More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2665 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  100 
 
 
396 aa  832    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  70.03 
 
 
366 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  69.21 
 
 
366 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  70.25 
 
 
366 aa  549  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  69.29 
 
 
367 aa  548  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  70.03 
 
 
366 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  70.03 
 
 
366 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  66.84 
 
 
390 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0339  oxidoreductase FAD-binding subunit  69.7 
 
 
366 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0495555  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  69.42 
 
 
368 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  69.15 
 
 
366 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  68.77 
 
 
368 aa  538  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  64.95 
 
 
365 aa  513  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  48.7 
 
 
382 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  48.41 
 
 
382 aa  338  8e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  48.72 
 
 
380 aa  338  8e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  48.41 
 
 
382 aa  338  8e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  47.41 
 
 
385 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  48.43 
 
 
380 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  48.43 
 
 
381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  48.15 
 
 
381 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  48.15 
 
 
380 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  48.15 
 
 
380 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  48.15 
 
 
380 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  43.04 
 
 
382 aa  335  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  48.26 
 
 
379 aa  333  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  47.69 
 
 
382 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  47.69 
 
 
382 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  47.69 
 
 
382 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  47.54 
 
 
382 aa  330  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  47.4 
 
 
386 aa  330  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  44.44 
 
 
414 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  43.43 
 
 
418 aa  325  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  43.79 
 
 
355 aa  325  6e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  46.24 
 
 
379 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  45.53 
 
 
375 aa  316  5e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2855  ferredoxin  44.44 
 
 
394 aa  315  8e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0484  ferredoxin  43.79 
 
 
364 aa  312  5.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  45.64 
 
 
375 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  44.38 
 
 
381 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  45.24 
 
 
375 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.61 
 
 
383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  41.78 
 
 
362 aa  297  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1462  NADH oxidoreductase, putative  41.5 
 
 
372 aa  296  3e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  42.49 
 
 
358 aa  295  7e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5978  ferredoxin  42.21 
 
 
364 aa  294  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.430172  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.2 
 
 
361 aa  293  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  42.66 
 
 
381 aa  285  9e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.73 
 
 
374 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1711  ferredoxin  39.61 
 
 
372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1175  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.11 
 
 
371 aa  281  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4230  FHA domain containing protein  42.53 
 
 
606 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4292  FHA domain containing protein  42.53 
 
 
606 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.168951  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3979  ferredoxin  41.95 
 
 
353 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.13 
 
 
380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  39.83 
 
 
356 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  39.83 
 
 
363 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.74 
 
 
388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.81 
 
 
376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3218  ferredoxin  37.4 
 
 
355 aa  270  4e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33819  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.85 
 
 
380 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.17 
 
 
387 aa  269  7e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.88 
 
 
406 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.22 
 
 
367 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.67 
 
 
403 aa  265  8e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  38.1 
 
 
365 aa  260  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1002  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.7 
 
 
363 aa  259  4e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1261  oxidoreductase FAD-binding subunit  40 
 
 
407 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  42.15 
 
 
325 aa  251  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  40.5 
 
 
356 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003800  NADH oxidoreductase Hcr  34.17 
 
 
351 aa  210  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4896  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.92 
 
 
342 aa  209  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.699955 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  35.36 
 
 
662 aa  206  4e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  35.36 
 
 
585 aa  202  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  32.18 
 
 
605 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  30.91 
 
 
373 aa  190  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  32.18 
 
 
605 aa  188  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.88 
 
 
669 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  33.82 
 
 
625 aa  186  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.69 
 
 
585 aa  181  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  31.35 
 
 
670 aa  179  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  31.36 
 
 
627 aa  179  7e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.51 
 
 
702 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  31.28 
 
 
597 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5188  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.66 
 
 
356 aa  166  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726966  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1665  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.7 
 
 
334 aa  163  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.212931  normal  0.785012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4306  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.14 
 
 
329 aa  162  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.264864  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2272  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  29.71 
 
 
335 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2372  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  29.59 
 
 
335 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1033  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  29.05 
 
 
322 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1416  ferredoxin  30.31 
 
 
353 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15311  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3782  ferredoxin  31.49 
 
 
352 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00690243  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2973  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.71 
 
 
341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1546  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  27.53 
 
 
354 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729888  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00877  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  29.33 
 
 
322 aa  153  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2770  ferredoxin  29.33 
 
 
322 aa  153  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0945  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  29.33 
 
 
322 aa  153  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.968361  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2459  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  29.33 
 
 
322 aa  153  5e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0901  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  29.33 
 
 
322 aa  153  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.843947 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00883  hypothetical protein  29.33 
 
 
322 aa  153  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>