296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2105 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2105  exsB protein  100 
 
 
219 aa  457  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266539 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2961  exsB protein  69.27 
 
 
218 aa  331  5e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2885  exsB protein  68.81 
 
 
218 aa  328  6e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.937408  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02725  putative regulator protein  66.97 
 
 
218 aa  319  1.9999999999999998e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0106  exsB protein  64.22 
 
 
221 aa  313  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1099  exsB protein  65.3 
 
 
221 aa  310  7.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119388  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2038  ExsB  61.29 
 
 
251 aa  289  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2937  exsB protein  59.72 
 
 
219 aa  286  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.019832  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1097  exsB protein  52.56 
 
 
217 aa  256  3e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.176063  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0191  exsB protein  53.95 
 
 
221 aa  251  5.000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4185  exsB protein  41.94 
 
 
233 aa  205  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00303394  normal  0.206688 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  45.05 
 
 
237 aa  198  3.9999999999999996e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1897  exsB protein  41.01 
 
 
232 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1972  exsB protein  41.01 
 
 
232 aa  192  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3719  succinoglycan biosynthesis regulator  41.01 
 
 
235 aa  191  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.351493  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3493  exsB protein  41.94 
 
 
236 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1010  exsB protein  41.47 
 
 
232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1885  exsB protein  43.26 
 
 
223 aa  187  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4939  exsB protein  41.01 
 
 
236 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.232618  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2420  exsB protein  42.79 
 
 
243 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.107202 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3788  exsB protein  41.01 
 
 
236 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2047  ExsB  39.81 
 
 
233 aa  186  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0861  exsB protein  43.69 
 
 
220 aa  181  5.0000000000000004e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4053  exsB protein  40.09 
 
 
232 aa  181  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0436  exsB protein  40.54 
 
 
228 aa  176  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0043011  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1288  exsB protein  43.36 
 
 
226 aa  174  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158784  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3693  exsB protein  40.97 
 
 
225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3788  exsB protein  40.53 
 
 
225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2982  putative transcriptional regulator  40.27 
 
 
230 aa  170  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  39.73 
 
 
224 aa  168  5e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4046  exsB protein  38.5 
 
 
228 aa  168  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.346738  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  41.67 
 
 
227 aa  168  6e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4380  exsB protein  39.04 
 
 
229 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1310  exsB protein  38.07 
 
 
220 aa  164  6.9999999999999995e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3075  ExsB  40.27 
 
 
237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520876  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  42.53 
 
 
220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  38.6 
 
 
484 aa  161  7e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4532  hypothetical protein  40.18 
 
 
224 aa  161  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51670  hypothetical protein  40.18 
 
 
224 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000703334  hitchhiker  0.000657127 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1957  ExsB  37.61 
 
 
241 aa  159  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115438  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  39.46 
 
 
227 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  39.01 
 
 
226 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  39.91 
 
 
224 aa  159  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  39.46 
 
 
222 aa  159  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  40.09 
 
 
222 aa  157  9e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0483  exsB protein  38.5 
 
 
237 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  37.72 
 
 
229 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  37.22 
 
 
228 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  38.64 
 
 
221 aa  156  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  40.09 
 
 
251 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1207  exsB protein  38.39 
 
 
223 aa  156  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000226628  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  40.44 
 
 
222 aa  156  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  38.05 
 
 
224 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2225  ExsB ATPase  40.09 
 
 
229 aa  156  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  39.45 
 
 
243 aa  155  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3115  exsB protein  38.57 
 
 
221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543639  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3059  exsB protein  40.09 
 
 
229 aa  155  6e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  36.94 
 
 
233 aa  155  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808637  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1984  exsB protein  37.61 
 
 
234 aa  155  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1618  hypothetical protein  37.73 
 
 
222 aa  154  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2945  hypothetical protein  37.78 
 
 
228 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0798  ExsB  35.68 
 
 
226 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126082  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  37.61 
 
 
224 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2799  hypothetical protein  37.78 
 
 
228 aa  153  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2362  ExsB  40.18 
 
 
227 aa  153  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000048435  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0496  exsB protein  34.82 
 
 
228 aa  153  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2335  ExsB  37.78 
 
 
229 aa  153  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000753404  normal  0.063598 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  36.73 
 
 
224 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0731  exsB protein  36.73 
 
 
224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.372152  normal  0.140663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  37.61 
 
 
224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  38.84 
 
 
230 aa  152  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0998  exsB protein  37.22 
 
 
230 aa  152  4e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.519707  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0738  putative signal peptide protein  36.56 
 
 
224 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593438  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  37.22 
 
 
229 aa  151  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0149  ExsB  37.33 
 
 
224 aa  150  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5203  exsB protein  38.26 
 
 
229 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1107  transcriptional regulator  37.22 
 
 
230 aa  150  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000696721  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1942  exsB protein  36.12 
 
 
244 aa  150  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.243954  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0272  exsB protein  36.24 
 
 
246 aa  149  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.281019  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2672  ExsB  35.68 
 
 
227 aa  147  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00821244  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0068  exsB protein  37.28 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0069  exsB protein  37.28 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.955333 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  36.61 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228539  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36600  ExsB protein  38.39 
 
 
224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  36.16 
 
 
225 aa  146  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4042  ExsB  36.84 
 
 
225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2710  ExsB  36.16 
 
 
232 aa  145  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0499  exsB protein  35.62 
 
 
226 aa  145  6e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00135935  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12660  exsB protein  38.7 
 
 
240 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0539  exsB protein  37.27 
 
 
235 aa  144  9e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1233  exsB protein  36.44 
 
 
223 aa  144  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.583286  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3856  exsB protein  38.33 
 
 
234 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3942  exsB protein  38.33 
 
 
234 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0108234  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01572  ExsB protein  36.32 
 
 
224 aa  143  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.779183  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3799  ExsB protein  38.33 
 
 
234 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4644  ExsB  39.37 
 
 
257 aa  141  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3062  exsB protein  40.09 
 
 
231 aa  141  9e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0838  exsB protein  35.29 
 
 
258 aa  141  9e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34404  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1766  exsB protein  36.05 
 
 
256 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  34.98 
 
 
226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>