More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2267 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  100 
 
 		 212 aa  434  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  48.06 
 
 		 223 aa  209  4e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  48.06 
 
 		 223 aa  208  4e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  48.57 
 
 		 210 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  49.03 
 
 		 218 aa  205  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  48.1 
 
 		 210 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  49.05 
 
 		 210 aa  201  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  48.57 
 
 		 210 aa  201  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  47.14 
 
 		 210 aa  197  9e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  48.57 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  48.02 
 
 		 208 aa  196  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  46.86 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  46.19 
 
 		 214 aa  194  6e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  46.89 
 
 		 212 aa  193  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  46.6 
 
 		 207 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  45.59 
 
 		 205 aa  192  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  47.12 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  47.37 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 208 aa  186  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  45.24 
 
 		 210 aa  184  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  45.24 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  43.5 
 
 		 204 aa  180  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  43.15 
 
 		 203 aa  180  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  44.17 
 
 		 203 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  45.05 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  45.32 
 
 		 204 aa  175  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  45.23 
 
 		 216 aa  173  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  43.14 
 
 		 200 aa  173  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  44.56 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  41.38 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  43.96 
 
 		 206 aa  171  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  43.96 
 
 		 206 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  43 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  41.09 
 
 		 209 aa  166  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  45.92 
 
 		 211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  41.15 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0877  dTMP kinase  49.75 
 
 		 221 aa  164  9e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  40.5 
 
 		 688 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  42.93 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  43.87 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  45.5 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  41.71 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  40.49 
 
 		 213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  44.68 
 
 		 211 aa  162  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  43.18 
 
 		 234 aa  161  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  45.16 
 
 		 230 aa  161  7e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  45.13 
 
 		 209 aa  161  7e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  40.87 
 
 		 205 aa  160  9e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  42.49 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  43 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  42.44 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  44.61 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  41.95 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  40 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  42.05 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2498  thymidylate kinase  45.27 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00108643  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  42.51 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  39.29 
 
 		 208 aa  159  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  40.28 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  42.93 
 
 		 209 aa  157  8e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2029  thymidylate kinase  46.27 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000357383  hitchhiker  0.00000127305 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  40.7 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  39.6 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  40.49 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  39.62 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  41.26 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  41.75 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  41.75 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  42.93 
 
 		 211 aa  157  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  44.12 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01094  thymidylate kinase  45.77 
 
 		 213 aa  155  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00390554  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2549  dTMP kinase  45.77 
 
 		 213 aa  155  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000242114  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2226  thymidylate kinase  45.77 
 
 		 213 aa  155  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000221684  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01102  hypothetical protein  45.77 
 
 		 213 aa  155  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00374424  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1477  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 213 aa  155  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000124035  hitchhiker  0.000000000959374 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  41.26 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1220  thymidylate kinase  45.77 
 
 		 213 aa  155  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000082141  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  41.26 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2503  thymidylate kinase  45.77 
 
 		 213 aa  155  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  unclonable  0.0000000113108 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1219  thymidylate kinase  45.77 
 
 		 213 aa  155  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000291901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  41.26 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  41.47 
 
 		 233 aa  155  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  42.44 
 
 		 202 aa  155  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2802  thymidylate kinase  43.84 
 
 		 219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  39.8 
 
 		 230 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  44.22 
 
 		 214 aa  154  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  41.67 
 
 		 205 aa  154  7e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  39.51 
 
 		 219 aa  154  9e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  39.9 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1583  thymidylate kinase  42.93 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000489849  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  41.92 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  39.7 
 
 		 212 aa  153  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  40.58 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1691  thymidylate kinase  42.93 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0210927  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  42.56 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  40.8 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  41.41 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  45.92 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1299  thymidylate kinase  43.96 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.160764  hitchhiker  0.0000000000000573213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>