
401 aa  758    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  64.43 
 
 
403 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  63.87 
 
 
403 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  57.54 
 
 
395 aa  413  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  62.82 
 
 
403 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  60.92 
 
 
399 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  63.31 
 
 
400 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  63.59 
 
 
400 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  63.92 
 
 
403 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  56.71 
 
 
413 aa  391  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  62.18 
 
 
379 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  54.22 
 
 
400 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  49.87 
 
 
408 aa  341  1e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  47.75 
 
 
401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  44.95 
 
 
404 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  45.01 
 
 
404 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  42.39 
 
 
400 aa  308  6.999999999999999e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  43.12 
 
 
402 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  44.14 
 
 
402 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  43.37 
 
 
404 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  44.39 
 
 
402 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  42.45 
 
 
397 aa  300  4e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  41.58 
 
 
398 aa  298  9e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  43.7 
 
 
451 aa  297  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  43.7 
 
 
451 aa  297  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  43.7 
 
 
451 aa  297  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  43.7 
 
 
451 aa  297  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  43.7 
 
 
451 aa  297  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  43.7 
 
 
412 aa  296  4e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  43.54 
 
 
394 aa  296  4e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  43.32 
 
 
407 aa  296  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  41.13 
 
 
396 aa  294  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1136  major facilitator superfamily MFS_1  45.97 
 
 
408 aa  292  6e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  44.39 
 
 
403 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  44.39 
 
 
403 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0207  putative transporter transmembrane protein  41.49 
 
 
408 aa  285  7e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1945  major facilitator transporter  41.03 
 
 
401 aa  286  7e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  40.16 
 
 
410 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  41.82 
 
 
411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  40.16 
 
 
410 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2011  major facilitator superfamily MFS_1  41.33 
 
 
409 aa  283  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4801  major facilitator transporter  43.67 
 
 
376 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6830  major facilitator transporter  45.24 
 
 
394 aa  279  8e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0719  major facilitator superfamily MFS_1  42.64 
 
 
400 aa  277  3e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2738  major facilitator superfamily MFS_1  41.41 
 
 
416 aa  275  8e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3800  major facilitator transporter  43.51 
 
 
420 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131241 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  44.57 
 
 
402 aa  274  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1160  major facilitator superfamily MFS_1  40.16 
 
 
403 aa  273  5.000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000554807  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0835  major facilitator superfamily MFS_1  43.2 
 
 
433 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0782  major facilitator superfamily MFS_1  43.21 
 
 
384 aa  263  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2319  major facilitator superfamily MFS_1  38.77 
 
 
396 aa  263  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805208  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4887  major facilitator transporter  42.51 
 
 
398 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5383  major facilitator transporter  42.51 
 
 
398 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1579  major facilitator family transporter  42.9 
 
 
402 aa  259  7e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 
412 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  41.79 
 
 
397 aa  248  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35500  Major facilitator superfamily transporter  41.19 
 
 
376 aa  243  5e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  39.52 
 
 
408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  36.19 
 
 
418 aa  232  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7381  permease  42.21 
 
 
402 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0862221  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4854  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 
395 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011677  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  36.76 
 
 
406 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  36.03 
 
 
415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  36.01 
 
 
415 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  40.39 
 
 
408 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  40.39 
 
 
408 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  40.74 
 
 
413 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2898  major facilitator superfamily MFS_1  42.35 
 
 
402 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.537958  normal  0.729301 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  38.54 
 
 
402 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  37.6 
 
 
394 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  36.56 
 
 
397 aa  208  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  37.27 
 
 
402 aa  206  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  32.9 
 
 
399 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  36.2 
 
 
398 aa  204  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  37.18 
 
 
392 aa  192  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  36.73 
 
 
390 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  36.69 
 
 
407 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 
422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  35.29 
 
 
410 aa  180  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 
735 aa  172  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  33.68 
 
 
397 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0427  major facilitator superfamily MFS_1  36.8 
 
 
390 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.064985  normal  0.054119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0860  major facilitator transporter  36.44 
 
 
397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22240  arabinose efflux permease family protein  30.73 
 
 
409 aa  161  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  30.35 
 
 
404 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  31.2 
 
 
404 aa  159  7e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1788  major facilitator transporter  32.48 
 
 
399 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0140849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2718  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 
403 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00439118  normal  0.195622 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  35.73 
 
 
405 aa  157  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  31.67 
 
 
408 aa  153  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1543  major facilitator superfamily MFS_1  33.97 
 
 
387 aa  153  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329427  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  32.72 
 
 
398 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  35.21 
 
 
397 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  33.33 
 
 
400 aa  150  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  32.24 
 
 
389 aa  149  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3686  carbohydrate transporter, putative  32.4 
 
 
399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  33.82 
 
 
390 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  32.15 
 
 
426 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  31.93 
 
 
391 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  31.66 
 
 
391 aa  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>