252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2236 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2236  SirA family protein  100 
 
 
77 aa  161  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.278986  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  71.83 
 
 
80 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  69.01 
 
 
80 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  69.01 
 
 
80 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  69.01 
 
 
80 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44270  sulfur transfer protein SirA  69.01 
 
 
79 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3766  sulfur transfer protein SirA  69.01 
 
 
79 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  64 
 
 
83 aa  104  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20060  sulfur transfer protein SirA  69.01 
 
 
85 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3888  sulfur transfer protein SirA  66.2 
 
 
83 aa  100  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2018  SirA protein, putative  62.5 
 
 
84 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0674453  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  64.79 
 
 
84 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  54.79 
 
 
81 aa  94  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2411  SirA-like protein  55.07 
 
 
83 aa  88.2  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0059  SirA-like  50.68 
 
 
86 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1155  regulatory protein, MarR  55.88 
 
 
82 aa  84.3  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0054  hypothetical protein  49.32 
 
 
86 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  53.42 
 
 
81 aa  82  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0140  SirA family protein  44.32 
 
 
97 aa  82  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  52.05 
 
 
81 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  52.11 
 
 
81 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0011  sulfur transfer protein SirA  53.42 
 
 
81 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0013  sulfur transfer protein SirA  52.05 
 
 
81 aa  79  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04046  sirA protein  54.41 
 
 
86 aa  79.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  52.94 
 
 
81 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  52.11 
 
 
81 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  52.11 
 
 
81 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4280  SirA-like  48.68 
 
 
83 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.277621  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  52.11 
 
 
81 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  52.05 
 
 
81 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0225  regulator of information in SirA family protein  49.32 
 
 
78 aa  77.8  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0012  sulfur transfer protein SirA  50.68 
 
 
81 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1572  sulfur transfer protein SirA  47.06 
 
 
79 aa  77.4  0.00000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3770  hypothetical protein  51.47 
 
 
111 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3890  hypothetical protein  51.47 
 
 
111 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3780  hypothetical protein  51.47 
 
 
111 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3950  hypothetical protein  51.47 
 
 
111 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.785107  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  51.47 
 
 
81 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  51.47 
 
 
81 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0029  redox protein regulator of disulfide bond formation  51.47 
 
 
99 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0748983  normal  0.0110056 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3847  hypothetical protein  51.47 
 
 
111 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0021  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 
81 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.628095  hitchhiker  0.000000017124 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  50 
 
 
81 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  50 
 
 
81 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 
81 aa  75.1  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3877  sulfur transfer protein SirA  51.47 
 
 
81 aa  75.1  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.899871  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 
81 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  49.28 
 
 
81 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0019  sulfur transfer protein SirA  51.47 
 
 
81 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0232  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 
81 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  50 
 
 
81 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 
81 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 
81 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3986  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1233  SirA family protein  47.06 
 
 
79 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1263  SirA family protein  47.06 
 
 
79 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600838  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4185  SirA family protein  47.06 
 
 
79 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312975  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2968  sulfur transfer protein SirA  47.83 
 
 
83 aa  73.6  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0282279  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0205  SirA family protein  48.53 
 
 
81 aa  73.6  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0010  sirA protein  46.38 
 
 
81 aa  72.4  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001993  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusA  51.47 
 
 
82 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1367  SirA-like  40.54 
 
 
79 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463137  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  47.06 
 
 
81 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3957  hypothetical protein  44.29 
 
 
83 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0092  sulfur transfer protein SirA  48.53 
 
 
80 aa  71.6  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00453  sulfur transfer protein SirA  51.47 
 
 
82 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1544  SirA-like  44.29 
 
 
83 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409096  normal  0.0539174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4391  hypothetical protein  43.66 
 
 
83 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3979  SirA family protein  45.71 
 
 
79 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  47.06 
 
 
81 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51310  hypothetical protein  42.25 
 
 
83 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2495  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 
82 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  45.59 
 
 
81 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35370  SirA-like protein  41.43 
 
 
83 aa  67  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1659  SirA family protein  41.18 
 
 
79 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.995311  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  36.23 
 
 
76 aa  63.9  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  37.68 
 
 
77 aa  62  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  36.49 
 
 
76 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  36.49 
 
 
76 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  36.49 
 
 
75 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  36.49 
 
 
76 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  36.99 
 
 
76 aa  60.8  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  38.24 
 
 
76 aa  60.8  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  35.71 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  39.47 
 
 
77 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  35.14 
 
 
76 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.21 
 
 
831 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  35.29 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  35.29 
 
 
74 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  35.14 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  38.03 
 
 
72 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  36.49 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  33.33 
 
 
78 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  32 
 
 
75 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  35.14 
 
 
76 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  33.82 
 
 
76 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  37.84 
 
 
75 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  32 
 
 
75 aa  57.4  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>