83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2504 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  353  5.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  35.12 
 
 
457 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  53.49 
 
 
532 aa  99.4  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  41.46 
 
 
461 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  27.61 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  30.06 
 
 
452 aa  66.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7321  AAA ATPase  38.67 
 
 
455 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  43.84 
 
 
427 aa  62  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  24.26 
 
 
228 aa  57.8  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0853  ATPase  35.63 
 
 
445 aa  57.4  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  31.48 
 
 
440 aa  57  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1645  ATPase  41.67 
 
 
451 aa  57  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  41.67 
 
 
423 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  43.06 
 
 
450 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3206  ATPase  36.99 
 
 
443 aa  55.8  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  42.03 
 
 
446 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  32.71 
 
 
437 aa  55.5  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  44.78 
 
 
336 aa  54.7  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  27.43 
 
 
410 aa  54.7  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  28.95 
 
 
454 aa  53.9  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  43.33 
 
 
284 aa  53.9  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0945  ATPase  40.58 
 
 
448 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  35.37 
 
 
976 aa  52.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3405  ATP-binding protein  38.89 
 
 
454 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00177365  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  27.07 
 
 
430 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1513  hypothetical protein  36.14 
 
 
444 aa  51.2  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  26.4 
 
 
455 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  45.28 
 
 
619 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  41.79 
 
 
369 aa  50.4  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0181  ATPase  36.23 
 
 
457 aa  50.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.269249  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  41.07 
 
 
642 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  37.74 
 
 
451 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  30.34 
 
 
409 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1004  hypothetical protein  36.99 
 
 
567 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0319616 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  26.21 
 
 
449 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  28.24 
 
 
530 aa  48.5  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  31.25 
 
 
421 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  28.21 
 
 
533 aa  48.5  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5274  hypothetical protein  25.93 
 
 
519 aa  48.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  31.51 
 
 
712 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  23.68 
 
 
588 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2727  ABC transporter  26.32 
 
 
601 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  43.48 
 
 
410 aa  46.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  39.66 
 
 
418 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2084  hypothetical protein  27.87 
 
 
506 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330543 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  33.33 
 
 
439 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  35.09 
 
 
203 aa  45.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  27.63 
 
 
442 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  32.08 
 
 
403 aa  45.4  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3922  hypothetical protein  35.62 
 
 
440 aa  45.1  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  30 
 
 
582 aa  45.1  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  28.57 
 
 
452 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  28.36 
 
 
423 aa  44.7  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  32.26 
 
 
422 aa  45.1  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  37.29 
 
 
445 aa  44.7  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  34.85 
 
 
368 aa  44.7  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.85 
 
 
429 aa  44.7  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1718  AAA ATPase  32.43 
 
 
285 aa  44.3  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000684443  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4944  AAA ATPase  34.15 
 
 
540 aa  44.3  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.051172  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  38.3 
 
 
482 aa  44.3  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  26.09 
 
 
769 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  40.74 
 
 
793 aa  43.9  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  29.63 
 
 
427 aa  44.3  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  34.38 
 
 
368 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  30.36 
 
 
416 aa  43.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  25.22 
 
 
459 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  29.85 
 
 
422 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  30.49 
 
 
408 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  26.32 
 
 
406 aa  43.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1439  AAA ATPase  33.78 
 
 
258 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1735  AAA ATPase  32.95 
 
 
484 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.331613 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4075  hypothetical protein  27.27 
 
 
241 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0432501  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  25.22 
 
 
478 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  27.06 
 
 
453 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4128  hypothetical protein  26.26 
 
 
250 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000150921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1110  hypothetical protein  26.26 
 
 
241 aa  42  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000880553  normal  0.123467 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3851  SMC domain-containing protein  26.26 
 
 
250 aa  42  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.781388  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  33.87 
 
 
378 aa  41.6  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4149  hypothetical protein  26.26 
 
 
250 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0347458  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20730  predicted ATPase  28 
 
 
236 aa  41.6  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2572  SMC domain-containing protein  38.71 
 
 
263 aa  41.2  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0665735  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0512  ABC transporter, ATP-binding protein  41.07 
 
 
215 aa  40.8  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  34.07 
 
 
497 aa  40.8  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>