More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2175 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4247  ornithine decarboxylase  76.8 
 
 		 387 aa  637    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12320  Ornithine decarboxylase  77.84 
 
 		 387 aa  641    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2175  ornithine decarboxylase  100 
 
 		 388 aa  791    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.174065 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0801  ornithine decarboxylase  77.06 
 
 		 387 aa  637    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0077  ornithine decarboxylase  77.66 
 
 		 391 aa  633  1e-180  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58630  ornithine decarboxylase  76.8 
 
 		 387 aa  632  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0801  ornithine decarboxylase  75.77 
 
 		 387 aa  629  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5135  ornithine decarboxylase  76.55 
 
 		 387 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0894  ornithine decarboxylase  75 
 
 		 387 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.199626 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4314  ornithine decarboxylase  75 
 
 		 387 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0146694 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0908  ornithine decarboxylase  74.74 
 
 		 387 aa  621  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226551 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0864  ornithine decarboxylase  76.88 
 
 		 371 aa  610  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390948  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4572  pyridoxal-dependent decarboxylase, pyridoxal binding domain protein  78.89 
 
 		 359 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3392  ornithine decarboxylase  75.13 
 
 		 391 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000026968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0410  ornithine decarboxylase  73.2 
 
 		 391 aa  598  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4136  decarboxylase, pyridoxal-dependent  73.13 
 
 		 391 aa  593  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3075  diaminopimelate decarboxylase  72.42 
 
 		 391 aa  591  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000605202  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3507  ornithine decarboxylase  72.94 
 
 		 391 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00021864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0445  ornithine decarboxylase  72.68 
 
 		 391 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00713541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3405  diaminopimelate decarboxylase  72.42 
 
 		 391 aa  590  1e-168  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0541  diaminopimelate decarboxylase  72.35 
 
 		 391 aa  590  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0699456  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3682  ornithine decarboxylase  72.42 
 
 		 391 aa  590  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00110632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0489  Diaminopimelate decarboxylase  71.58 
 
 		 391 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000118387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0465  diaminopimelate decarboxylase  71.58 
 
 		 391 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3854  diaminopimelate decarboxylase  71.58 
 
 		 391 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000739123  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0486  diaminopimelate decarboxylase  71.58 
 
 		 391 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000602971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1416  ornithine decarboxylase  65.8 
 
 		 392 aa  535  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1109  pyridoxal-dependent family decarboxylase  62.5 
 
 		 389 aa  504  9.999999999999999e-143  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0037  ornithine decarboxylase  57.69 
 
 		 391 aa  480  1e-134  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0029  ornithine decarboxylase  56.92 
 
 		 391 aa  475  1e-133  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2177  ornithine decarboxylase  56.77 
 
 		 390 aa  461  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.024937  normal  0.209204 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0576  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  55.61 
 
 		 392 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3419  ornithine decarboxylase  51.89 
 
 		 380 aa  390  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.268803  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0924  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  51.52 
 
 		 380 aa  387  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.215223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4547  ornithine decarboxylase  50.96 
 
 		 380 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.727864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0856  ornithine decarboxylase  51.24 
 
 		 380 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0938  Ornithine decarboxylase  50.96 
 
 		 380 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3390  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  50.27 
 
 		 377 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3689  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  50.27 
 
 		 377 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192406  normal  0.735507 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2715  ornithine decarboxylase  50.41 
 
 		 377 aa  383  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3806  ornithine decarboxylase  49.34 
 
 		 377 aa  381  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.16357  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0100  ornithine/DAP/arginine decarboxylase family decarboxylase 2  51.79 
 
 		 377 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.938006  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3234  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  52.66 
 
 		 433 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4837  ornithine decarboxylase  50.69 
 
 		 380 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4245  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  51.51 
 
 		 377 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0092  ornithine/DAP/arginine decarboxylase family decarboxylase 2  51.79 
 
