230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2356 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  100 
 
 
425 aa  873    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  44.31 
 
 
410 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  44.6 
 
 
412 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3138  exonuclease subunit SbcD  44.58 
 
 
414 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3277  exonuclease subunit SbcD  44.34 
 
 
414 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  47.82 
 
 
404 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3288  exonuclease subunit SbcD  44.34 
 
 
414 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  45.75 
 
 
423 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  43.95 
 
 
442 aa  372  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  44.1 
 
 
408 aa  375  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  44 
 
 
410 aa  360  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1332  exonuclease subunit SbcD  43.79 
 
 
414 aa  360  2e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  45.05 
 
 
414 aa  358  8e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  44.66 
 
 
410 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  45.22 
 
 
408 aa  355  1e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  43.94 
 
 
400 aa  353  4e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  43.94 
 
 
400 aa  352  5e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  43.94 
 
 
400 aa  352  7e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  43.94 
 
 
400 aa  352  7e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  43.94 
 
 
400 aa  352  7e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  43.94 
 
 
400 aa  352  7e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  43.94 
 
 
400 aa  352  7e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  43.94 
 
 
400 aa  352  7e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  43.94 
 
 
400 aa  351  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3442  exonuclease subunit SbcD  41.08 
 
 
483 aa  350  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.289654  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  43.2 
 
 
406 aa  348  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  43.6 
 
 
400 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  43.36 
 
 
400 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  42.35 
 
 
506 aa  343  4e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  43.23 
 
 
400 aa  343  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  43.36 
 
 
400 aa  342  5.999999999999999e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  43.36 
 
 
400 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  42.95 
 
 
425 aa  340  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03136  exonuclease SbcD  42.73 
 
 
515 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  42.59 
 
 
401 aa  340  2.9999999999999998e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  43.41 
 
 
406 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  38.59 
 
 
409 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  37.47 
 
 
409 aa  276  6e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0703  exonuclease SbcD  36.49 
 
 
418 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2569  nuclease SbcCD, D subunit  36.56 
 
 
410 aa  272  9e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2079  nuclease SbcCD, D subunit  36 
 
 
410 aa  268  1e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655722  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  36.36 
 
 
408 aa  267  2e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1371  exodeoxyribonuclease I subunit D  36.71 
 
 
416 aa  263  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  36.21 
 
 
414 aa  263  4.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2541  nuclease SbcCD, D subunit  31.13 
 
 
498 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1159  nuclease SbcCD, D subunit  32.94 
 
 
410 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.067261  normal  0.815946 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1319  nuclease SbcCD, D subunit  36.11 
 
 
411 aa  239  5.999999999999999e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1398  nuclease SbcCD, D subunit  29.16 
 
 
517 aa  226  4e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3717  nuclease SbcCD, D subunit  34.84 
 
 
412 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2025  nuclease SbcCD, D subunit  34.84 
 
 
412 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1557  nuclease SbcCD, D subunit  34.84 
 
 
412 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436101  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0468  nuclease SbcCD, D subunit  34.49 
 
 
417 aa  210  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3765  exonuclease SbcD  33.33 
 
 
414 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0831731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1715  exonuclease SbcD  34.39 
 
 
414 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425872  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3216  exodeoxyribonuclease I subunit D  34.1 
 
 
414 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.569023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1585  nuclease SbcCD, D subunit  33.87 
 
 
412 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583238  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  33 
 
 
409 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1064  exodeoxyribonuclease I subunit D  40.28 
 
 
528 aa  203  5e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  32.5 
 
 
409 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0463  nuclease SbcCD, D subunit  34.49 
 
 
419 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165432  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0434  exodeoxyribonuclease I subunit D  34.72 
 
 
428 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0609998  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1100  nuclease SbcCD, D subunit  39.43 
 
 
537 aa  197  3e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1419  nuclease SbcCD, D subunit  31.8 
 
 
407 aa  187  4e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.366401  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1150  exodeoxyribonuclease I subunit D  34.26 
 
 
418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4885  nuclease SbcCD, D subunit  29.51 
 
 
414 aa  170  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.788581 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1822  nuclease SbcCD, D subunit  32.27 
 
 
467 aa  168  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0304  nuclease SbcCD, D subunit  35.82 
 
 
415 aa  156  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.919689  normal  0.177579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0380  nuclease SbcCD, D subunit  35.07 
 
 
415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.061787  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0348  nuclease SbcCD, D subunit  36.23 
 
 
415 aa  152  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  30.52 
 
 
390 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  30.75 
 
 
407 aa  144  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  31.33 
 
 
386 aa  144  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  31.33 
 
 
387 aa  140  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  30.87 
 
 
418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  31.03 
 
 
386 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  28.48 
 
 
379 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  29.79 
 
 
366 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.4 
 
 
381 aa  133  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  28.19 
 
 
381 aa  133  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  31.94 
 
 
382 aa  133  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  27.13 
 
 
375 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01260  Exodeoxyribonuclease I subunit D  33.43 
 
 
394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  31.56 
 
 
382 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.42 
 
 
390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  26.75 
 
 
385 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  28.99 
 
 
392 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  28.49 
 
 
392 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  29.86 
 
 
393 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  28.29 
 
 
390 aa  123  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  28.75 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1889  nuclease SbcCD, D subunit  27.62 
 
 
407 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0592363  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  26.71 
 
 
409 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  27.54 
 
 
405 aa  120  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  28.28 
 
 
387 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  27.14 
 
 
435 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0051  nuclease SbcCD, D subunit  27.4 
 
 
388 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0123  nuclease SbcCD, D subunit  30.57 
 
 
389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  31.07 
 
 
425 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  31.16 
 
 
381 aa  117  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  27.18 
 
 
386 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>