More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2699 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2699  xanthine dehydrogenase small subunit  100 
 
 
499 aa  1034    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4278  xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  45.17 
 
 
484 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.513605  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02515  putative xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  41.34 
 
 
480 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2751  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  44.58 
 
 
479 aa  381  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433722  normal  0.51663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1590  xanthine dehydrogenase, small subunit  44.42 
 
 
484 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.597851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3604  xanthine dehydrogenase, small subunit  44.63 
 
 
484 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.703198  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1797  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  43.27 
 
 
484 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.014868  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3842  xanthine dehydrogenase, small subunit  44.75 
 
 
484 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.977655  normal  0.775119 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4864  xanthine dehydrogenase, iron-sulfur binding subunit  43.18 
 
 
494 aa  369  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22290  xanthine dehydrogenase, small subunit  43.35 
 
 
496 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2424  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  42.35 
 
 
480 aa  365  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3660  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  42.6 
 
 
484 aa  363  6e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807153  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0713  xanthine dehydrogenase, small subunit  40.62 
 
 
512 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1815  ferredoxin:molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:[2Fe-2S]-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  43.38 
 
 
484 aa  362  9e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522719  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2704  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  41.7 
 
 
487 aa  360  3e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3809  xanthine dehydrogenase  42.97 
 
 
484 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44710  xanthine dehydrogenase  43.27 
 
 
484 aa  356  5e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0199275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0950  xanthine dehydrogenase, subunit A  41.77 
 
 
543 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4257  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  41.46 
 
 
481 aa  354  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2425  ferredoxin:molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:(2Fe-2S)-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  39.13 
 
 
500 aa  353  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0771886  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1130  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  41.25 
 
 
507 aa  353  5e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.16283  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0893  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  40.08 
 
 
498 aa  349  6e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366411  normal  0.919592 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1035  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  39.31 
 
 
506 aa  345  1e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.22588  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3041  xanthine dehydrogenase, small subunit  41.77 
 
 
515 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0266852 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2448  xanthine dehydrogenase, small subunit  39.68 
 
 
507 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5002  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  39.51 
 
 
512 aa  340  4e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3102  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  39.27 
 
 
507 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238239  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0860  xanthine dehydrogenase, small subunit  39.88 
 
 
504 aa  335  1e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2833  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  38.92 
 
 
492 aa  335  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0451  xanthine dehydrogenase small subunit  38.81 
 
 
496 aa  335  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608502  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4499  xanthine dehydrogenase small subunit  40.21 
 
 
496 aa  334  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.999061  normal  0.0980927 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4620  xanthine dehydrogenase small subunit  40.29 
 
 
493 aa  334  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2300  xanthine dehydrogenase small subunit  41.56 
 
 
476 aa  334  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.289203  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3320  xanthine dehydrogenase  40.08 
 
 
490 aa  333  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151633  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1453  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  40.98 
 
 
461 aa  332  1e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0349  xanthine dehydrogenase, putative  39.54 
 
 
492 aa  331  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0365  xanthine dehydrogenase, small subunit  39.54 
 
 
492 aa  331  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3133  xanthine dehydrogenase, small subunit  39.92 
 
 
488 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207802  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1789  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  43.68 
 
 
484 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1922  xanthine dehydrogenase, small subunit  38.03 
 
 
504 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.501378 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0804  xanthine dehydrogenase, small subunit  40.42 
 
 
523 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0728  xanthine dehydrogenase, small subunit  39.87 
 
 
527 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3907  xanthine dehydrogenase, small subunit  39.49 
 
 
542 aa  326  5e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0711  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  40.08 
 
 
520 aa  326  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0348  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  39.58 
 
 
528 aa  326  7e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0658875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3720  xanthine dehydrogenase, small subunit  38.2 
 
 
493 aa  325  9e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0793  xanthine dehydrogenase, small subunit  37.86 
 
 
507 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.229921 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0832  2Fe-2S ferredoxin, iron-sulfur binding site  39.58 
 
 
528 aa  325  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2095  putative xanthine dehydrogenase (subunit A) oxidoreductase protein  39.41 
 
