247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2101 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 
466 aa  914    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  61.12 
 
 
464 aa  549  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  54.89 
 
 
470 aa  498  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  56.98 
 
 
486 aa  495  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  52.21 
 
 
486 aa  478  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  54.07 
 
 
464 aa  465  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  51.45 
 
 
452 aa  458  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  51.24 
 
 
452 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  54 
 
 
452 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  48.56 
 
 
453 aa  430  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  48.64 
 
 
446 aa  426  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  49.35 
 
 
461 aa  427  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  52.05 
 
 
451 aa  422  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  47.96 
 
 
457 aa  423  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  48.08 
 
 
450 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  47.65 
 
 
450 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  49.22 
 
 
452 aa  414  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  49.24 
 
 
461 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  51.67 
 
 
453 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  50.11 
 
 
455 aa  405  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4202  Sodium:neurotransmitter symporter  45.34 
 
 
478 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  44.03 
 
 
467 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  47.1 
 
 
467 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  46.53 
 
 
454 aa  376  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  44.42 
 
 
457 aa  375  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  46.09 
 
 
450 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4514  sodium-dependent transporter, putative  45.12 
 
 
467 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  46.09 
 
 
449 aa  365  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  43.12 
 
 
453 aa  351  1e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0271  sodium/proline symporter  42.13 
 
 
463 aa  348  1e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639807  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  42.42 
 
 
452 aa  342  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0741  sodium:neurotransmitter symporter  41.43 
 
 
463 aa  340  2e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.649809  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  44.9 
 
 
459 aa  338  9e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  43.08 
 
 
453 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0400  sodium:neurotransmitter symporter  43.72 
 
 
446 aa  335  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  42.32 
 
 
456 aa  330  3e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  40.87 
 
 
455 aa  329  6e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  40.87 
 
 
455 aa  327  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  39.87 
 
 
453 aa  327  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  40.47 
 
 
465 aa  323  5e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  42.44 
 
 
476 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  42.53 
 
 
450 aa  322  9.999999999999999e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3971  sodium:neurotransmitter symporter  42.43 
 
 
452 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.385097 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  38.34 
 
 
446 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  38.57 
 
 
446 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  38.34 
 
 
446 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  38.57 
 
 
446 aa  312  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  38.12 
 
 
446 aa  312  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  38.12 
 
 
446 aa  312  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  38.34 
 
 
446 aa  310  5e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  39.29 
 
 
453 aa  310  5e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  38.57 
 
 
446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  38.34 
 
 
446 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  40.52 
 
 
468 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  38.57 
 
 
446 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  40.88 
 
 
460 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  42.59 
 
 
456 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  37.89 
 
 
446 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  42.38 
 
 
445 aa  301  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  42.15 
 
 
445 aa  300  4e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  42.38 
 
 
445 aa  300  5e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  42.38 
 
 
445 aa  300  5e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  42.15 
 
 
445 aa  300  5e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  42.15 
 
 
445 aa  299  6e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  41.93 
 
 
445 aa  298  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  42.15 
 
 
445 aa  298  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  41.96 
 
 
447 aa  294  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  41.43 
 
 
475 aa  291  1e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  41.96 
 
 
447 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  38.44 
 
 
461 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  41.32 
 
 
449 aa  289  6e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  40.98 
 
 
445 aa  288  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  37.56 
 
 
454 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4776  sodium:neurotransmitter symporter  36.11 
 
 
459 aa  285  8e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0479599 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  34.74 
 
 
454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  38.65 
 
 
443 aa  281  2e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3113  sodium:neurotransmitter symporter  38.59 
 
 
468 aa  280  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  36.06 
 
 
458 aa  280  3e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3840  sodium:neurotransmitter symporter  39.16 
 
 
486 aa  280  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  39.17 
 
 
455 aa  279  9e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  35.57 
 
 
457 aa  272  8.000000000000001e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  35.27 
 
 
454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  39.01 
 
 
452 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  38.79 
 
 
451 aa  268  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  34.6 
 
 
447 aa  267  2.9999999999999995e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  35.81 
 
 
470 aa  267  4e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  38.2 
 
 
452 aa  266  7e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  34.71 
 
 
469 aa  265  1e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  36.25 
 
 
484 aa  265  2e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0461  sodium:neurotransmitter symporter  35.67 
 
 
462 aa  264  3e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  37.98 
 
 
451 aa  264  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  34.23 
 
 
450 aa  264  3e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  37.98 
 
 
452 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  37.98 
 
 
452 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  37.98 
 
 
452 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0854  sodium:neurotransmitter symporter  35.38 
 
 
461 aa  262  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226539  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1818  sodium-dependent transporter  35.19 
 
 
458 aa  262  1e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000435894  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  32.96 
 
 
454 aa  261  2e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1484  putative sodium-dependent transporter  38.43 
 
 
452 aa  260  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00118732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3860  sodium-dependent tryptophan transporter  38.65 
 
 
452 aa  259  8e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141824  hitchhiker  0.0000000110845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>