More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2118 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1125  ATP-dependent DNA helicase DinG  48.18 
 
 		 714 aa  660    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437588  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4120  ATP-dependent helicase, DinG family  48.26 
 
 		 714 aa  681    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1161  ATP-dependent DNA helicase DinG  48.18 
 
 		 714 aa  660    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3856  ATP-dependent DNA helicase DinG  48.12 
 
 		 714 aa  680    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160495  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1225  ATP-dependent DNA helicase DinG  47.98 
 
 		 714 aa  680    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19450  ATP-dependent DNA helicase DinG  49.93 
 
 		 714 aa  665    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2381  ATP-dependent DNA helicase DinG  47.24 
 
 		 720 aa  658    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980399 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1624  ATP-dependent DNA helicase DinG  47.12 
 
 		 721 aa  654    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2118  ATP-dependent DNA helicase DinG  100 
 
 		 707 aa  1464    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149773  hitchhiker  0.000000714427 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4290  ATP-dependent DNA helicase DinG  47.9 
 
 		 714 aa  657    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50840  ATP-dependent DNA helicase DinG  49.79 
 
 		 714 aa  696    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144938 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4334  ATP-dependent DNA helicase DinG  49.65 
 
 		 714 aa  692    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.044641  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1146  ATP-dependent DNA helicase DinG  48.95 
 
 		 714 aa  667    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.980909  normal  0.730569 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1427  ATP-dependent DNA helicase DinG  49.93 
 
 		 714 aa  694    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1585  ATP-dependent DNA helicase DinG  43.86 
 
 		 725 aa  598  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0995  ATP-dependent DNA helicase DinG  40.61 
 
 		 708 aa  488  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196461  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2272  ATP-dependent DNA helicase DinG  39.62 
 
 		 712 aa  476  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.57 
 
 		 691 aa  474  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003963  ATP-dependent helicase DinG/Rad3  38.39 
 
 		 691 aa  464  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1446  ATP-dependent DNA helicase DinG  39.14 
 
 		 703 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107544  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01557  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.97 
 
 		 691 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2656  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.35 
 
 		 690 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.765136  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2470  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.59 
 
 		 690 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2538  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.59 
 
 		 690 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.536241  unclonable  0.0000322681 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.73 
 
 		 690 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.920562  hitchhiker  0.00302525 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.31 
 
 		 692 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.08 
 
 		 690 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0350  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.19 
 
 		 711 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00468076  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.89 
 
 		 690 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.64 
 
 		 690 aa  451  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.89 
 
 		 690 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1129  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.19 
 
 		 694 aa  451  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0640459  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.89 
 
 		 690 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1513  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.39 
 
 		 690 aa  451  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433839  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.89 
 
 		 690 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.02 
 
 		 692 aa  452  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000620367 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.74 
 
 		 691 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.81 
 
 		 691 aa  443  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2178  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.44 
 
 		 686 aa  437  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3854  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.47 
 
 		 700 aa  413  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2033  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.52 
 
 		 716 aa  384  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1289  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.82 
 
 		 725 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.649523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02825  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.9 
 
 		 710 aa  376  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0969  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.35 
 
 		 714 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0021  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.63 
 
 		 692 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0014  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.83 
 
 		 729 aa  371  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11513  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0916  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.07 
 
 		 714 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.21 
 
 		 714 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4158  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.69 
 
 		 758 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0884  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.07 
 
 		 714 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0857  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.21 
 
 		 714 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0866  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.7 
 
 		 716 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2910  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.44 
 
 		 699 aa  362  1e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00766  ATP-dependent DNA helicase  35.56 
 
 		 716 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2843  helicase c2  35.56 
 
 		 716 aa  360  3e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00783  hypothetical protein  35.56 
 
 		 716 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0823  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.56 
 
 		 716 aa  361  3e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.43 
 
 		 762 aa  359  9e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2553  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.29 
 
 		 716 aa  359  9.999999999999999e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0853  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.43 
 
 		 716 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2844  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.43 
 
 		 716 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0506897 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0013  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.08 
 
 		 741 aa  357  5.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1552  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.71 
 
 		 699 aa  357  5.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2732  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.66 
 
 		 738 aa  355  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.196414  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1461  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.3 
 
 		 732 aa  355  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.498771 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0503  helicase c2  34.42 
 
 		 750 aa  348  1e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.516825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2495  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.12 
 
 		 701 aa  346  8e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2398  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.66 
 
 		 715 aa  345  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.927767  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2856  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.14 
 
 		 726 aa  344  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.642331  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2777  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.14 
 
 		 726 aa  344  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1321  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.01 
 
 		 726 aa  343  5.999999999999999e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3670  helicase c2  29.8 
 
 		 664 aa  297  6e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.978483  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  29.69 
 
 		 876 aa  260  6e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  28.59 
 
 		 832 aa  258  4e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  29.29 
 
 		 840 aa  256  7e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  29.93 
 
 		 843 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  30.32 
 
 		 660 aa  252  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  29.54 
 
 		 659 aa  242  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  28.71 
 
 		 851 aa  242  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  28.67 
 
 		 838 aa  239  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  28.15 
 
 		 636 aa  239  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  28.88 
 
 		 636 aa  237  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  28.45 
 
 		 636 aa  236  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  28.45 
 
 		 636 aa  236  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  28.45 
 
 		 636 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  28.99 
 
 		 636 aa  236  9e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  28.99 
 
 		 636 aa  236  9e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  28.99 
 
 		 636 aa  236  9e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  28.99 
 
 		 636 aa  236  9e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  28.99 
 
 		 636 aa  236  9e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  28.99 
 
 		 636 aa  236  9e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  28.99 
 
 		 636 aa  236  9e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  28.45 
 
 		 636 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  29.48 
 
 		 646 aa  236  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  28.67 
 
 		 843 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  29.03 
 
 		 636 aa  234  5e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  26.6 
 
 		 822 aa  234  5e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  29.61 
 
 		 636 aa  233  6e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  28.84 
 
 		 636 aa  233  9e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  29.06 
 
 		 929 aa  233  9e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>