 
516 aa  323  5e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2861  xanthine dehydrogenase, small subunit  40.87 
 
 
488 aa  323  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0406506  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2552  xanthine dehydrogenase, small subunit  39 
 
 
526 aa  322  7e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.865646 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2422  xanthine dehydrogenase, small subunit  37.5 
 
 
505 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1481  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  35.43 
 
 
571 aa  322  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0612404 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3460  xanthine dehydrogenase, small subunit  38.56 
 
 
530 aa  322  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266307 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3759  xanthine dehydrogenase small subunit  41.97 
 
 
467 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3924  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  39.5 
 
 
516 aa  319  7e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2246  xanthine dehydrogenase, small subunit  37.47 
 
 
504 aa  317  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1140  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  35.96 
 
 
552 aa  316  7e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.578898  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2042  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  39.7 
 
 
505 aa  316  8e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0871  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  39.7 
 
 
505 aa  316  8e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222869  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3199  xanthine dehydrogenase family protein, iron-sulfur-binding/FAD-binding subunit  39.7 
 
 
505 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188115  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3160  xanthine dehydrogenase, small subunit  39.7 
 
 
505 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3215  xanthine dehydrogenase  39.7 
 
 
505 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.413066  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3886  putative xanthine dehydrogenase  36.83 
 
 
507 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5910  xanthine dehydrogenase, small subunit  37.34 
 
 
537 aa  313  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2705  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  39.48 
 
 
505 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1905  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  39.48 
 
 
505 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.259352  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0226  xanthine dehydrogenase, small subunit  38.55 
 
 
497 aa  311  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.183423  normal  0.106399 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1155  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  39.28 
 
 
518 aa  311  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.874334  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0499  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  39.67 
 
 
467 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.258857 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3948  hypothetical protein  39.6 
 
 
485 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.804932  normal  0.121566 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1788  xanthine dehydrogenase, small subunit  39.87 
 
 
467 aa  303  6.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.350368  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3554  xanthine dehydrogenase, small subunit  38.99 
 
 
485 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3237  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  38.79 
 
 
485 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492862  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1408  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  39.27 
 
 
592 aa  300  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332531  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1339  xanthine dehydrogenase, small subunit  38.25 
 
 
501 aa  298  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00017372  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2603  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  39.87 
 
 
468 aa  296  4e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2958  putative xanthine dehydrogenase  37.37 
 
 
483 aa  290  4e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0528227 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0799  putative xanthine dehydrogenase (subunit A) oxidoreductase protein  38.51 
 
 
515 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0937  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  36.76 
 
 
486 aa  279  8e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0259  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  35.27 
 
 
514 aa  270  5.9999999999999995e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1636  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  38.11 
 
 
490 aa  266  5.999999999999999e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6765  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.08 
 
 
470 aa  258  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05613  Xanthine dehydrogenase (EC 1.17.1.4)(Purine hydroxylase I) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12553]  31.75 
 
 
1363 aa  241  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  0.0769199 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0433  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  32.16 
 
 
450 aa  218  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.649108  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1738  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  34.97 
 
 
305 aa  149  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0920  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  30.8 
 
 
288 aa  137  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.815419  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0777  xanthine dehydrogenase, FAD-binding protein, putative  30.8 
 
 
288 aa  137  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5969  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  34.77 
 
 
275 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.862592  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2010  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  32.61 
 
 
284 aa  133  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0448  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  30.11 
 
 
282 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.221209  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2413  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  32.6 
 
 
276 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2023  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.1 
 
 
272 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15968  predicted protein  44.44 
 
 
1387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1819  medium FAD-binding subunit of molybdenum enzyme  31.8 
 
 
280 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2836  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding protein  33.45 
 
 
289 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0853655  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09178  conserved hypothetical protein  27.96 
 
 
1350 aa  124  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4157  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  31.23 
 
 
292 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.533292 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2772  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.05 
 
 
283 aa  120  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137285  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4005  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  29.82 
 
 
287 aa  119  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218277  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>