 		 377 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1090  pyridoxal-dependent decarboxylase  49.47 
 
 		 377 aa  372  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.41465  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1349  ornithine decarboxylase  50.96 
 
 		 380 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758302  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1157  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  49.45 
 
 		 376 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1080  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  48.94 
 
 		 376 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143277 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2140  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  48.14 
 
 		 376 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2772  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  49.34 
 
 		 377 aa  364  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4655  ornithine decarboxylase  48.91 
 
 		 388 aa  359  4e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.203932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5654  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  47.61 
 
 		 397 aa  358  8e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1649  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  46.92 
 
 		 388 aa  349  4e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.648031  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2045  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  47.03 
 
 		 388 aa  348  7e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2320  Ornithine decarboxylase  46.76 
 
 		 388 aa  347  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.724632  normal  0.55371 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0446  ornithine decarboxylase  47.45 
 
 		 390 aa  344  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0877313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2006  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  46.47 
 
 		 388 aa  343  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.447532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1693  ornithine decarboxylase  48.28 
 
 		 421 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2057  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  48.16 
 
 		 376 aa  338  8e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0801  ornithine decarboxylase  44.68 
 
 		 389 aa  328  1.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3110  ornithine decarboxylase  45.56 
 
 		 390 aa  326  5e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1375  ornithine decarboxylase  46.4 
 
 		 398 aa  318  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.291612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24620  ornithine decarboxylase  44.18 
 
 		 389 aa  317  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0684  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.48 
 
 		 393 aa  301  2e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1333  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  45.55 
 
 		 386 aa  296  6e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000335599  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0531  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.78 
 
 		 390 aa  293  3e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.077204  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5043  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.21 
 
 		 403 aa  291  9e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2180  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  42.58 
 
 		 376 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0693915  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0946  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  41.03 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000933718  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0924  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  41.03 
 
 		 388 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1510  Ornithine decarboxylase  40.78 
 
 		 400 aa  247  2e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000015857  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3803  Ornithine decarboxylase  35.04 
 
 		 392 aa  193  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.390604  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1964  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.79 
 
 		 391 aa  190  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2447  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.29 
 
 		 404 aa  161  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1046  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.68 
 
 		 397 aa  160  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.627883  normal  0.114267 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0879  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.12 
 
 		 379 aa  158  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0693  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.94 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2321  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.57 
 
 		 387 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671563  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0274  ornithine decarboxylase  30.34 
 
 		 398 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000805907  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90612  ornithine decarboxylase  27.91 
 
 		 458 aa  145  9e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.253647  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04890  ornithine decarboxylase, putative  29.06 
 
 		 527 aa  142  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.447794  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3089  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29 
 
 		 381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.334962 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03846  ornithine decarboxylase (Eurofung)  32.95 
 
 		 434 aa  139  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000212473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12642  ornithine decarboxylase 2  28.93 
 
 		 390 aa  138  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0701  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.76 
 
 		 381 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1991  putative ornithine decarboxylase  27.76 
 
 		 381 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2547  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2:Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.57 
 
 		 397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.211268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2895  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.52 
 
 		 382 aa  122  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000922142 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0258  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.01 
 
 		 420 aa  121  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0377  ornithine decarboxylase  28.5 
 
 		 417 aa  119  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.412388  normal  0.928081 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0318  diaminopimelate decarboxylase  27.13 
 
 		 394 aa  117  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.833211 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1461  diaminopimelate decarboxylase  28.86 
 
 		 421 aa  116  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1490  diaminopimelate decarboxylase  28.86 
 
 		 421 aa  116  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00291349  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1724  diaminopimelate decarboxylase  28.76 
 
 		 435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2027  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.09 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3656  diaminopimelate decarboxylase  28.83 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1847  diaminopimelate decarboxylase  28 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1713  diaminopimelate decarboxylase  28.57 
 
 		 417 aa  110  5e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>