148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2164 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2164  rhomboid family protein  100 
 
 		 290 aa  578  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2052  hypothetical protein  33.92 
 
 		 286 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00391881  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3791  rhomboid family protein  33.21 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24240  hypothetical protein  33.71 
 
 		 286 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00172141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2197  rhomboid-like protein  31.18 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1546  rhomboid family protein  33.21 
 
 		 295 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.546364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3728  rhomboid family protein  32.86 
 
 		 295 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34050  Rhomboid family membrane protease  35.06 
 
 		 281 aa  145  9e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2014  rhomboid family protein  32.5 
 
 		 295 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1574  rhomboid family protein  32.01 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1687  rhomboid-like protein  33.81 
 
 		 290 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205514  normal  0.563357 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1309  rhomboid-like protein  31.29 
 
 		 285 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0064  rhomboid-like protein  36.82 
 
 		 292 aa  129  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2942  rhomboid family protein  32.03 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00975184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4732  intramembrane serine protease GlpG  32.58 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03275  predicted intramembrane serine protease  32.58 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.989873  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0290  Rhomboid family protein  32.58 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03227  hypothetical protein  32.58 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3621  intramembrane serine protease GlpG  32.58 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0290  intramembrane serine protease GlpG  32.58 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3704  intramembrane serine protease GlpG  32.58 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.144478 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3900  intramembrane serine protease GlpG  32.58 
 
 		 276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3806  intramembrane serine protease GlpG  32.58 
 
 		 276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3903  rhomboid family protein  36.89 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000174103  normal  0.392188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4107  rhomboid family protein  36.89 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000304779  normal  0.532773 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2070  rhomboid family protein  43.24 
 
 		 224 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3995  rhomboid family protein  37.25 
 
 		 280 aa  116  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00110696  normal  0.0215487 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0098  rhomboid family protein  46.76 
 
 		 278 aa  116  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.351068  hitchhiker  0.00489186 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0055  rhomboid family protein  33.94 
 
 		 281 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000850289  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4288  Rhomboid family protein  33.79 
 
 		 281 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0527453  hitchhiker  0.00000054615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4343  rhomboid family protein  33.94 
 
 		 281 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172668  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3791  intramembrane serine protease GlpG  34.46 
 
 		 274 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4483  rhomboid family protein  33.79 
 
 		 281 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141048  hitchhiker  0.00806857 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3832  intramembrane serine protease GlpG  34.46 
 
 		 276 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.555662 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3894  intramembrane serine protease GlpG  34.46 
 
 		 276 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4671  glpG protein  42.86 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0104  rhomboid family protein  42.48 
 
 		 279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.465909  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3716  intramembrane serine protease GlpG  34.46 
 
 		 276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3725  intramembrane serine protease GlpG  34.46 
 
 		 274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0312  intramembrane serine protease GlpG  34.09 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3618  rhomboid-like protein  45.21 
 
 		 280 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000228786  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3904  rhomboid family protein  36.6 
 
 		 281 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00422303  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3467  membrane serine peptidase  28.76 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3712  rhomboid family protein  45.32 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00085785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3833  intramembrane serine protease GlpG  34.1 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.286062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4639  intramembrane serine protease GlpG  35.91 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3941  rhomboid family protein  44.44 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000502611  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4123  intramembrane serine protease GlpG  33.08 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002143  protein GlpG  29.93 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00412305  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2417  glpG protein  29.77 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140187  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0123  putative glpG protein  46.67 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3930  intramembrane serine protease GlpG  32.62 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3996  intramembrane serine protease GlpG  33.08 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3756  intramembrane serine protease GlpG  33.08 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0158  intramembrane serine protease GlpG  33.08 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0062  rhomboid family protein  39.13 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.015636  hitchhiker  0.000000313005 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00069  putative glpG protein  33.64 
 
 		 287 aa  105  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0095  glpG protein  37.17 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000920194  normal  0.0164253 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00275  peptidase  30.6 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2898  integral membrane protein  30.43 
 
 		 279 aa  103  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.345638  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1735  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 340 aa  94.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1385  Rhomboid family protein  33.73 
 
 		 293 aa  89  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.149194  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0230  intramembrane serine protease GlpG  31.96 
 
 		 280 aa  89  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.838462  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0162  rhomboid family GlpG protein  30.11 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562352  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  30.14 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  26.87 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  30.87 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  37.76 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  31.3 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  29.93 
 
 		 569 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  24.08 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  30.88 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0235  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  30 
 
 		 371 aa  57  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  24.88 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0883  rhomboid family protein  35.61 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  23.27 
 
 		 342 aa  55.5  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  27.96 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  27.81 
 
 		 487 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  27.81 
 
 		 487 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  27.86 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  28.48 
 
 		 396 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  27.03 
 
 		 486 aa  53.1  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  36.25 
 
 		 279 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  25.85 
 
 		 519 aa  51.2  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  23.45 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  28.36 
 
 		 227 aa  51.6  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  31.21 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  30.95 
 
 		 190 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  37.04 
 
 		 389 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0621  Rhomboid family protein  31.41 
 
 		 359 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.273052 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  30.28 
 
 		 513 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0283  rhomboid family protein  30.95 
 
 		 190 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  29.77 
 
 		 511 aa  50.1  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  30.28 
 
 		 541 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  27.59 
 
 		 360 aa  50.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3557  Rhomboid family protein  24.5 
 
 		 206 aa  49.7  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0917  rhomboid family protein  32.05 
 
 		 177 aa  48.5  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  31.25 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  29.59 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>