244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2463 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2463  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 257 aa  524  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2737  AraC family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0062511  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4694  AraC family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2622  AraC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 228 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000237  transcriptional regulator AraC family  35.66 
 
 		 246 aa  125  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  29 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  29.47 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2108  transcriptional regulator, AraC family  28.78 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1930  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1875  AraC family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.63 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2447  AraC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  27.88 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486206  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  25.78 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2350  transcriptional regulator, AraC family  29.94 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0397043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1076  transcriptional regulator, AraC family  29 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  24.32 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  20.63 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  27.96 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2103  AraC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  24.71 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1914  helix-turn-helix domain-containing protein  27 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  26.38 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2016  transcriptional regulator, AraC family  27.11 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296737 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  26.74 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3509  transcriptional regulator, AraC family  27.66 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.551098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  22.57 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  22.75 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  23.94 
 
 		 305 aa  62  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  27.22 
 
 		 244 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  25.79 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  23.14 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  34.94 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1962  transcriptional regulator, AraC family  27.06 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1191  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  28.34 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  25.97 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  24.21 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  29.19 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4151  transcriptional regulator, AraC family  28.65 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0354643  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  37.33 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2830  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1655  hypothetical protein  27.19 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.87 
 
 		 325 aa  55.5  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0383824  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  28.99 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 289 aa  55.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1298  AraC family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00392823  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  27.33 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  26.87 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  29.59 
 
 		 274 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  25.57 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  26.62 
 
 		 289 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3318  Helix-turn-helix, AraC domain protein  24.04 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 297 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1925  transcriptional regulator  29.85 
 
 		 252 aa  52.8  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  35 
 
 		 278 aa  52.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  33.03 
 
 		 272 aa  52.4  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3491  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.16 
 
 		 248 aa  52.4  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1932  AraC family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 236 aa  52.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25000  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  25.7 
 
 		 263 aa  52  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  32.91 
 
 		 268 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6058  transcriptional regulator, AraC family  25.52 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  30.53 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2434  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1969  transcriptional regulator, AraC family  26.12 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0909841  normal  0.074502 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0145  Helix-turn-helix, AraC domain protein  38.46 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5531  AraC family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 264 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7070  transcriptional regulator AraC family  32.32 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2289  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1684  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.28 
 
 		 288 aa  50.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  32.5 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17370  hypothetical protein  22.86 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.0989396 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4318  AraC family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103262  normal  0.531817 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3705  AraC family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 282 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  25.58 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 292 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4183  AraC family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 282 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.43701  normal  0.806695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4039  transcriptional regulator, AraC family  30.26 
 
 		 280 aa  49.7  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0024992  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3824  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 276 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1375  transcriptional regulator, AraC family  24.16 
 
 		 275 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0370  AraC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 281 aa  49.3  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3237  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 281 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601996 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 310 aa  49.7  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  38.57 
 
 		 267 aa  49.3  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4086  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 281 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4280  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 281 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.682937 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3275  transcriptional regulator, AraC family  25.37 
 
 		 229 aa  48.9  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3231  transcriptional regulator, AraC family  35.53 
 
 		 250 aa  49.3  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2324  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 282 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0979  transcriptional regulator, AraC family  29.23 
 
 		 279 aa  48.9  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  0.0613388 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  30.67 
 
 		 277 aa  48.9  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4832  transcriptional regulator  32.38 
 
 		 393 aa  48.9  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.304205  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0886  AraC family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 316 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0693  AraC family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1069  hypothetical protein  34.48 
 
 		 118 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>