175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2250 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2250  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 367 aa  759    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.621052 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2893  radical SAM domain-containing protein  51.21 
 
 		 370 aa  388  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00746158  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1715  Radical SAM domain protein  50.54 
 
 		 370 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707887  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1616  Radical SAM domain protein  50 
 
 		 370 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.230625  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0740  radical SAM domain-containing protein  36.11 
 
 		 400 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3365  radical SAM domain-containing protein  35.83 
 
 		 393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.803151  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2723  Radical SAM domain protein  34.01 
 
 		 384 aa  187  4e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  26.02 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  27.04 
 
 		 501 aa  67  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1198  radical SAM domain-containing protein  28.48 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00512944  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  26.26 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  27 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.59 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  26.75 
 
 		 378 aa  62.8  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  22.64 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  26 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  28.57 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0597  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.53 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  26.87 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  25.25 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.64 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  26.49 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  30.28 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  26.83 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  31.1 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  25.47 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  22.54 
 
 		 468 aa  55.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1375  Fe-S oxidoreductase-like  24.29 
 
 		 377 aa  54.7  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.771753  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.1 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0357225  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  27.42 
 
 		 345 aa  54.7  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  28.49 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0024  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  22.87 
 
 		 309 aa  53.9  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  21.83 
 
 		 316 aa  53.9  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  23.78 
 
 		 330 aa  53.5  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  25.13 
 
 		 379 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  26.06 
 
 		 496 aa  53.5  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  22.67 
 
 		 380 aa  53.9  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0122  Radical SAM domain protein  29.71 
 
 		 344 aa  53.1  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0056  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.76 
 
 		 348 aa  52.8  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0808361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1969  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.6 
 
 		 384 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.046264  normal  0.222604 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0919  radical SAM domain-containing protein  28.74 
 
 		 338 aa  52.8  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.13 
 
 		 317 aa  52.8  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4674  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.32 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  23.53 
 
 		 332 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  27.69 
 
 		 406 aa  52  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1154  radical SAM domain-containing protein  23.56 
 
 		 377 aa  52.8  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.812273  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  27.69 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3915  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  20.59 
 
 		 375 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1002  Radical SAM domain protein  21.72 
 
 		 365 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808631  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.24 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  24.11 
 
 		 404 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7629  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.67 
 
 		 342 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4827  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.04 
 
 		 382 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.900722 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0509  coenzyme PQQ synthesis protein E  22.92 
 
 		 389 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2175  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  26 
 
 		 350 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  24.1 
 
 		 333 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  27.14 
 
 		 373 aa  50.4  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  25.36 
 
 		 428 aa  50.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1280  Radical SAM domain protein  27.23 
 
 		 346 aa  50.4  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0405  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.13 
 
 		 386 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1036  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.91 
 
 		 298 aa  50.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643895  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0401  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.62 
 
 		 376 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0376  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.62 
 
 		 376 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  29.09 
 
 		 399 aa  49.7  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 365 aa  49.7  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1335  hypothetical protein  28.66 
 
 		 363 aa  49.7  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.861062 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  23.64 
 
 		 479 aa  49.7  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  23.66 
 
 		 330 aa  49.7  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  21.67 
 
 		 344 aa  49.7  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.460525 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  28.66 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.54 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.04 
 
 		 345 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  29.09 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0143  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.02 
 
 		 334 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.391723 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1970  Radical SAM domain protein  24.89 
 
 		 346 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  29.09 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0393  metallo cofactor biosynthesis protein  26.72 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  22.15 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  26.79 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1814  radical SAM domain-containing protein  22.71 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  24.21 
 
 		 372 aa  47.8  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1915  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.32 
 
 		 321 aa  48.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0454  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.94 
 
 		 368 aa  47.8  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38780  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.53 
 
 		 381 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  26.25 
 
 		 358 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3305  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.53 
 
 		 370 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.08 
 
 		 344 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292381  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2197  radical SAM domain-containing protein  27.38 
 
 		 368 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  24.54 
 
 		 393 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0591  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.42 
 
 		 328 aa  47.4  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  28.48 
 
 		 393 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0350  radical SAM domain-containing protein  25.66 
 
 		 359 aa  47.4  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.91 
 
 		 298 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.370128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  27.68 
 
 		 369 aa  46.6  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  24.55 
 
 		 395 aa  46.6  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>